More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3256 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3256  transferase hexapeptide repeat containing protein  100 
 
 
236 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1509  transferase hexapeptide repeat containing protein  65.64 
 
 
214 aa  289  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1985  transferase hexapeptide repeat containing protein  59.91 
 
 
203 aa  268  8e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062564 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4429  hexapaptide repeat-containing transferase  58.59 
 
 
207 aa  253  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.520075 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0783  hexapaptide repeat-containing transferase  57.5 
 
 
212 aa  252  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.989182  normal  0.702768 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1971  transferase hexapeptide repeat containing protein  57.5 
 
 
207 aa  249  3e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365375 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0290  acetyltransferase  57.51 
 
 
194 aa  236  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0577  transferase hexapeptide repeat containing protein  57.69 
 
 
194 aa  230  2e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4761  transferase hexapeptide repeat containing protein  55.19 
 
 
190 aa  226  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000053665  normal  0.125318 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0704  hexapeptide transferase family protein  53.47 
 
 
194 aa  225  5.0000000000000005e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000306748  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0951  hexapaptide repeat-containing transferase  61.8 
 
 
189 aa  223  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1928  transferase hexapeptide repeat containing protein  54.92 
 
 
196 aa  220  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.746546  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0246  hexapaptide repeat-containing transferase  54.17 
 
 
193 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.35108 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2971  putative acetyltransferase  55.43 
 
 
192 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.727659  normal  0.708619 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1421  hexapaptide repeat-containing transferase  53.01 
 
 
192 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2258  putative acetyltransferase  55.43 
 
 
193 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0569631  hitchhiker  0.00196203 
 
 
-
 
NC_002950  PG0002  hexapeptide transferase family protein  55.68 
 
 
190 aa  217  1e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123717 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1859  Serine acetyltransferase-like protein  52.88 
 
 
194 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127737  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0823  WbbJ protein  53.97 
 
 
193 aa  216  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0550  transferase hexapeptide repeat containing protein  55.85 
 
 
193 aa  217  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.259438  normal  0.0248751 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3016  putative acetyltransferase  52.66 
 
 
215 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0893  NAD-dependent oxidoreductase  51.4 
 
 
517 aa  208  6e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0357  transferase hexapeptide repeat containing protein  55.32 
 
 
192 aa  208  7e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0541  hexapaptide repeat-containing transferase  52.78 
 
 
191 aa  208  7e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1122  hexapeptide repeat-containing transferase  50.84 
 
 
517 aa  206  3e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1820  hexapaptide repeat-containing transferase  52.75 
 
 
187 aa  204  9e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1673  transferase hexapeptide repeat containing protein  54.75 
 
 
192 aa  203  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160587  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3315  hexapaptide repeat-containing transferase  53.37 
 
 
196 aa  202  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.711982 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0871  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  53.67 
 
 
189 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1298  putative acetyltransferase  49.44 
 
 
207 aa  199  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.248019  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3128  putative acetyltransferase WbpD  51.1 
 
 
194 aa  199  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0895  hexapaptide repeat-containing transferase  52.41 
 
 
202 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6855  transferase hexapeptide repeat containing protein  55.69 
 
 
197 aa  175  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0929755 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1692  hypothetical protein  52.41 
 
 
182 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733433  decreased coverage  0.000199621 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0641  transferase hexapeptide repeat containing protein  47.75 
 
 
192 aa  173  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.312071 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1694  hypothetical protein  50.32 
 
 
182 aa  165  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.373843  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0206  hexapaptide repeat-containing transferase  49.04 
 
 
191 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.238916  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1940  putative acetyltransferase  45.4 
 
 
191 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4289  putative acetyltransferase  48.39 
 
 
197 aa  159  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.934275  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  50.62 
 
 
189 aa  157  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.532773  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1080  hexapaptide repeat-containing transferase  40.85 
 
 
203 aa  155  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00205406  normal  0.0149533 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0038  transferase hexapeptide repeat containing protein  45.6 
 
 
196 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2688  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.98 
 
 
198 aa  144  9e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00225103  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1738  N-acetylglucosamine-1- phosphateuridyltransferase-like protein  41.07 
 
 
201 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4052  putative acetyltransferase  41.24 
 
 
198 aa  144  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4209  putative acetyltransferase  38.34 
 
