More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0100 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0100  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 
234 aa  466  1e-130  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  37.23 
 
 
210 aa  158  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  36.8 
 
 
210 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  36.8 
 
 
210 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  36.8 
 
 
210 aa  155  5e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  36.8 
 
 
210 aa  155  5e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.87844e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  36.8 
 
 
210 aa  154  9e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  36.09 
 
 
209 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  36.36 
 
 
210 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  36.8 
 
 
210 aa  152  3e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  35.5 
 
 
209 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2383  homoserine/threonine efflux protein, putative  37.07 
 
 
210 aa  139  5e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3063  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.27 
 
 
210 aa  135  7e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  31.56 
 
 
208 aa  129  5e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  2.39469e-07 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  37.18 
 
 
211 aa  126  2e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  2.85135e-07 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.26 
 
 
218 aa  127  2e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.1 
 
 
218 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.07 
 
 
218 aa  123  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  32.44 
 
 
208 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  31.56 
 
 
208 aa  123  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.26843e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1031  hypothetical protein  33.63 
 
 
212 aa  123  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1701  amino acid transporter LysE  32.44 
 
 
208 aa  122  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  39.33 
 
 
211 aa  120  2e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  34.33 
 
 
207 aa  120  2e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  33.18 
 
 
211 aa  120  2e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1333  lysine exporter protein LysE/YggA  32.89 
 
 
212 aa  119  5e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003627  putative threonine efflux protein  31.39 
 
 
231 aa  116  2e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  35.4 
 
 
215 aa  117  2e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.17 
 
 
211 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  34.93 
 
 
204 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  35.17 
 
 
211 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.71 
 
 
212 aa  115  4e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  35.17 
 
 
211 aa  115  4e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.36 
 
 
243 aa  115  4e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2768  lysine exporter protein LysE/YggA  33.02 
 
 
221 aa  115  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  35.17 
 
 
211 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  35.17 
 
 
211 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  35.17 
 
 
211 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  35.17 
 
 
211 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  34.7 
 
 
210 aa  114  2e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  36.44 
 
 
211 aa  114  2e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  34.25 
 
 
209 aa  113  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  33.91 
 
 
213 aa  112  4e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1744  lysine exporter protein LysE/YggA  31.11 
 
 
208 aa  112  4e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257251  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0111  hypothetical protein  32.38 
 
 
215 aa  112  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.24 
 
 
211 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2939  lysine exporter protein LysE/YggA  31.94 
 
 
214 aa  112  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419308  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.24 
 
 
211 aa  112  7e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  32.75 
 
 
204 aa  111  1e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  32.75 
 
 
204 aa  111  1e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  33.19 
 
 
204 aa  111  1e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  32.75 
 
 
204 aa  110  2e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  31.48 
 
 
212 aa  110  2e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1752  homoserine/threonine efflux protein  32.44 
 
 
208 aa  110  2e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000289008  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  32.55 
 
 
209 aa  110  2e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1890  homoserine/threonine efflux protein  32.44 
 
 
208 aa  110  2e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.131548  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  31.48 
 
 
212 aa  110  2e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  34.32 
 
 
213 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  34.25 
 
 
210 aa  109  4e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2562  lysine exporter protein LysE/YggA  32.11 
 
 
211 aa  109  4e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  34.1 
 
 
209 aa  108  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  35.17 
 
 
211 aa  108  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1483  lysine exporter protein LysE/YggA  32.24 
 
 
215 aa  108  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4118  RhtB family transporter  31.82 
 
 
213 aa  108  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2500  lysine exporter protein LysE/YggA  32.59 
 
 
213 aa  108  7e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106725  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  34.07 
 
 
205 aa  108  7e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  32.46 
 
 
194 aa  108  8e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  32.46 
 
 
194 aa  108  8e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  32.46 
 
 
194 aa  108  8e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  32.46 
 
 
194 aa  108  8e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  33.77 
 
 
204 aa  108  8e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1795  lysine exporter protein LysE/YggA  34.19 
 
 
212 aa  108  8e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2511  lysine exporter protein LysE/YggA  35.47 
 
 
213 aa  108  9e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3125  lysine exporter protein LysE/YggA  35.47 
 
 
213 aa  108  9e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.298747  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  35.62 
 
 
211 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3141  lysine exporter protein LysE/YggA  35.47 
 
 
213 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.514565  normal  0.554318 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3063  lysine exporter protein LysE/YggA  35.9 
 
 
213 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  32.24 
 
 
205 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  32.61 
 
 
217 aa  107  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3180  lysine exporter protein LysE/YggA  35.9 
 
 
213 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.920743  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  33.05 
 
 
206 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1343  LysE family translocator protein  34.19 
 
 
210 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.78 
 
 
208 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1728  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.19 
 
 
208 aa  106  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  2.59292e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  31.78 
 
 
217 aa  106  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2459  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 
215 aa  105  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.593208  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  31.51 
 
 
212 aa  105  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  31.76 
 
 
227 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  29.49 
 
 
213 aa  105  7e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
214 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  31.62 
 
 
210 aa  105  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  30.49 
 
 
211 aa  105  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02483  hypothetical protein  32.9 
 
 
209 aa  105  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  32.47 
 
 
204 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0921  putative threonine efflux protein  27.83 
 
 
205 aa  104  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  35.56 
 
 
216 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  31.88 
 
 
204 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  31.72 
 
 
205 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  32.05 
 
 
217 aa  104  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  34.91 
 
 
208 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>