More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3549 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3549  integrase catalytic region  100 
 
 		 216 aa  454  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.032093 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1128  integrase catalytic subunit  59.22 
 
 		 280 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3372  integrase catalytic region  55.62 
 
 		 321 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  48.33 
 
 		 327 aa  182  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  48.33 
 
 		 316 aa  182  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  48.04 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  48.04 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  48.04 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  48.04 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  48.04 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  48.04 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  48.04 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  48.04 
 
 		 321 aa  178  4.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5447  Integrase catalytic region  49.72 
 
 		 277 aa  176  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.681137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1054  integrase catalytic subunit  45.81 
 
 		 316 aa  174  7e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1353  integrase catalytic subunit  45.81 
 
 		 316 aa  174  7e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.4232  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1780  integrase catalytic subunit  45.81 
 
 		 316 aa  174  7e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0228632  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2400  integrase catalytic subunit  45.81 
 
 		 316 aa  174  7e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.61618  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0224  integrase catalytic subunit  45.81 
 
 		 316 aa  174  8e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1767  integrase catalytic subunit  45.81 
 
 		 316 aa  174  8e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_002978  WD0176  transposase, putative  47.16 
 
 		 320 aa  173  1.9999999999999998e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0692  Integrase catalytic region  46.03 
 
 		 330 aa  168  7e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229145  normal  0.133209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1668  Integrase catalytic region  46.03 
 
 		 330 aa  168  7e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.412192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2721  Integrase catalytic region  46.03 
 
 		 330 aa  167  8e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.562875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1875  Integrase catalytic region  45.55 
 
 		 355 aa  167  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0702445 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3258  Integrase catalytic region  45.74 
 
 		 330 aa  166  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2291  Integrase catalytic region  45.74 
 
 		 348 aa  166  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.152349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2422  Integrase catalytic region  45.74 
 
 		 330 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  44.56 
 
 		 463 aa  165  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3839  hypothetical protein  45.25 
 
 		 319 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0595051 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3743  hypothetical protein  45.25 
 
 		 319 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1814  integrase catalytic subunit  45.25 
 
 		 319 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0485004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0053  integrase catalytic subunit  45.25 
 
 		 319 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2839  integrase, catalytic region  50.68 
 
 		 153 aa  157  9e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0366  integrase, catalytic region  48.7 
 
 		 329 aa  157  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0838  integrase, catalytic region  48.7 
 
 		 286 aa  157  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204021  hitchhiker  0.00436144 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1293  integrase, catalytic region  48.7 
 
 		 329 aa  157  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345302  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2850  integrase, catalytic region  48.7 
 
 		 329 aa  157  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0952  hypothetical protein  41.34 
 
 		 320 aa  153  2e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0554  hypothetical protein  42.51 
 
 		 314 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000279647 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1273  hypothetical protein  41.98 
 
 		 314 aa  144  8.000000000000001e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0999856 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0529  integrase, catalytic core  44.44 
 
 		 259 aa  138  4.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25530  Integrase, catalytic domain-containing protein  48.03 
 
 		 265 aa  132  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1176  hypothetical protein  41.01 
 
 		 284 aa  124  9e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.118975 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33450  integrase, catalytic core  54.26 
 
 		 185 aa  118  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3472  hypothetical protein  44.12 
 
 		 170 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.119399 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2660  integrase catalytic subunit  34.3 
 
 		 323 aa  99.8  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.271661 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1424  integrase catalytic subunit  33.72 
 
 		 323 aa  95.9  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1401  integrase catalytic subunit  33.72 
 
 		 323 aa  95.9  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7791  Integrase catalytic region  37.84 
 
 		 323 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.562755  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2447  integrase catalytic subunit  34.68 
 
 		 238 aa  95.1  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1280  integrase catalytic subunit  31.98 
 
 		 463 aa  95.1  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.722165  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1251  integrase catalytic subunit  33.53 
 
 		 333 aa  93.6  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1301  integrase catalytic subunit  33.53 
 
 		 321 aa  93.6  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4152  transposase ISRme5 (copy d)  33.53 
 
 		 321 aa  93.6  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29962  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0793  putative integrase  36 
 
 		 343 aa  90.1  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.638394 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2535  integrase catalytic subunit  33.14 
 
 		 323 aa  90.1  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0021  putative integrase  36 
 
 		 332 aa  89.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468061 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7134  Integrase catalytic core  44.66 
 
 		 303 aa  87.8  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0120  hypothetical protein  31.36 
 
 		 497 aa  85.5  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2194  putative transposase  31.36 
 
 		 329 aa  85.1  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2728  putative transposase  31.36 
 
 		 441 aa  85.1  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2179  transposase  31.36 
 
 		 325 aa  84.7  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2493  transposase, putative  31.36 
 
 		 325 aa  84.7  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0917  transposase  31.36 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2250  putative transposase  31.36 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1378  putative integrase  30.77 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1782  putative integrase  30.77 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0443  integrase, catalytic region  46.75 
 
 		 83 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.818125 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3709  Integrase catalytic region  30.06 
 
 		 325 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.108327 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0344  Integrase catalytic region  30.06 
 
 		 325 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000845152  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1631  Integrase catalytic region  30.59 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3767  hypothetical protein  37.5 
 
 		 128 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4022  Integrase catalytic region  31.68 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500717  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5037  Integrase catalytic region  36.3 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0044  Integrase catalytic region  27.98 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000337574  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1393  Integrase catalytic region  27.98 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000348935  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0122  integrase, catalytic region  53.33 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0252  transposase (class I)  43.42 
 
 		 83 aa  65.5  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0801  integrase catalytic region  27.81 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5566  integrase catalytic region  27.81 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0200505  normal  0.0677233 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4870  integrase catalytic subunit  27.81 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3295  integrase catalytic subunit  27.81 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6848  integrase catalytic subunit  27.81 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0733  transposase, putative  28.49 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0573  integrase catalytic subunit  31.97 
 
 		 597 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6859  integrase catalytic region  27.81 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0984063  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0527  Integrase catalytic region  30.14 
 
 		 349 aa  59.3  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1602  Integrase catalytic region  31.97 
 
 		 607 aa  58.9  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.090134  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0458  integrase catalytic subunit  29.73 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5325  hypothetical protein  45.61 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.969651  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2654  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  normal  0.067102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2979  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.161528  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3207  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3394  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3424  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3658  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4025  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404893 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4445  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.730618 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4504  integrase catalytic subunit  28.57 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>