255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3950 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3950  deoxyribose-phosphate aldolase  100 
 
 		 219 aa  448  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12490  deoxyribose-phosphate aldolase  49.09 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1774  deoxyribose-phosphate aldolase  49.07 
 
 		 221 aa  194  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1322  deoxyribose-phosphate aldolase  46.98 
 
 		 219 aa  191  6e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0846127  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1345  deoxyribose-phosphate aldolase  46.05 
 
 		 223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532359  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1943  deoxyribose-phosphate aldolase  47.14 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.004325  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1248  deoxyribose-phosphate aldolase  47.91 
 
 		 247 aa  188  5.999999999999999e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.747393  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1057  deoxyribose-phosphate aldolase  45.95 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0448  deoxyribose-phosphate aldolase  45.58 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000718751  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0156  deoxyribose-phosphate aldolase  46.95 
 
 		 222 aa  184  9e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1109  deoxyribose-phosphate aldolase  44.04 
 
 		 228 aa  182  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.875719  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1790  deoxyribose-phosphate aldolase  44.19 
 
 		 221 aa  181  7e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1505  deoxyribose-phosphate aldolase  48.15 
 
 		 235 aa  181  9.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00680706  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1129  deoxyribose-phosphate aldolase  45.58 
 
 		 226 aa  179  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0129  deoxyribose-phosphate aldolase  43.72 
 
 		 220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1507  deoxyribose-phosphate aldolase  44.39 
 
 		 241 aa  179  2.9999999999999997e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0124  deoxyribose-phosphate aldolase  43.72 
 
 		 220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.381743  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0243  deoxyribose-phosphate aldolase  44.44 
 
 		 241 aa  179  4e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.156632  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2706  deoxyribose-phosphate aldolase  46.26 
 
 		 220 aa  178  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0748  deoxyribose-phosphate aldolase  42.13 
 
 		 224 aa  178  7e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000138208  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2432  deoxyribose-phosphate aldolase  44.24 
 
 		 223 aa  178  7e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000478055  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2211  deoxyribose-phosphate aldolase  43.52 
 
 		 220 aa  177  9e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2173  deoxyribose-phosphate aldolase  43.52 
 
 		 220 aa  177  9e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0509  deoxyribose-phosphate aldolase  44.29 
 
 		 222 aa  177  1e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4274  deoxyribose-phosphate aldolase  43.26 
 
 		 218 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1951  deoxyribose-phosphate aldolase  44.04 
 
 		 222 aa  176  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000223419  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1685  deoxyribose-phosphate aldolase  44.04 
 
 		 222 aa  176  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0166673  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1018  deoxyribose-phosphate aldolase  45.16 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0009  deoxyribose-phosphate aldolase  44.13 
 
 		 249 aa  175  4e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000986742  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3057  deoxyribose-phosphate aldolase  44.6 
 
 		 237 aa  175  5e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.928441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0152  deoxyribose-phosphate aldolase  43.52 
 
 		 215 aa  175  5e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl121  deoxyribose-phosphate aldolase  41.4 
 
 		 220 aa  174  8e-43  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  7.16893e-32  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1469  deoxyribose-phosphate aldolase  42.99 
 
 		 223 aa  174  9e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000353478  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1222  deoxyribose-phosphate aldolase  45.21 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1529  deoxyribose-phosphate aldolase  41.86 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.24647  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1752  deoxyribose-phosphate aldolase  42.52 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1233  deoxyribose-phosphate aldolase  45.21 
 
 		 248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2309  deoxyribose-phosphate aldolase  41.01 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2303  deoxyribose-phosphate aldolase  45.54 
 
 		 238 aa  172  5e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0703624  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0111  deoxyribose-phosphate aldolase  42.06 
 
 		 224 aa  171  5e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000645513  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2024  deoxyribose-phosphate aldolase  40.55 
 
 		 224 aa  171  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1301  deoxyribose-phosphate aldolase  46.76 
 
 		 238 aa  171  6.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000113978 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1597  deoxyribose-phosphate aldolase  41.67 
 
 		 220 aa  171  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.464616  unclonable  1.48452e-23 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05590  deoxyribose-phosphate aldolase  44.29 
 
 		 229 aa  170  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00397833  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0689  deoxyribose-phosphate aldolase  43.12 
 
 		 215 aa  169  2e-41  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2002  deoxyribose-phosphate aldolase  42.99 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000046318  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0964  deoxyribose-phosphate aldolase  43.78 
 
