More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0049 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0049  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 
322 aa  663  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  48.88 
 
 
313 aa  309  5e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  49.69 
 
 
342 aa  301  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  47.12 
 
 
313 aa  286  5e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  45.51 
 
 
316 aa  286  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5440  AraC family transcriptional regulator  47.42 
 
 
315 aa  274  1e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5422  AraC family transcriptional regulator  47.42 
 
 
315 aa  274  1e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0424919  normal  0.013013 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4847  AraC family transcriptional regulator  47.1 
 
 
315 aa  274  2e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  48.39 
 
 
314 aa  274  2e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0230  transcriptional regulator  45.81 
 
 
315 aa  272  7e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4763  AraC family transcriptional regulator  45.48 
 
 
315 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.316833  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3394  transcriptional regulator  43.12 
 
 
320 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482598  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3383  transcriptional regulator  43.12 
 
 
320 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.690138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3445  transcriptional regulator  43.12 
 
 
320 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.68449 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  43.59 
 
 
340 aa  253  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3202  transcriptional regulator, AraC family  43.3 
 
 
330 aa  248  7e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125903  unclonable  1.6632e-11 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 
323 aa  242  5e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2133  transcriptional regulator, AraC family  43.35 
 
 
321 aa  239  5e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5328  transcriptional activator FtrA  40.87 
 
 
324 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.417039 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0092  AraC family transcriptional regulator  41.8 
 
 
312 aa  236  4e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9264  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  43.4 
 
 
328 aa  234  1e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  44.24 
 
 
331 aa  232  7e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  40.95 
 
 
327 aa  231  9e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  40.44 
 
 
332 aa  230  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3549  transcriptional regulator, AraC family  43.22 
 
 
337 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.757715  normal  0.622262 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  41.48 
 
 
329 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  41.01 
 
 
332 aa  229  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1271  transcriptional regulator, AraC family  39.43 
 
 
317 aa  229  6e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5179  transcriptional regulator, AraC family  41.82 
 
 
352 aa  229  7e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4142  transcriptional regulator, AraC family  41.77 
 
 
318 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00637596  normal  0.887483 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  39.63 
 
 
324 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  40.06 
 
 
324 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  40.06 
 
 
324 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  5.80095e-05 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  39.49 
 
 
328 aa  226  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  37.3 
 
 
326 aa  226  5e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  40.71 
 
 
326 aa  226  5e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3284  transcriptional activator FtrA  39.68 
 
 
333 aa  226  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.059892 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3453  transcriptional activator FtrA  39.75 
 
 
320 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  40.06 
 
 
347 aa  224  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3699  transcriptional activator FtrA  40.26 
 
 
324 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507684  normal  0.317961 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0089  AraC family transcriptional regulator  42.12 
 
 
312 aa  224  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4913  transcriptional activator FtrA  39.75 
 
 
320 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.860168  normal  0.680733 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0431  transcriptional regulator, AraC family  45.82 
 
 
320 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4316  transcriptional regulator, AraC family  38.41 
 
 
320 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  43.67 
 
 
314 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  39.62 
 
 
350 aa  224  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  39.42 
 
 
362 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1334  putative transcriptional regulator  39.68 
 
 
317 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1565  transcriptional activator FtrA  40 
 
 
318 aa  222  8e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0715182  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0872  transcriptional activator FtrA  40 
 
 
318 aa  222  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637455  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0835  transcriptional activator FtrA  40 
 
 
318 aa  222  8e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0055  transcriptional activator FtrA  40 
 
 
318 aa  222  8e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00213604  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15150  putative transcriptional regulator  39.68 
 
 
317 aa  221  1e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  hitchhiker  2.98096e-05 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3031  transcriptional activator FtrA  38.78 
 
 
333 aa  221  1e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00937108  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5373  transcriptional activator FtrA  39.12 
 
 
320 aa  221  2e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379602  normal  0.0775766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  42.67 
 
 
333 aa  220  2e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4079  transcriptional regulator, AraC family  41.3 
 
 
321 aa  221  2e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0276978  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2214  transcriptional activator FtrA  39.68 
 
 
318 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00591748  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1680  transcriptional regulator, AraC family  41.77 
 
 
319 aa  219  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00886314  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0964  transcriptional activator FtrA  39.37 
 
 
318 aa  219  7e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  36.71 
 
 
326 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  36.25 
 
 
326 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  39.38 
 
 
350 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  36.71 
 
 
326 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3843  transcriptional regulator, AraC family  40.92 
 
 
339 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295718  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1760  transcriptional activator FtrA  39.37 
 
 
318 aa  217  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  37.22 
 
 
325 aa  218  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  37.54 
 
 
327 aa  217  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  36.71 
 
 
326 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3112  ThiJ/PfpI domain protein  38.22 
 
 
321 aa  217  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226454  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4737  transcriptional activator FtrA  40 
 
 
321 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  37.42 
 
 
321 aa  216  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  37.85 
 
 
342 aa  216  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 
320 aa  216  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  40.58 
 
 
333 aa  216  5e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4355  AraC family transcriptional regulator  42.36 
 
 
356 aa  215  6e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  37.03 
 
 
348 aa  215  6e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4426  transcriptional activator FtrA  38.91 
 
 
331 aa  215  8e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2051  transcriptional regulator, AraC family  39.23 
 
 
344 aa  214  1e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5345  AraC family transcriptional regulator  42.36 
 
 
318 aa  214  2e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6224  AraC family transcriptional regulator  51.61 
 
 
367 aa  214  2e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3344  transcriptional regulator, AraC family  40.8 
 
 
306 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107128  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2364  transcriptional regulator, AraC family  37.74 
 
 
322 aa  211  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.89765e-07 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  38.12 
 
 
346 aa  211  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5890  transcriptional activator FtrA  37.78 
 
 
321 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  39.31 
 
 
322 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5233  AraC family transcriptional regulator  37.58 
 
 
349 aa  210  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.896357  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0514  transcriptional regulator, AraC family  37.81 
 
 
334 aa  210  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2087  transcriptional activator FtrA  38.1 
 
 
321 aa  209  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31788  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0051  transcriptional regulator  34.49 
 
 
323 aa  209  6e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.929929  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1692  transcriptional regulator, AraC family  42.37 
 
 
333 aa  208  8e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  35.69 
 
 
333 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4339  transcriptional regulator, AraC family  42.02 
 
 
334 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  38.34 
 
 
329 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0419  arac-family transcriptional regulator  36.66 
 
 
317 aa  206  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.11496e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  36.45 
 
 
333 aa  206  5e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4599  transcriptional regulator, AraC family  49.36 
 
 
332 aa  204  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.33 
 
 
330 aa  203  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276432  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  37.58 
 
 
320 aa  203  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  37.66 
 
 
356 aa  202  5e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>