More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1829 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1829  30S ribosomal protein S18  100 
 
 		 87 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2029  30S ribosomal protein S18  72.94 
 
 		 87 aa  136  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1351  30S ribosomal protein S18  70.11 
 
 		 87 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1411  30S ribosomal protein S18  70.59 
 
 		 87 aa  134  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000532082  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2023  30S ribosomal protein S18  68.97 
 
 		 87 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.344457  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1095  30S ribosomal protein S18  70.59 
 
 		 86 aa  131  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.443654  normal  0.0284482 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0009  30S ribosomal protein S18  59.72 
 
 		 83 aa  95.9  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.99289  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2843  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 106 aa  87  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270954  hitchhiker  0.0000000000000931425 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1477  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 92 aa  85.1  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00897037 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2763  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 92 aa  85.1  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3677  30S ribosomal protein S18  48.68 
 
 		 91 aa  84.3  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0799478  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0666  30S ribosomal protein S18  51.47 
 
 		 103 aa  84  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4505  ribosomal protein S18  53.73 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2608  30S ribosomal protein S18  50.72 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0113564  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3187  ribosomal protein S18  55.88 
 
 		 81 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11540  SSU ribosomal protein S18P  54.55 
 
 		 87 aa  80.9  0.000000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0244306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0485  ribosomal protein S18  53.62 
 
 		 75 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213822  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0024  ribosomal protein S18  53.03 
 
 		 86 aa  79  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000175752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0759  30S ribosomal protein S18  47.83 
 
 		 94 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000168995  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23340  ribosomal protein S18  56.72 
 
 		 70 aa  78.6  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000096386  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0021  ribosomal protein S18  51.52 
 
 		 90 aa  78.2  0.00000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00224831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1691  ribosomal protein S18  55.07 
 
 		 79 aa  78.2  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1676  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 89 aa  77.8  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000141185  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2460  SSU ribosomal protein S18P  47.22 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168294 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1998  ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 91 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.471934  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27900  SSU ribosomal protein S18P  50 
 
 		 86 aa  75.9  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000408904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0656  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 74 aa  75.1  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3421  ribosomal protein S18  51.47 
 
 		 75 aa  75.5  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1436  30S ribosomal protein S18  50.72 
 
 		 75 aa  74.7  0.0000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00709518  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0584  30S ribosomal protein S18  51.39 
 
 		 74 aa  74.7  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.501506  hitchhiker  6.40936e-16 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0780  ribosomal protein S18  50 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1328  30S ribosomal protein S18  54.41 
 
 		 75 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.52927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7310  30S ribosomal protein S18  47.06 
 
 		 78 aa  73.9  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.879868  normal  0.0299055 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 78 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1934  ribosomal protein S18  50 
 
 		 74 aa  73.9  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.250727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0572  ribosomal protein S18  50.72 
 
 		 75 aa  73.6  0.0000000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.504032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 77 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3062  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382795  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3590  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.307968  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 77 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 77 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 77 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 77 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 77 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 77 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4662  30S ribosomal protein S18  47.06 
 
 		 78 aa  73.2  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 77 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0517  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.370813  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 77 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3433  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00939921  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3349  30S ribosomal protein S18  48.53 
 
 		 75 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000024458  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 77 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_002936  DET1044  30S ribosomal protein S18  47.22 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000893397  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3928  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3282  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0561913  hitchhiker  0.000203056 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 		 77 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  48.53 
 
 		 84 aa  72.4  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3559  30S ribosomal protein S18  47.06 
 
 		 78 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.842484 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0652  ribosomal protein S18  56.45 
 
 		 81 aa  72.4  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_915  ribosomal protein S18  47.22 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043534  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3641  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000922351  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1641  30S ribosomal protein S18  47.22 
 
 		 75 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0283547  normal  0.0346788 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0734  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213573  hitchhiker  0.0000000101296 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0927  30S ribosomal protein S18  47.22 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000227736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0743  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000702658  hitchhiker  0.000126667 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0335  ribosomal protein S18  47.06 
 
 		 78 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.793411 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3258  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000185776  hitchhiker  0.00000962833 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0689  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00223713  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0713  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.348938  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0755  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000506389  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0703  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000172761  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0924  ribosomal protein S18  48.61 
 
 		 74 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.373301  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1338  30S ribosomal protein S18  45.83 
 
 		 76 aa  72  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0621321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4210  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.882361  hitchhiker  0.000251035 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0759  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190988  hitchhiker  0.000000223269 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1031  30S ribosomal protein S18  45.83 
 
 		 76 aa  72  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3584  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 75 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.173791  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1528  30S ribosomal protein S18  47.89 
 
 		 90 aa  71.2  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.602669  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2379  ribosomal protein S18  50 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.5089799999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2103  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.499514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0682  30S ribosomal protein S18  46.58 
 
 		 75 aa  70.9  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0448  30S ribosomal protein S18  46.58 
 
 		 75 aa  70.9  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435788 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3782  30S ribosomal protein S18  46.58 
 
 		 75 aa  70.9  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3637  30S ribosomal protein S18  46.58 
 
 		 75 aa  70.9  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1356  ribosomal protein S18  46.48 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04069  30S ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 75 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3791  ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 75 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00509801  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4672  30S ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 75 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.998059 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4789  30S ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 75 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0963003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3811  30S ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 75 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0521651 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1949  30S ribosomal protein S18  50 
 
 		 94 aa  70.5  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.879875  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5717  30S ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 75 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.375297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04031  hypothetical protein  49.28 
 
 		 75 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4811  30S ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 75 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0274683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0776  30S ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 75 aa  70.5  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000892175  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4446  30S ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 75 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4661  30S ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 75 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.13301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0796  30S ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 75 aa  70.5  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000510602  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4753  30S ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 75 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0729519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4671  30S ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 75 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00669693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>