 		 217 aa  167  8e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1434  deoxyribose-phosphate aldolase  42.47 
 
 		 229 aa  167  8e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1754  deoxyribose-phosphate aldolase  42.06 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000633467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1732  deoxyribose-phosphate aldolase  42.06 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1703  deoxyribose-phosphate aldolase  42.06 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000427517  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4491  deoxyribose-phosphate aldolase  44.09 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1892  deoxyribose-phosphate aldolase  42.06 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1895  deoxyribose-phosphate aldolase  41.59 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00141039  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0036  deoxyribose-phosphate aldolase  41.36 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000477173  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1927  deoxyribose-phosphate aldolase  42.06 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03965e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1975  deoxyribose-phosphate aldolase  42.06 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000361554  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7285  deoxyribose-phosphate aldolase  42.13 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0772  deoxyribose-phosphate aldolase  44.29 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3451  deoxyribose-phosphate aldolase  41.59 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000347492  hitchhiker  7.10453e-17 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0755  deoxyribose-phosphate aldolase  37.09 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1745  deoxyribose-phosphate aldolase  41.2 
 
 		 220 aa  166  4e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2818  deoxyribose-phosphate aldolase  43.66 
 
 		 239 aa  165  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.964115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1266  deoxyribose-phosphate aldolase  43.98 
 
 		 409 aa  166  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0916741  normal  0.0813164 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3216  deoxyribose-phosphate aldolase  47.2 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1556  deoxyribose-phosphate aldolase  45.37 
 
 		 223 aa  163  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0753  deoxyribose-phosphate aldolase  40.89 
 
 		 231 aa  162  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2737  deoxyribose-phosphate aldolase  44.91 
 
 		 223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2600  deoxyribose-phosphate aldolase  42.4 
 
 		 219 aa  162  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0977  deoxyribose-phosphate aldolase  43.72 
 
 		 228 aa  161  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408395  normal  0.593139 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2833  deoxyribose-phosphate aldolase  44.13 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0559245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6095  deoxyribose-phosphate aldolase  42.72 
 
 		 317 aa  160  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0401108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2652  deoxyribose-phosphate aldolase  44.44 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1452  deoxyribose-phosphate aldolase  42.79 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2591  deoxyribose-phosphate aldolase  44.86 
 
 		 225 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3526  deoxyribose-phosphate aldolase  44.86 
 
 		 256 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1632  deoxyribose-phosphate aldolase  45.74 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101131  hitchhiker  0.000603292 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1028  deoxyribose-phosphate aldolase  38.89 
 
 		 223 aa  158  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0160558  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3408  deoxyribose-phosphate aldolase  38.43 
 
 		 224 aa  158  7e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00715959  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6902  deoxyribose-phosphate aldolase  41.47 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0730  deoxyribose-phosphate aldolase  42.99 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.151995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08130  deoxyribose-phosphate aldolase  39.04 
 
 		 269 aa  156  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.426223 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2538  deoxyribose-phosphate aldolase  42.52 
 
 		 223 aa  155  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1525  deoxyribose-phosphate aldolase  43.19 
 
 		 234 aa  155  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2961  deoxyribose-phosphate aldolase  37.67 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2070  deoxyribose-phosphate aldolase  40.28 
 
 		 223 aa  154  9e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.661265  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1560  deoxyribose-phosphate aldolase  40.28 
 
 		 222 aa  154  9e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2790  deoxyribose-phosphate aldolase  40 
 
 		 248 aa  153  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1538  deoxyribose-phosphate aldolase  40 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.539113  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf239  deoxyribose-phosphate aldolase  37.74 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000190899  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2321  deoxyribose-phosphate aldolase  40.28 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000020157  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1239  deoxyribose-phosphate aldolase  37.21 
 
 		 243 aa  149  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1583  deoxyribose-phosphate aldolase  38.14 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl639  deoxyribose-phosphate aldolase  37.5 
 
 		 212 aa  149  4e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0763  deoxyribose-phosphate aldolase  40.83 
 
 		 242 aa  147  8e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.503498  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4603  deoxyribose-phosphate aldolase  40.55 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2141  deoxyribose-phosphate aldolase  42.86 
 
 		 215 aa  145  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00973111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1083  deoxyribose-phosphate aldolase  38.6 
 
 		 248 aa  145  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6946  deoxyribose-phosphate aldolase  41.47 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1543  deoxyribose-phosphate aldolase  41.47 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.486801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>