More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1116 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 		 498 aa  983    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.208778  decreased coverage  0.000201014 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1364  apolipoprotein N-acyltransferase  38.05 
 
 		 488 aa  196  7e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00243577  hitchhiker  0.000524625 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1141  apolipoprotein N-acyltransferase  36.93 
 
 		 464 aa  167  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0258943  normal  0.332903 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0053  apolipoprotein N-acyltransferase  31.13 
 
 		 553 aa  147  5e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  31.38 
 
 		 507 aa  141  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  30.77 
 
 		 507 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  32.2 
 
 		 510 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  28.97 
 
 		 521 aa  134  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0754  apolipoprotein N-acyltransferase  30.37 
 
 		 532 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  30.62 
 
 		 525 aa  124  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  31.29 
 
 		 477 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  30.33 
 
 		 542 aa  121  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2913  apolipoprotein N-acyltransferase  26.82 
 
 		 505 aa  120  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  26.9 
 
 		 521 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  30.33 
 
 		 506 aa  118  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2070  apolipoprotein N-acyltransferase  30.71 
 
 		 532 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000583807  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2158  apolipoprotein N-acyltransferase  30.48 
 
 		 532 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0003541  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09770  apolipoprotein N-acyltransferase  26.89 
 
 		 488 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4954  apolipoprotein N-acyltransferase  29.87 
 
 		 507 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  31.6 
 
 		 479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  26.84 
 
 		 516 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1806  apolipoprotein N-acyltransferase  29.52 
 
 		 528 aa  114  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.680205  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2341  apolipoprotein N-acyltransferase  35.14 
 
 		 526 aa  113  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.254934  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2135  apolipoprotein N-acyltransferase  31.11 
 
 		 500 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.180116  normal  0.129079 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  27.12 
 
 		 534 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1303  apolipoprotein N-acyltransferase  29.31 
 
 		 502 aa  111  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.873503  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1882  apolipoprotein N-acyltransferase  23.25 
 
 		 488 aa  110  5e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  23.86 
 
 		 513 aa  108  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0151  apolipoprotein N-acyltransferase  26.75 
 
 		 475 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.721179  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4790  apolipoprotein N-acyltransferase  28.37 
 
 		 505 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.295792 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4666  apolipoprotein N-acyltransferase  27.9 
 
 		 505 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372109  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0017  apolipoprotein N-acyltransferase  26.34 
 
 		 534 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536194 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12280  apolipoprotein N-acyltransferase  27.83 
 
 		 511 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2299  apolipoprotein N-acyltransferase  26.35 
 
 		 525 aa  105  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1247  apolipoprotein N-acyltransferase  25.8 
 
 		 541 aa  104  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.620781  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1124  apolipoprotein N-acyltransferase  28.04 
 
 		 511 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.693748  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4844  apolipoprotein N-acyltransferase  29.25 
 
 		 505 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552658  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  28.54 
 
 		 506 aa  103  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3128  apolipoprotein N-acyltransferase  28.03 
 
 		 529 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1912  apolipoprotein N-acyltransferase  29.53 
 
 		 537 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000101188  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  27.39 
 
 		 514 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3783  apolipoprotein N-acyltransferase  27.83 
 
 		 507 aa  102  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.299433 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0646  apolipoprotein N-acyltransferase  27.66 
 
 		 497 aa  101  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2338  apolipoprotein N-acyltransferase  26.52 
 
 		 489 aa  102  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  28.67 
 
 		 505 aa  101  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00767722 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  27.99 
 
 		 528 aa  101  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  28.77 
 
 		 523 aa  100  6e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0630  apolipoprotein N-acyltransferase  28.27 
 
 		 505 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.112466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01226  apolipoprotein N-acyltransferase  25.97 
 
 		 506 aa  97.8  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004215  apolipoprotein N-acyltransferase/copper homeostasis protein CutE  25.56 
 
 		 492 aa  97.8  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0480  apolipoprotein N-acyltransferase  26.1 
 
 		 505 aa  97.4  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0772251  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  27.68 
 
 		 506 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0554  apolipoprotein N-acyltransferase  26.48 
 
