More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2772 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2772  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  100 
 
 
283 aa  579  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137285  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1819  medium FAD-binding subunit of molybdenum enzyme  42.6 
 
 
280 aa  196  5.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2153  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  41.28 
 
 
292 aa  169  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.891805 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2010  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  39.48 
 
 
284 aa  168  7e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2413  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  38.24 
 
 
276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4005  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  39.34 
 
 
287 aa  163  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218277  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1738  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  35.13 
 
 
305 aa  161  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5969  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  36.26 
 
 
275 aa  157  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.862592  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2134  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:CO dehydrogenase flavoprotein-like  36.46 
 
 
289 aa  142  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2836  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding protein  35.69 
 
 
289 aa  142  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0853655  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1733  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  31.27 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1512  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  35.13 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2837  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  33.09 
 
 
288 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3074  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  32.01 
 
 
294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1137  dehydrogenase  34.17 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1959  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  32.23 
 
 
294 aa  129  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.233255 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2680  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  33.71 
 
 
290 aa  128  9.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4157  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  31.54 
 
 
292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.533292 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1444  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.09 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3192  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  30.77 
 
 
292 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0415  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  33.57 
 
 
284 aa  125  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3000  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  31.15 
 
 
292 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0433  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  31.02 
 
 
450 aa  124  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.649108  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0448  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  30.11 
 
 
282 aa  123  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.221209  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02700  xanthine dehydrogenase, FAD-binding subunit  30.77 
 
 
292 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0825  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  30.77 
 
 
292 aa  123  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02662  hypothetical protein  30.77 
 
 
292 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0920  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  31.16 
 
 
288 aa  123  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.815419  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0841  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  30.77 
 
 
292 aa  123  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3027  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  30.77 
 
 
292 aa  123  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0777  xanthine dehydrogenase, FAD-binding protein, putative  31.16 
 
 
288 aa  123  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0609  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  30.77 
 
 
278 aa  122  6e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.515011  normal  0.94537 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1676  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  33.59 
 
 
301 aa  122  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.991973  normal  0.682256 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2002  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  31.15 
 
 
290 aa  121  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.328506 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2646  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  32.83 
 
 
283 aa  121  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1218  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  29.79 
 
 
296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0480065 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1322  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  30.29 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4273  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  32.56 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1453  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  34.2 
 
 
461 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2539  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  32.5 
 
 
287 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0444448  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2699  xanthine dehydrogenase small subunit  31.05 
 
 
499 aa  120  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0643  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  31.3 
 
 
287 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0238  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  31.3 
 
 
278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0259  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  35.06 
 
 
514 aa  119  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1956  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.23 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0844554 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2144  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  31.56 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2603  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  34.52 
 
 
468 aa  117  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0029  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  32.6 
 
 
288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.275591 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0767  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  31.85 
 
 
281 aa  113  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00225703 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1035  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  30.55 
 
 
506 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.22588  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4236  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  30.71 
 
 
285 aa  112  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4257  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  29.8 
 
 
481 aa  112  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2185  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  30.29 
 
 
292 aa  112  9e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.27538  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2224  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  30.99 
 
 
289 aa  112  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.844941  hitchhiker  0.000850669 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4923  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  30.71 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.514646  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3595  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  29.64 
 
 
288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232061  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3872  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  29.59 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1167  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  28.78 
 
 
287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3660  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  30.71 
 
 
484 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807153  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2230  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  31.5 
 
 
291 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2774  xanthine dehydrogenase, FAD-binding protein, putative  31.43 
 
 
291 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0451  xanthine dehydrogenase small subunit  32.08 
 
 
496 aa  108  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608502  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0974  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  31.44 
 
 
286 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00101197  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1423  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  30.55 
 
 
295 aa  108  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0530  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  29.63 
 
 
289 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0076  putative carbon monoxide dehydrogenase medium subunit  31.17 
 
 
286 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2833  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.39 
 
 
492 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1562  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  28.73 
 
 
289 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.915322 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0594  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  28.06 
 
 
283 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4317  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  27.27 
 
 
286 aa  106  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3102  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  30.04 
 
 
507 aa  107  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.238239  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3041  xanthine dehydrogenase, small subunit  34.78 
 
 
515 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0266852 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1334  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  29.39 
 
 
295 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332436 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2764  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  30.4 
 
 
291 aa  106  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0000220689  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0713  xanthine dehydrogenase, small subunit  31.62 
 
 
512 aa  106  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3389  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  30.22 
 
 
286 aa  106  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3720  xanthine dehydrogenase, small subunit  30.27 
 
 
493 aa  105  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0889  glyceraldehyde oxidoreductase medium chain  31.5 
 
 
271 aa  105  8e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1946  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.3 
 
 
263 aa  105  8e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00353773  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1982  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  34.39 
 
 
281 aa  105  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.69228  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4864  xanthine dehydrogenase, iron-sulfur binding subunit  30.28 
 
 
494 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1246  Hydantoinase B/oxoprolinase  34.97 
 
 
845 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446767  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0299  glyceraldehyde oxidoreductase medium chain  30.8 
 
 
280 aa  103  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2704  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  28.62 
 
 
487 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4104  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  28.07 
 
 
289 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3730  putative carbon monoxide dehydrogenase medium subunit, coxM-like protein  34.24 
 
 
286 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2861  xanthine dehydrogenase, small subunit  29.04 
 
 
488 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0406506  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1788  xanthine dehydrogenase, small subunit  33.45 
 
 
467 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.350368  normal  0.377628 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3133  xanthine dehydrogenase, small subunit  28.78 
 
 
488 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207802  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22290  xanthine dehydrogenase, small subunit  31.6 
 
 
496 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4663  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  29.1 
 
 
276 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795711  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2448  xanthine dehydrogenase, small subunit  29.3 
 
 
507 aa  102  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3759  xanthine dehydrogenase small subunit  32.2 
 
 
467 aa  102  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0222  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  29.23 
 
 
292 aa  102  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.811144  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2300  xanthine dehydrogenase small subunit  33.46 
 
 
476 aa  102  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.289203  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0950  xanthine dehydrogenase, subunit A  32.97 
 
 
543 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0552  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  30.51 
 
 
288 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2023  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  29.86 
 
 
272 aa  100  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3948  hypothetical protein  31.88 
 
 
485 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.804932  normal  0.121566 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1502  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.85 
 
 
287 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>