More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2711 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
267 aa  545  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  87.27 
 
 
267 aa  469  1e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  83.15 
 
 
267 aa  451  1e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  82.77 
 
 
267 aa  451  1e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  79.03 
 
 
266 aa  424  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  78.28 
 
 
266 aa  418  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  77.53 
 
 
266 aa  415  1e-115  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  77.9 
 
 
266 aa  416  1e-115  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  76.78 
 
 
266 aa  410  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  76.78 
 
 
266 aa  410  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  76.78 
 
 
266 aa  410  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  76.78 
 
 
266 aa  410  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  76.78 
 
 
266 aa  410  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  76.78 
 
 
266 aa  410  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  76.4 
 
 
266 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  76.78 
 
 
266 aa  410  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  76.4 
 
 
266 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  76.03 
 
 
266 aa  407  1e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  77.9 
 
 
266 aa  404  1e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  77.15 
 
 
266 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  77.15 
 
 
266 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  77.15 
 
 
266 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  76.4 
 
 
266 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  57.84 
 
 
267 aa  324  1e-87  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1361  phosphomethylpyrimidine kinase  63.12 
 
 
268 aa  308  8e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  59 
 
 
268 aa  304  1e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1658  phosphomethylpyrimidine kinase  61.98 
 
 
268 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2479  phosphomethylpyrimidine kinase  60.84 
 
 
268 aa  298  8e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0351011  hitchhiker  0.000627669 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2041  phosphomethylpyrimidine kinase  60.98 
 
 
269 aa  288  5e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6036  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  60.98 
 
 
269 aa  288  5e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190496  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2060  phosphomethylpyrimidine kinase  60.61 
 
 
269 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.373143 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1236  phosphomethylpyrimidine kinase  60.98 
 
 
269 aa  286  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.252768 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5350  phosphomethylpyrimidine kinase  60.61 
 
 
269 aa  285  6e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.120967 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2073  phosphomethylpyrimidine kinase  60.61 
 
 
269 aa  281  6e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1942  phosphomethylpyrimidine kinase  60.61 
 
 
269 aa  281  7e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  53.56 
 
 
267 aa  280  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2005  phosphomethylpyrimidine kinase  61.36 
 
 
269 aa  273  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  55.13 
 
 
268 aa  270  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  55.13 
 
 
268 aa  270  3e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  54.92 
 
 
268 aa  269  4e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  53.44 
 
 
266 aa  268  9e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  52.11 
 
 
271 aa  267  1e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2080  phosphomethylpyrimidine kinase  62.12 
 
 
269 aa  266  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3232  phosphomethylpyrimidine kinase  62.12 
 
 
269 aa  266  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2516  phosphomethylpyrimidine kinase  62.12 
 
 
269 aa  266  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1352  phosphomethylpyrimidine kinase  62.12 
 
 
269 aa  266  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00443333  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1577  phosphomethylpyrimidine kinase  62.12 
 
 
269 aa  266  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.299671  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  52.11 
 
 
266 aa  265  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2460  phosphomethylpyrimidine kinase  62.12 
 
 
269 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  53.82 
 
 
270 aa  262  4e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2604  phosphomethylpyrimidine kinase  61.74 
 
 
778 aa  262  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.354014  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  52.26 
 
 
269 aa  262  5e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  53.16 
 
 
285 aa  261  6e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  55.47 
 
 
274 aa  253  2e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  53.08 
 
 
268 aa  251  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  54.75 
 
 
323 aa  249  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4493  phosphomethylpyrimidine kinase  53.82 
 
 
266 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  55.13 
 
 
269 aa  248  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  52.65 
 
 
264 aa  248  9e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1561  phosphomethylpyrimidine kinase  54.75 
 
 
335 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  52.11 
 
 
272 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 
285 aa  239  5e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  48.69 
 
 
265 aa  238  7e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4968  phosphomethylpyrimidine kinase  57.83 
 
 
267 aa  238  8e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.949163  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  50.57 
 
 
262 aa  238  8e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5777  phosphomethylpyrimidine kinase  52.94 
 
 
277 aa  237  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269735  normal  0.0629461 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0060  phosphomethylpyrimidine kinase  54.75 
 
 
335 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0209  phosphomethylpyrimidine kinase  50.96 
 
 
304 aa  237  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.606568  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1473  phosphomethylpyrimidine kinase  54.75 
 
 
336 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.021769  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0218  phosphomethylpyrimidine kinase  50.57 
 
 
291 aa  235  7e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.940459  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0042  phosphomethylpyrimidine kinase  53.01 
 
 
284 aa  232  6e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0834315  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  54.96 
 
 
267 aa  230  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  50.76 
 
 
268 aa  228  7e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  46.01 
 
 
267 aa  226  2e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0285  phosphomethylpyrimidine kinase  48.79 
 
 
295 aa  225  5e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  43.94 
 
 
267 aa  224  8e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 
270 aa  224  8e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1636  phosphomethylpyrimidine kinase  48.29 
 
 
499 aa  222  4e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431333  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  41.95 
 
 
264 aa  221  8e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  46.9 
 
 
284 aa  221  1e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  44.83 
 
 
270 aa  221  1e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  41.57 
 
 
264 aa  219  2e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3133  phosphomethylpyrimidine kinase  45.19 
 
 
277 aa  219  4e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3649  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  50.76 
 
 
267 aa  219  5e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
271 aa  218  6e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  48.53 
 
 
297 aa  218  6e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 
263 aa  218  7e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2392  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  49.24 
 
 
531 aa  218  8e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171536  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1958  phosphomethylpyrimidine kinase  56 
 
 
271 aa  216  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0610158  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  43.63 
 
 
265 aa  214  1e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  3.85147e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2300  phosphomethylpyrimidine kinase  51.92 
 
 
267 aa  214  1e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  51.54 
 
 
267 aa  214  1e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.988766  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0915  phosphomethylpyrimidine kinase  53.99 
 
 
265 aa  213  2e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.257449  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  45.49 
 
 
269 aa  213  3e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  46.51 
 
 
288 aa  212  5e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  43.45 
 
 
270 aa  211  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4939  phosphomethylpyrimidine kinase  56 
 
 
267 aa  211  9e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  44.62 
 
 
260 aa  210  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0854  phosphomethylpyrimidine kinase  52.59 
 
 
279 aa  209  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0599289  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  44.57 
 
 
286 aa  209  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>