More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3389 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3389  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  100 
 
 
286 aa  556  1e-157  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2774  xanthine dehydrogenase, FAD-binding protein, putative  67.61 
 
 
291 aa  371  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2539  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  65.26 
 
 
287 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0444448  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1334  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  71.13 
 
 
295 aa  366  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332436 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4736  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  70.36 
 
 
296 aa  360  1e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2836  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding protein  63.76 
 
 
289 aa  347  1e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0853655  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2224  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  58.39 
 
 
289 aa  323  2e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.844941  hitchhiker  0.000850669 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5969  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  41.52 
 
 
275 aa  158  9e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.862592  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1453  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  41.45 
 
 
461 aa  155  6e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2153  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  33.22 
 
 
292 aa  149  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.891805 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1738  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  32.67 
 
 
305 aa  149  6e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2448  xanthine dehydrogenase, small subunit  36.97 
 
 
507 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1819  medium FAD-binding subunit of molybdenum enzyme  34.04 
 
 
280 aa  144  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3102  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  36.62 
 
 
507 aa  140  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.238239  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5684  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  43.36 
 
 
299 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308299  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2603  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  38.35 
 
 
468 aa  129  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0836  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  39.92 
 
 
304 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1474  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  34.36 
 
 
570 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0259  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  36 
 
 
514 aa  125  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4157  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  30.58 
 
 
292 aa  122  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.533292 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3000  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  30.58 
 
 
292 aa  122  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2413  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  33.58 
 
 
276 aa  122  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02700  xanthine dehydrogenase, FAD-binding subunit  30.58 
 
 
292 aa  122  8e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0825  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  30.58 
 
 
292 aa  122  8e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3027  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  30.58 
 
 
292 aa  122  8e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0841  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  30.58 
 
 
292 aa  122  8e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02662  hypothetical protein  30.58 
 
 
292 aa  122  8e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1130  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  37.63 
 
 
507 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.16283  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3192  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  30.22 
 
 
292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4005  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  33.56 
 
 
287 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218277  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1137  dehydrogenase  32.27 
 
 
282 aa  119  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1512  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  38.38 
 
 
282 aa  119  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2837  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  33.22 
 
 
288 aa  119  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2833  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  32.85 
 
 
492 aa  119  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5750  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  37.11 
 
 
284 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.436516  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2699  xanthine dehydrogenase small subunit  30.45 
 
 
499 aa  119  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0451  xanthine dehydrogenase small subunit  32.49 
 
 
496 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608502  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0920  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  34.19 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.815419  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0777  xanthine dehydrogenase, FAD-binding protein, putative  34.19 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1788  xanthine dehydrogenase, small subunit  37.22 
 
 
467 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.350368  normal  0.377628 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2010  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  34.56 
 
 
284 aa  116  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0433  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  32.37 
 
 
450 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.649108  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4317  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  34.15 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1035  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  32.85 
 
 
506 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.22588  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1959  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  30.31 
 
 
294 aa  113  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.233255 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2861  xanthine dehydrogenase, small subunit  31.41 
 
 
488 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0406506  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5517  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  36.64 
 
 
284 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1956  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  35.29 
 
 
295 aa  112  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0844554 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0950  xanthine dehydrogenase, subunit A  35.07 
 
 
543 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0594  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  34.04 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4104  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  37.54 
 
 
289 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1423  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  28.22 
 
 
295 aa  110  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1571  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  33.92 
 
 
300 aa  109  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118942  normal  0.376201 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3133  xanthine dehydrogenase, small subunit  30.32 
 
 
488 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207802  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2232  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  32.64 
 
 
288 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.894157  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0365  xanthine dehydrogenase, small subunit  31.46 
 
 
492 aa  108  9.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3041  xanthine dehydrogenase, small subunit  34.08 
 
 
515 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0266852 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1636  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  37.31 
 
 
490 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1733  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  28.22 
 
 
292 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4711  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  35.84 
 
 
306 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.728749  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_004310  BR0349  xanthine dehydrogenase, putative  31.46 
 
 
492 aa  106  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0728  xanthine dehydrogenase, small subunit  31.54 
 
 
527 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0348  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.54 
 
 
528 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0658875  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2424  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  28.42 
 
 
480 aa  106  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0832  2Fe-2S ferredoxin, iron-sulfur binding site  31.54 
 
 
528 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3720  xanthine dehydrogenase, small subunit  31.41 
 
 
493 aa  106  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2772  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  30.22 
 
 
283 aa  106  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137285  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2425  ferredoxin:molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:(2Fe-2S)-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  30.94 
 
 
500 aa  105  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0771886  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0711  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.54 
 
 
520 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0767  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  30.05 
 
 
281 aa  105  8e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00225703 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3759  xanthine dehydrogenase small subunit  39.46 
 
 
467 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0804  xanthine dehydrogenase, small subunit  31.18 
 
 
523 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1013  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  27.83 
 
 
327 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.815839 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2552  xanthine dehydrogenase, small subunit  31.54 
 
 
526 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.865646 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4236  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  34.03 
 
 
285 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0193  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  34.95 
 
 
273 aa  102  5e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2134  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:CO dehydrogenase flavoprotein-like  31.97 
 
 
289 aa  102  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1982  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  37.71 
 
 
281 aa  103  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.69228  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3924  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  30.47 
 
 
516 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3460  xanthine dehydrogenase, small subunit  32.49 
 
 
530 aa  102  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.266307 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4499  xanthine dehydrogenase small subunit  31.2 
 
 
496 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.999061  normal  0.0980927 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0029  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  28.67 
 
 
288 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.275591 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1339  xanthine dehydrogenase, small subunit  33.57 
 
 
501 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00017372  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4273  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  35.44 
 
 
271 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3968  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  33.1 
 
 
284 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1322  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  26.98 
 
 
276 aa  100  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4864  xanthine dehydrogenase, iron-sulfur binding subunit  25.76 
 
 
494 aa  99.8  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2176  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  35.33 
 
 
275 aa  100  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1784  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.33 
 
 
272 aa  99.8  5e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5002  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  32.14 
 
 
512 aa  99.4  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2704  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.6 
 
 
487 aa  99  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22290  xanthine dehydrogenase, small subunit  31.52 
 
 
496 aa  99  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02515  putative xanthine dehydrogenase, XdhA subunit  29.56 
 
 
480 aa  98.6  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2680  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  27.87 
 
 
290 aa  98.6  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0849  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  32.73 
 
 
270 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1246  Hydantoinase B/oxoprolinase  35.96 
 
 
845 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446767  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0893  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  29.71 
 
 
498 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.366411  normal  0.919592 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0415  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  29.31 
 
 
284 aa  98.6  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3554  xanthine dehydrogenase, small subunit  33.81 
 
 
485 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0860  xanthine dehydrogenase, small subunit  28.67 
 
 
504 aa  97.4  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>