 
198 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1724  hexapaptide repeat-containing transferase  44.85 
 
 
182 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7631  putative acetyltransferase  36.27 
 
 
206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196092  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3930  WxcM domain-containing protein  41.94 
 
 
317 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.505027  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2008  hexapaptide repeat-containing transferase  43.64 
 
 
186 aa  135  7.000000000000001e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500963  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08610  N-acetylglucosamine-1-phosphate uridylyltransferase/acetyltransferase  39.58 
 
 
198 aa  135  7.000000000000001e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.351534 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1609  WxcM domain protein  39.1 
 
 
310 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.875347  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  41.94 
 
 
316 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710053  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08990  hypothetical protein  37.97 
 
 
207 aa  131  7.999999999999999e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2425  putative acetyltransferase  38.01 
 
 
194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0318047 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0692  WxcM domain-containing protein  39.63 
 
 
315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253812  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21040  N-acetylglucosamine-1-phosphate uridylyltransferase/acetyltransferase  36.27 
 
 
228 aa  129  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.94293  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2659  WxcM-like protein  43.17 
 
 
304 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0690  WxcM-like  43.42 
 
 
313 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1324  WxcM-like protein  43.26 
 
 
309 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3027  WxcM-like protein  38.96 
 
 
153 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0683597  normal  0.28553 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1783  WxcM-like protein  41.89 
 
 
171 aa  119  6e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1238  WxcM-like  38.46 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219256  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0413  acetyl/acyl transferase related protein  40 
 
 
230 aa  100  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0120  hexapaptide repeat-containing transferase  36.24 
 
 
221 aa  98.6  7e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5772  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.92 
 
 
168 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0605  hexapaptide repeat-containing transferase  45.32 
 
 
227 aa  96.3  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51526  normal  0.572168 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1136  acetyltransferase  37.5 
 
 
240 aa  94  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5179  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.57 
 
 
192 aa  92.4  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0167  hexapaptide repeat-containing transferase  33.79 
 
 
254 aa  92.4  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.290287  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0245  acetyltransferase  35.97 
 
 
158 aa  92  8e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3011  hexapaptide repeat-containing transferase  42.42 
 
 
192 aa  90.9  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0169  hexapaptide repeat-containing transferase  34.42 
 
 
254 aa  88.6  8e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0546103  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6224  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.42 
 
 
168 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.164318 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0476  hexapaptide repeat-containing transferase  39.71 
 
 
193 aa  87  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.269907  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0803  acetyl/acyl transferase related protein  40.99 
 
 
212 aa  87.4  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5491  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.23 
 
 
219 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1022  hexapaptide repeat-containing transferase  32.41 
 
 
251 aa  86.3  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2036  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.04 
 
 
193 aa  86.7  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.327248  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2875  hexapaptide repeat-containing transferase  39.02 
 
 
159 aa  86.3  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0973  hexapaptide repeat-containing transferase  33.33 
 
 
160 aa  84  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0161902  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1029  hexapaptide repeat-containing transferase  32.24 
 
 
252 aa  84  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6420  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.84 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45706  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1480  hexapaptide repeat-containing transferase  31.72 
 
 
251 aa  83.2  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1609  acetyltransferase  33.11 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4804  hexapaptide repeat-containing transferase  38.1 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.159641  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1396  acetyltransferase  36.51 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3195  transferase hexapeptide repeat protein  31.29 
 
 
175 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3038  hexapaptide repeat-containing transferase  34.62 
 
 
169 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2232  hexapaptide repeat-containing transferase  35.48 
 
 
199 aa  81.3  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0813  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.81 
 
 
198 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.434904  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1066  transferase hexapeptide repeat  31.97 
 
 
175 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2143  hexapaptide repeat-containing transferase  41.03 
 
 
198 aa  80.5  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.748162 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0040  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.92 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0600  acetyl/acyl transferase related protein  41.74 
 
 
226 aa  79  0.00000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1240  hexapaptide repeat-containing transferase  33.81 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2194  hypothetical protein  35.71 
 
 
185 aa  77.4  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  decreased coverage  0.00108321 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1570  acetyl/acyl transferase related protein  42.34 
 
 
227 aa  75.9  0.0000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4612  hexapaptide repeat-containing transferase  34.01 
 
 
182 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.796744  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3687  hexapaptide repeat-containing transferase  37.5 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.222409 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>