30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1621 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1621  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  565  1e-160  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.238182 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2995  hypothetical protein  36.09 
 
 		 266 aa  112  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.333747  normal  0.629228 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0055  protein of unknown function DUF721  33.22 
 
 		 271 aa  95.5  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  25.25 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2875  hypothetical protein  36.3 
 
 		 162 aa  67  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0140441  hitchhiker  0.0000188483 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  34.25 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  33.56 
 
 		 151 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  30.52 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0004  hypothetical protein  28.57 
 
 		 96 aa  55.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.132864 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  31.25 
 
 		 152 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2445  hypothetical protein  34.46 
 
 		 156 aa  49.3  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000048803  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0003  hypothetical protein  32.98 
 
 		 97 aa  49.3  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179596  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0095  Zn-ribbon-containing protein  36.36 
 
 		 101 aa  48.9  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142092  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1258  hypothetical protein  36 
 
 		 169 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0095  hypothetical protein  34.85 
 
 		 101 aa  47.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.437017  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3502  protein of unknown function DUF721  33.33 
 
 		 170 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.428989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  31.62 
 
 		 134 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0004  protein of unknown function DUF721  36.46 
 
 		 105 aa  46.6  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2306  protein of unknown function DUF721  25.84 
 
 		 175 aa  46.2  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1102  hypothetical protein  30.58 
 
 		 155 aa  45.8  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000565832  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1572  protein of unknown function DUF721  25.62 
 
 		 194 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1595  protein of unknown function DUF721  25.62 
 
 		 194 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.215209 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0004  hypothetical protein  25.56 
 
 		 97 aa  45.8  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0004  hypothetical protein  26.6 
 
 		 97 aa  45.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.52078  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0612  protein of unknown function DUF721  27.17 
 
 		 96 aa  45.4  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0916  hypothetical protein  30 
 
 		 185 aa  43.5  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0005  protein of unknown function DUF721  30.68 
 
 		 217 aa  43.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382214 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10803  hypothetical protein  24.47 
 
 		 98 aa  43.1  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.594174  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2691  protein of unknown function DUF721  29.03 
 
 		 95 aa  42.7  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0029  protein of unknown function DUF1159  28.39 
 
 		 170 aa  42.7  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0188375 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>