More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1226 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1226  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  367  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784525  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1445  hypothetical protein  88.04 
 
 		 185 aa  282  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000632214  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1248  hypothetical protein  77.63 
 
 		 77 aa  112  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000171324  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1406  protein of unknown function DUF205  38.71 
 
 		 200 aa  104  8e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0898  membrane protein  40 
 
 		 198 aa  104  9e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1629  protein of unknown function DUF205  35.67 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.507494  hitchhiker  0.001161 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17541  membrane protein  39.35 
 
 		 198 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1788  membrane protein  50 
 
 		 198 aa  99  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3922  membrane protein  43.57 
 
 		 195 aa  95.5  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0926824  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0965  membrane protein  43.75 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000215591  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_838  hypothetical protein  43.75 
 
 		 210 aa  94  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000326909  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0856  membrane protein  43.75 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000027794  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0507  membrane protein  38.52 
 
 		 194 aa  92.8  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1357  membrane protein  43.33 
 
 		 232 aa  92.8  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1700  protein of unknown function DUF205  34.97 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.202165  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13811  membrane protein  39.83 
 
 		 206 aa  93.2  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0575  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.87 
 
 		 200 aa  92.4  3e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1493  hypothetical protein  41.6 
 
 		 232 aa  92  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1611  membrane protein  43.2 
 
 		 233 aa  90.5  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2057  membrane protein  44.92 
 
 		 210 aa  89  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1171  hypothetical protein  31.77 
 
 		 198 aa  87  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_8  hypothetical protein  35.45 
 
 		 212 aa  86.3  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02929  hypothetical protein  32.98 
 
 		 205 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00133572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0641  protein of unknown function DUF205  32.98 
 
 		 205 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210247  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02879  hypothetical protein  32.98 
 
 		 205 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00143193  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3361  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.02 
 
 		 198 aa  85.9  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000818594  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3490  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  32.98 
 
 		 205 aa  85.9  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.7848  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3237  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  32.98 
 
 		 205 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.400213  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3522  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  32.98 
 
 		 205 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.143249  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0640  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  32.98 
 
 		 205 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000218346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1757  protein of unknown function DUF205  35.33 
 
 		 198 aa  86.3  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4371  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  32.98 
 
 		 205 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3352  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  32.98 
 
 		 205 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.187945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0587  membrane protein  39.46 
 
 		 193 aa  86.3  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00102729 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3399  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.02 
 
 		 198 aa  85.5  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000706679  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3020  membrane protein  44.44 
 
 		 194 aa  85.5  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000130394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3665  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.02 
 
 		 198 aa  85.5  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000835645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3615  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.02 
 
 		 198 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000137108 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3128  hypothetical protein  41.53 
 
 		 190 aa  85.5  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154949  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2099  membrane protein  41.22 
 
 		 203 aa  85.1  5e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.960995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3374  hypothetical protein  41.53 
 
 		 190 aa  85.5  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1160  protein of unknown function DUF205  39.34 
 
 		 201 aa  85.1  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1603  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.02 
 
 		 198 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000195206 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3712  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.02 
 
 		 198 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00759588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1161  hypothetical protein  39.47 
 
 		 200 aa  85.1  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5082  protein of unknown function DUF205  36.18 
 
 		 219 aa  84.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0574  membrane protein  38.78 
 
 		 193 aa  84.3  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000985335  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0008  membrane protein  45.37 
 
 		 200 aa  84.7  8e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0684  protein of unknown function DUF205  36.59 
 
 		 186 aa  84.3  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14881  membrane protein  31.61 
 
 		 198 aa  84.3  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3467  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  31.91 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.088969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3563  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  31.91 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.299047  normal  0.098829 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0007  membrane protein  34.65 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.386788  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3393  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  31.91 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000138608  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3461  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  31.91 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0949629  normal  0.0662148 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3397  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  31.91 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0827634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0572  membrane protein  42.42 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1982  membrane protein  36.76 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2443  membrane protein  35.64 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0796  protein of unknown function DUF205  41.41 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348496  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3311  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.13 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000228191  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1223  protein of unknown function DUF205  36.67 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.165062  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1199  protein of unknown function DUF205  32.07 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1999  protein of unknown function DUF205  28.57 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000645882  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0917  protein of unknown function DUF205  35 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.245059  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05631  membrane protein  40 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3015  protein of unknown function DUF205  38.46 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.400755  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1442  hypothetical protein  39.02 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1415  hypothetical protein  39.02 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.06877  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3624  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.25 
 
 		 198 aa  81.3  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000200164  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3630  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.25 
 
 		 198 aa  81.3  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000615777  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2305  hypothetical protein  40.54 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3291  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.25 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511628  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2278  hypothetical protein  40.54 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2834  hypothetical protein  45.38 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0924  hypothetical protein  38.02 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190869  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17280  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.89 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1425  membrane protein  34.69 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.412084  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0425  protein of unknown function DUF205  31.44 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493377  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2175  membrane protein  36.05 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2253  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  42.48 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2138  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  34.16 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2109  protein of unknown function DUF205  38.33 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.119956  normal  0.406872 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15131  membrane protein  35.46 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0934  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.23 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  normal  0.582468 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2025  membrane protein  32.47 
 
 		 234 aa  78.2  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15271  membrane protein  34.75 
 
 		 197 aa  77.8  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0008  membrane protein  36.56 
 
 		 208 aa  77.8  0.00000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0104  membrane protein  36.64 
 
 		 223 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5952  protein of unknown function DUF205  31.16 
 
 		 216 aa  77.8  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3668  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  30.17 
 
 		 201 aa  77.8  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.148826  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1423  protein of unknown function DUF205  33.61 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2907  membrane protein  36.54 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000899467 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0027  membrane protein  32.74 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1043  hypothetical protein  35.48 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000725883  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2260  hypothetical protein  37.42 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1396  membrane protein  35.87 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2058  membrane protein  35.29 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0172  membrane protein  35.66 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1025  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  34.97 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.942008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>