More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5750 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008392  Bamb_5750  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  100 
 
 
284 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.436516  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5517  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  95.07 
 
 
284 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0920  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  35.69 
 
 
288 aa  133  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.815419  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0777  xanthine dehydrogenase, FAD-binding protein, putative  35.69 
 
 
288 aa  133  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3389  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  37.11 
 
 
286 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1819  medium FAD-binding subunit of molybdenum enzyme  33.33 
 
 
280 aa  123  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2413  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  37.08 
 
 
276 aa  122  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1738  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  27.8 
 
 
305 aa  122  8e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2774  xanthine dehydrogenase, FAD-binding protein, putative  36.7 
 
 
291 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2010  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  34.47 
 
 
284 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4736  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  37.33 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2836  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding protein  33.22 
 
 
289 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0853655  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1334  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  35.81 
 
 
295 aa  115  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332436 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1982  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  36.39 
 
 
281 aa  115  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.69228  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1733  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  28.8 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2224  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  33.67 
 
 
289 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.844941  hitchhiker  0.000850669 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1512  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  34.09 
 
 
282 aa  113  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1423  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  29.58 
 
 
295 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2833  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.37 
 
 
492 aa  112  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3872  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  33.8 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1130  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  34.58 
 
 
507 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.16283  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3102  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.7 
 
 
507 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.238239  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2539  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  32.31 
 
 
287 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0444448  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2699  xanthine dehydrogenase small subunit  32.28 
 
 
499 aa  109  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2153  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  31.22 
 
 
292 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.891805 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0451  xanthine dehydrogenase small subunit  30.86 
 
 
496 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608502  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1453  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  33.33 
 
 
461 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1339  xanthine dehydrogenase, small subunit  37.01 
 
 
501 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00017372  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1959  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  32.04 
 
 
294 aa  106  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.233255 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4157  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  31.18 
 
 
292 aa  105  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.533292 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2448  xanthine dehydrogenase, small subunit  33.33 
 
 
507 aa  105  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02700  xanthine dehydrogenase, FAD-binding subunit  31.18 
 
 
292 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0825  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  31.18 
 
 
292 aa  104  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02662  hypothetical protein  31.18 
 
 
292 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5969  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  36.43 
 
 
275 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.862592  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3027  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  31.18 
 
 
292 aa  104  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0841  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  31.18 
 
 
292 aa  104  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3000  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  31.18 
 
 
292 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2861  xanthine dehydrogenase, small subunit  30.94 
 
 
488 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0406506  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3320  xanthine dehydrogenase  31.62 
 
 
490 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151633  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0713  xanthine dehydrogenase, small subunit  34.73 
 
 
512 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0259  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  35 
 
 
514 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3192  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  30.82 
 
 
292 aa  102  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5002  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.94 
 
 
512 aa  102  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3759  xanthine dehydrogenase small subunit  35.34 
 
 
467 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3133  xanthine dehydrogenase, small subunit  32.3 
 
 
488 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207802  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0767  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  30.83 
 
 
281 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00225703 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0950  xanthine dehydrogenase, subunit A  33.59 
 
 
543 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3041  xanthine dehydrogenase, small subunit  33.33 
 
 
515 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0266852 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0530  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  33.45 
 
 
289 aa  99  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0365  xanthine dehydrogenase, small subunit  30.48 
 
 
492 aa  99  9e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0349  xanthine dehydrogenase, putative  30.48 
 
 
492 aa  98.2  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0552  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  34.4 
 
 
288 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0974  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  34.45 
 
 
286 aa  97.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00101197  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2704  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.44 
 
 
487 aa  97.8  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2425  ferredoxin:molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:(2Fe-2S)-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  33.83 
 
 
500 aa  96.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0771886  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2646  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  30.57 
 
 
283 aa  96.3  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1035  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  29.59 
 
 
506 aa  95.9  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.22588  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2185  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  28.29 
 
 
292 aa  95.5  8e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.27538  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4620  xanthine dehydrogenase small subunit  30.22 
 
 
493 aa  94.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.546493 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1788  xanthine dehydrogenase, small subunit  30.27 
 
 
467 aa  94  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.350368  normal  0.377628 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2772  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  29.46 
 
 
283 aa  93.6  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137285  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0433  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  31.14 
 
 
450 aa  93.2  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.649108  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5910  xanthine dehydrogenase, small subunit  30.32 
 
 
537 aa  93.6  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3720  xanthine dehydrogenase, small subunit  29.09 
 
 
493 aa  92.8  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1525  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  30.47 
 
 
278 aa  92.4  8e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4278  xanthine dehydrogenase, XdhA subunit  29.74 
 
 
484 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.513605  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3907  xanthine dehydrogenase, small subunit  30.58 
 
 
542 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4864  xanthine dehydrogenase, iron-sulfur binding subunit  29.12 
 
 
494 aa  90.5  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1590  xanthine dehydrogenase, small subunit  29.37 
 
 
484 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.597851 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1246  Hydantoinase B/oxoprolinase  34.87 
 
 
845 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446767  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0499  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  29.23 
 
 
467 aa  90.1  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.258857 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22290  xanthine dehydrogenase, small subunit  30.83 
 
 
496 aa  89.7  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4257  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.07 
 
 
481 aa  89.7  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0893  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  31.87 
 
 
498 aa  89.4  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.366411  normal  0.919592 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2424  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  26.3 
 
 
480 aa  89.4  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3948  hypothetical protein  30.18 
 
 
485 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.804932  normal  0.121566 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02515  putative xanthine dehydrogenase, XdhA subunit  27.94 
 
 
480 aa  88.2  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0609  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  30.34 
 
 
278 aa  88.6  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.515011  normal  0.94537 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2751  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  27.8 
 
 
479 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0433722  normal  0.51663 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2837  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  30.65 
 
 
288 aa  88.2  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3842  xanthine dehydrogenase, small subunit  29.37 
 
 
484 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.977655  normal  0.775119 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2603  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.35 
 
 
468 aa  88.6  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1797  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  29.62 
 
 
484 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.014868  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2422  xanthine dehydrogenase, small subunit  33.21 
 
 
505 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2144  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  31.49 
 
 
288 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44710  xanthine dehydrogenase  30.48 
 
 
484 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0199275 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3208  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  43.65 
 
 
291 aa  87  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.426898  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5185  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  36.32 
 
 
297 aa  87  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.192099 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4273  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.58 
 
 
271 aa  87.4  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3460  xanthine dehydrogenase, small subunit  30.68 
 
 
530 aa  87.4  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.266307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3809  xanthine dehydrogenase  29.29 
 
 
484 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4499  xanthine dehydrogenase small subunit  30.07 
 
 
496 aa  86.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.999061  normal  0.0980927 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2176  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.69 
 
 
275 aa  86.7  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3660  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  27.5 
 
 
484 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807153  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1155  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  34.89 
 
 
518 aa  85.9  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.874334  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3730  putative carbon monoxide dehydrogenase medium subunit, coxM-like protein  32.85 
 
 
286 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2095  putative xanthine dehydrogenase (subunit A) oxidoreductase protein  33.33 
 
 
516 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1571  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  33.33 
 
 
300 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118942  normal  0.376201 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3604  xanthine dehydrogenase, small subunit  27.51 
 
 
484 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.703198  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>