More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0965 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0965  membrane protein  100 
 
 
210 aa  416  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000215591  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_838  hypothetical protein  96.67 
 
 
210 aa  407  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000326909  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0856  membrane protein  95.71 
 
 
210 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000027794  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1425  membrane protein  36.72 
 
 
197 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.412084  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15271  membrane protein  32.83 
 
 
197 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15131  membrane protein  37.14 
 
 
197 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_8  hypothetical protein  36.55 
 
 
212 aa  102  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2109  protein of unknown function DUF205  43.57 
 
 
200 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.119956  normal  0.406872 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0008  membrane protein  36.9 
 
 
200 aa  101  8e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2099  membrane protein  47.46 
 
 
203 aa  100  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.960995  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14881  membrane protein  31.89 
 
 
198 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0575  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  34.87 
 
 
200 aa  99  5e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0572  membrane protein  43.75 
 
 
200 aa  97.4  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1324  hypothetical protein  41.73 
 
 
195 aa  95.9  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1357  membrane protein  42.28 
 
 
232 aa  94.7  8e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0008  membrane protein  37.95 
 
 
208 aa  94.4  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1629  protein of unknown function DUF205  30.15 
 
 
203 aa  93.2  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.507494  hitchhiker  0.001161 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1493  hypothetical protein  41.41 
 
 
232 aa  92.8  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1999  protein of unknown function DUF205  35.03 
 
 
207 aa  92.8  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000645882  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05631  membrane protein  39.87 
 
 
205 aa  93.2  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1160  protein of unknown function DUF205  38.14 
 
 
201 aa  92.4  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1171  hypothetical protein  32.67 
 
 
198 aa  92.4  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0898  membrane protein  34.07 
 
 
198 aa  91.7  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1757  protein of unknown function DUF205  38.57 
 
 
198 aa  91.7  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1161  hypothetical protein  36.47 
 
 
200 aa  90.9  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1321  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  46.85 
 
 
194 aa  91.3  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17541  membrane protein  33.52 
 
 
198 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0247  protein of unknown function DUF205  40 
 
 
222 aa  89.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.491401 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1955  membrane protein  38.55 
 
 
219 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0878963  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1226  hypothetical protein  47 
 
 
188 aa  89.7  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784525  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5082  protein of unknown function DUF205  38.67 
 
 
219 aa  88.6  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1700  protein of unknown function DUF205  39.13 
 
 
204 aa  88.6  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.202165  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1778  membrane protein  38.69 
 
 
219 aa  88.2  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0375425 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1269  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.19 
 
 
231 aa  88.6  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.747048  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1788  membrane protein  38.41 
 
 
198 aa  88.2  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2057  membrane protein  44.09 
 
 
210 aa  87.4  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3050  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.91 
 
 
228 aa  87.4  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.0650966 
 
 
-
 
NC_002936  DET1445  hypothetical protein  45 
 
 
185 aa  87  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000632214  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3589  membrane protein  37.09 
 
 
226 aa  86.7  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.933986  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2642  membrane protein  33.16 
 
 
198 aa  86.3  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3274  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.54 
 
 
216 aa  85.9  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2952  membrane protein  33.71 
 
 
194 aa  85.9  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.71102  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1982  membrane protein  29.28 
 
 
198 aa  85.5  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1217  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.54 
 
 
195 aa  85.1  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2175  membrane protein  32.39 
 
 
235 aa  85.1  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1611  membrane protein  42.19 
 
 
233 aa  84.7  8e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2834  hypothetical protein  35.24 
 
 
214 aa  84.3  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1223  protein of unknown function DUF205  34.43 
 
 
192 aa  84  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.165062  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2443  membrane protein  31.25 
 
 
235 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3311  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.46 
 
 
198 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000228191  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1347  membrane protein  29.74 
 
 
196 aa  84  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0882289  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0813  membrane protein  34.06 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.979835  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3662  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  43.97 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128753  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3712  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.46 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00759588  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3399  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.46 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000706679  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3361  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.46 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000818594  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2253  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.84 
 
 
198 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0829  protein of unknown function DUF205  32.14 
 
 
220 aa  83.2  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3665  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.46 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000835645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1603  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.46 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000195206 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3615  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.46 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000137108 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3291  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.62 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511628  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1592  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.56 
 
 
197 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.827594  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4343  membrane protein  41.27 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.213593  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5952  protein of unknown function DUF205  28.57 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1111  hypothetical protein  33.18 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13811  membrane protein  33.33 
 
 
206 aa  81.3  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0924  membrane protein  31.31 
 
 
205 aa  81.3  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3624  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.71 
 
 
198 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000200164  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3630  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.71 
 
 
198 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000615777  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1339  membrane protein  29.23 
 
 
196 aa  80.1  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2058  membrane protein  33.54 
 
 
235 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1406  protein of unknown function DUF205  37.78 
 
 
200 aa  80.1  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2579  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.06 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2907  membrane protein  33.15 
 
 
226 aa  79.7  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000899467 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0684  protein of unknown function DUF205  33.51 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2581  membrane protein  32.93 
 
 
235 aa  79.3  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2130  protein of unknown function DUF205  32.54 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.183332  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3740  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.97 
 
 
215 aa  79  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2816  membrane protein  31.1 
 
 
235 aa  79  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1199  protein of unknown function DUF205  28.04 
 
 
215 aa  78.6  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0425  protein of unknown function DUF205  38.41 
 
 
195 aa  78.2  0.00000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493377  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3128  hypothetical protein  35.71 
 
 
190 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154949  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2389  hypothetical protein  29.47 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000658646  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2470  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.31 
 
 
205 aa  77.8  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0651  membrane protein  33.16 
 
 
196 aa  77.4  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.623909  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3374  hypothetical protein  35.71 
 
 
190 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2245  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  34.44 
 
 
196 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507918  normal  0.25691 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1423  protein of unknown function DUF205  36.96 
 
 
220 aa  77.4  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0982  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  27.95 
 
 
203 aa  77.8  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00892107  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0507  membrane protein  33.68 
 
 
194 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0917  protein of unknown function DUF205  34.29 
 
 
191 aa  77  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.245059  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6513  protein of unknown function DUF205  26.85 
 
 
217 aa  77  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00773794  normal  0.103654 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4194  membrane protein  35.81 
 
 
201 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2417  membrane protein  31.1 
 
 
235 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1043  hypothetical protein  32.34 
 
 
200 aa  77  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000725883  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3380  membrane protein  32.29 
 
 
195 aa  77  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000102812  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2422  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.51 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0724  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.01 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07580  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.01 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0346741 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>