64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3330 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3330  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 		 194 aa  391  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252914 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1688  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  79.64 
 
 		 166 aa  254  5e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.144164 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4220  flavodoxin/nitric oxide synthase  80.98 
 
 		 165 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.681573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4330  flavodoxin/nitric oxide synthase  80.98 
 
 		 165 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal  0.0216763 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2016  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  79.04 
 
 		 166 aa  252  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2762  hypothetical protein  65.84 
 
 		 161 aa  216  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.929868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2493  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  71.34 
 
 		 174 aa  212  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000345605 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7733  oxidoreductase  70.75 
 
 		 163 aa  207  9e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3490  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  74.15 
 
 		 163 aa  205  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572882  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5761  flavodoxin/nitric oxide synthase  72.11 
 
 		 163 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.643418  normal  0.673071 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6006  flavodoxin/nitric oxide synthase  72.11 
 
 		 163 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.768135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6157  flavodoxin/nitric oxide synthase  67.97 
 
 		 193 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295986  normal  0.101429 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6666  flavodoxin/nitric oxide synthase  70.75 
 
 		 163 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6187  flavodoxin/nitric oxide synthase  70.75 
 
 		 163 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5822  flavodoxin/nitric oxide synthase  70.75 
 
 		 163 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2272  hypothetical protein  55.9 
 
 		 162 aa  164  5.9999999999999996e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0129429  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3017  multimeric flavodoxin WrbA  53.29 
 
 		 162 aa  145  5e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2210  flavodoxin  47.31 
 
 		 154 aa  138  4.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.129224  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1398  hypothetical protein  40.85 
 
 		 153 aa  113  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792672  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0567  hypothetical protein  39.39 
 
 		 154 aa  104  9e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.765091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0557  hypothetical protein  37.58 
 
 		 154 aa  101  9e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2896  hypothetical protein  39.24 
 
 		 151 aa  98.6  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2324  hypothetical protein  38.18 
 
 		 153 aa  92.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2081  multimeric flavodoxin WrbA  37.8 
 
 		 153 aa  91.7  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2109  hypothetical protein  41.6 
 
 		 150 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2155  hypothetical protein  41.6 
 
 		 150 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3354  multimeric flavodoxin WrbA  42.74 
 
 		 151 aa  89.4  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0792608  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0648  hypothetical protein  36.97 
 
 		 154 aa  86.3  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4011  hypothetical protein  34.57 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.628439  decreased coverage  0.00529167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1931  hypothetical protein  36.31 
 
 		 150 aa  80.5  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2376  hypothetical protein  35.19 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.444871  normal  0.0454888 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1429  hypothetical protein  33.87 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05610  hypothetical protein  35.22 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5173  hypothetical protein  40.35 
 
 		 152 aa  77.4  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.657133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0321  hypothetical protein  40.68 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12784  hypothetical protein  32.92 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2174  multimeric flavodoxin WrbA  33.33 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0740085  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1758  hypothetical protein  31.71 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2093  NADPH-dependent FMN reductase  32.48 
 
 		 150 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.104594 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2300  hypothetical protein  38.66 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  34.78 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  34.78 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.36 
 
 		 160 aa  53.5  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2904  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20060  hypothetical protein  32.35 
 
 		 165 aa  52.4  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565206 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0330  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.29 
 
 		 168 aa  49.3  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3607  flavodoxin/nitric oxide synthase  32 
 
 		 156 aa  48.1  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1414  hypothetical protein  32.41 
 
 		 145 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201843  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2331  hypothetical protein  39.68 
 
 		 120 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645775  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1251  flavoprotein WrbA  30.85 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.135496  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0636  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.91 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0880  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.28 
 
 		 158 aa  44.3  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  31.52 
 
 		 423 aa  44.3  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0482  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.33 
 
 		 176 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000255007  decreased coverage  0.000283878 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00380  TrpR binding protein WrbA  29.47 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2684  tryptophan repressor binding protein  37.33 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2895  hypothetical protein  43.14 
 
 		 82 aa  44.3  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4633  hypothetical protein  30.85 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0274  hypothetical protein  28.57 
 
 		 168 aa  42.7  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.367825  normal  0.693938 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1106  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.55 
 
 		 156 aa  42.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.796872  normal  0.0316992 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2190  hypothetical protein  45.1 
 
 		 86 aa  42  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.465011  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1205  flavodoxin family protein  26.53 
 
 		 157 aa  42  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1973  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.45 
 
 		 205 aa  41.6  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  26.37 
 
 		 199 aa  41.2  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>