More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0481 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  100 
 
 
450 aa  885    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  43.02 
 
 
451 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  42.43 
 
 
442 aa  349  7e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  40.37 
 
 
461 aa  332  7.000000000000001e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  40.37 
 
 
461 aa  332  7.000000000000001e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2168  magnesium transporter  39.5 
 
 
453 aa  330  4e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.571792  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  38.65 
 
 
461 aa  319  5e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  37.7 
 
 
445 aa  312  9e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  38.15 
 
 
445 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  36.98 
 
 
458 aa  301  2e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1980  magnesium transporter  37.44 
 
 
451 aa  300  3e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1722  magnesium transporter  38.52 
 
 
462 aa  300  4e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2718  magnesium transporter  34.17 
 
 
452 aa  286  5e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  36.98 
 
 
463 aa  286  8e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3016  magnesium transporter  34.47 
 
 
443 aa  285  9e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000242012  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0681  transcriptional regulator  38.11 
 
 
454 aa  284  2.0000000000000002e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2282  magnesium transporter  38.75 
 
 
453 aa  280  4e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0198685  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0809  magnesium transporter  36.32 
 
 
542 aa  280  4e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1785  divalent cation transporter  36.24 
 
 
447 aa  280  5e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1939  magnesium transporter  34.18 
 
 
444 aa  279  7e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0382273  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  39.76 
 
 
452 aa  278  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  36.57 
 
 
468 aa  278  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2169  magnesium transporter  36.12 
 
 
449 aa  276  4e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  37 
 
 
463 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  36.79 
 
 
466 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  37.3 
 
 
465 aa  270  2.9999999999999997e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18191  Mg2+ transporter  35.96 
 
 
469 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03755  magnesium transporter  36.84 
 
 
449 aa  267  2e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.578894  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  35.71 
 
 
482 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  33.41 
 
 
446 aa  266  5e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0092  magnesium transporter  39.04 
 
 
486 aa  266  5.999999999999999e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0843  magnesium transporter  35.44 
 
 
449 aa  266  5.999999999999999e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2291  magnesium transporter  34.23 
 
 
449 aa  266  7e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0134  magnesium transporter  36.02 
 
 
450 aa  265  1e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.149732 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  32.66 
 
 
460 aa  265  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0138  divalent cation transporter  37.08 
 
 
486 aa  264  2e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1082  divalent cation transporter  35.28 
 
 
447 aa  263  4e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20831  Mg2+ transporter  36.18 
 
 
469 aa  263  4e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18401  Mg2+ transporter  35.31 
 
 
468 aa  263  4e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.297681  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1208  Mg2+ transporter  37 
 
 
469 aa  263  6e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1689  magnesium transporter  33.33 
 
 
449 aa  261  1e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1723  Mg2+ transporter  35.08 
 
 
468 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20289  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1710  magnesium transporter  30.48 
 
 
459 aa  260  3e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000106288  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18221  Mg2+ transporter  35.08 
 
 
468 aa  260  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  35.35 
 
 
462 aa  259  7e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2879  magnesium transporter  33.79 
 
 
451 aa  259  8e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  35.35 
 
 
462 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1454  magnesium transporter  34.09 
 
 
447 aa  258  2e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192338  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1125  magnesium transporter  33.25 
 
 
444 aa  257  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0267  magnesium transporter  30.98 
 
 
456 aa  258  2e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000106938  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1832  magnesium transporter  35.25 
 
 
460 aa  257  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0187947  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0971  magnesium transporter  31.32 
 
 
457 aa  257  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1342  divalent cation transporter  30.54 
 
 
447 aa  256  5e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.09733  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0412  magnesium transporter  33.85 
 
 
461 aa  256  6e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2520  magnesium transporter  37.59 
 
 
454 aa  256  8e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.624288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  33.88 
 
 
450 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  32.8 
 
 
446 aa  254  3e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0382  magnesium transporter  30.7 
 
 
454 aa  253  4.0000000000000004e-66  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4147  magnesium transporter  34.81 
 
 
454 aa  251  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.235845 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3300  magnesium transporter  33.18 
 
 
457 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2786  magnesium transporter  33.92 
 
 
463 aa  251  3e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3903  magnesium transporter  34.92 
 
 
456 aa  249  9e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508399  normal  0.721995 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0320  divalent cation transporter  33.11 
 
 
460 aa  248  1e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0139413 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1801  divalent cation transporter  31.54 
 
 
460 aa  247  3e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0824  magnesium transporter  34.02 
 
 
454 aa  247  3e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1354  magnesium transporter  37.32 
 
 
456 aa  246  4e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0828283  normal  0.438937 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2099  magnesium transporter  32.44 
 
 
460 aa  246  6e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.168721  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  36.08 
 
 
473 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5759  magnesium transporter  35.1 
 
 
450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.180373 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1855  magnesium transporter  34.89 
 
 
450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647183  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  34.62 
 
 
471 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2935  magnesium transporter  30.82 
 
 
457 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1145  magnesium transporter  30.43 
 
 
457 aa  244  3e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2728  divalent cation transporter  35.71 
 
 
456 aa  244  3e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0523  magnesium transporter  36.99 
 
 
467 aa  244  3e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.461011 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1056  magnesium transporter  32.49 
 
 
457 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0801577  hitchhiker  0.0000813528 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3521  magnesium transporter  32.72 
 
 
457 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0714  magnesium transporter  34.62 
 
 
449 aa  242  7.999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0891  magnesium transporter  34.54 
 
 
449 aa  242  9e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182098 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3396  magnesium transporter  32.26 
 
 
457 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2363  magnesium transporter  31.05 
 
 
454 aa  241  2e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3299  magnesium transporter  36.76 
 
 
450 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000163374  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2058  magnesium transporter  32.89 
 
 
460 aa  241  2e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  34.28 
 
 
473 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3524  magnesium transporter  35.54 
 
 
454 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01631  Mg2+ transporter  37.13 
 
 
473 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2001  magnesium transporter  34.57 
 
 
447 aa  240  4e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  35.14 
 
 
470 aa  239  5e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1890  magnesium transporter  31.33 
 
 
460 aa  239  6.999999999999999e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4054  magnesium transporter  38.69 
 
 
441 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02891  magnesium transporter  33.1 
 
 
455 aa  238  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4087  magnesium transporter  38.69 
 
 
441 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25770  Mg2+ transporter MgtE  34.08 
 
 
462 aa  237  3e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0080  magnesium transporter  39.24 
 
 
438 aa  236  8e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.136894 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6729  magnesium transporter  35.36 
 
 
463 aa  235  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143213  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0337  MgtE integral membrane region  39.38 
 
 
351 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3944  magnesium transporter  38.23 
 
 
441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17571  Mg2+ transporter  35.96 
 
 
471 aa  235  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.161452  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3303  magnesium transporter  32.56 
 
 
461 aa  234  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0725  magnesium transporter  32.22 
 
 
484 aa  232  1e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>