 		 522 aa  97.1  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000781227 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2579  apolipoprotein N-acyltransferase  28.24 
 
 		 511 aa  97.1  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.170018 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  26.75 
 
 		 515 aa  96.7  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  26.75 
 
 		 515 aa  96.7  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  26.75 
 
 		 515 aa  96.7  9e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3774  apolipoprotein N-acyltransferase  29.58 
 
 		 531 aa  96.3  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1439  apolipoprotein N-acyltransferase  31.37 
 
 		 524 aa  96.7  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3576  apolipoprotein N-acyltransferase  23.77 
 
 		 532 aa  95.5  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.708418  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1499  apolipoprotein N-acyltransferase  26.82 
 
 		 554 aa  95.1  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0285  apolipoprotein N-acyltransferase  29.42 
 
 		 522 aa  95.5  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0398  apolipoprotein N-acyltransferase  28.97 
 
 		 505 aa  95.5  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415751 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0044  apolipoprotein N-acyltransferase  28.13 
 
 		 543 aa  94.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00386393  unclonable  0.00000000000481156 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1762  apolipoprotein N-acyltransferase  28.15 
 
 		 527 aa  94.4  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  27.66 
 
 		 534 aa  94.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0811  apolipoprotein N-acyltransferase  36.87 
 
 		 541 aa  94.4  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0222  apolipoprotein N-acyltransferase  21.84 
 
 		 491 aa  94  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4417  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0241  apolipoprotein N-acyltransferase  27.51 
 
 		 521 aa  94  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  24.52 
 
 		 501 aa  94.4  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2380  apolipoprotein N-acyltransferase  27.98 
 
 		 532 aa  94  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000838838  hitchhiker  0.0000262387 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3531  apolipoprotein N-acyltransferase  29.44 
 
 		 487 aa  94  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3178  apolipoprotein N-acyltransferase  30.28 
 
 		 553 aa  94  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0696022  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  26.22 
 
 		 511 aa  93.6  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3141  apolipoprotein N-acyltransferase  25.71 
 
 		 511 aa  93.2  9e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218924  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0594  apolipoprotein N-acyltransferase  27.8 
 
 		 536 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2210  apolipoprotein N-acyltransferase  24.75 
 
 		 497 aa  93.2  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  25.46 
 
 		 516 aa  92.8  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.13359 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3951  apolipoprotein N-acyltransferase  28.24 
 
 		 523 aa  92.4  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5319  apolipoprotein N-acyltransferase  26.83 
 
 		 566 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3613  apolipoprotein N-acyltransferase  28.24 
 
 		 523 aa  92.4  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  25.2 
 
 		 516 aa  92.4  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1065  apolipoprotein N-acyltransferase  25.46 
 
 		 519 aa  92  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0532  apolipoprotein N-acyltransferase  32.43 
 
 		 523 aa  91.7  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2502  apolipoprotein N-acyltransferase  28.02 
 
 		 573 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.765014  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2547  apolipoprotein N-acyltransferase  28.02 
 
 		 573 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.464192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  26.04 
 
 		 512 aa  90.9  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  26.04 
 
 		 512 aa  90.9  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6937  apolipoprotein N-acyltransferase  25.59 
 
 		 538 aa  90.9  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.207739 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1180  apolipoprotein N-acyltransferase  33.52 
 
 		 509 aa  90.9  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  26.04 
 
 		 512 aa  90.9  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  27.72 
 
 		 536 aa  90.5  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  25.78 
 
 		 512 aa  90.1  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  26.3 
 
 		 512 aa  90.1  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00616  hypothetical protein  25.52 
 
 		 508 aa  90.1  8e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00625  apolipoprotein N-acyltransferase  25.52 
 
 		 512 aa  90.1  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4463  apolipoprotein N-acyltransferase  27.93 
 
 		 528 aa  89.7  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  26.04 
 
 		 512 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0510  apolipoprotein N-acyltransferase  26.92 
 
 		 524 aa  89.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.511831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0345  apolipoprotein N-acyltransferase  31 
 
 		 487 aa  89.4  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>