More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0008 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0008  membrane protein  100 
 
 		 208 aa  411  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_8  hypothetical protein  92.79 
 
 		 212 aa  365  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0008  membrane protein  90.4 
 
 		 200 aa  358  4e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0965  membrane protein  37.95 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000215591  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0856  membrane protein  36.92 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000027794  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_838  hypothetical protein  36.92 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000326909  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1700  protein of unknown function DUF205  38.46 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.202165  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10540  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.56 
 
 		 208 aa  104  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1757  protein of unknown function DUF205  36.36 
 
 		 198 aa  104  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1445  hypothetical protein  39.11 
 
 		 185 aa  101  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000632214  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1406  protein of unknown function DUF205  37.16 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0898  membrane protein  36.51 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17541  membrane protein  36.51 
 
 		 198 aa  98.6  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6513  protein of unknown function DUF205  33.48 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00773794  normal  0.103654 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1199  protein of unknown function DUF205  32.24 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1592  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  34.18 
 
 		 197 aa  95.9  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.827594  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05631  membrane protein  40 
 
 		 205 aa  94.7  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1160  protein of unknown function DUF205  34.05 
 
 		 201 aa  94.7  9e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0813  membrane protein  30.62 
 
 		 200 aa  93.6  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.979835  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0575  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.66 
 
 		 200 aa  94  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0924  membrane protein  30.52 
 
 		 205 aa  93.2  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1788  membrane protein  46.09 
 
 		 198 aa  92  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1629  protein of unknown function DUF205  31.03 
 
 		 203 aa  92  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.507494  hitchhiker  0.001161 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0572  membrane protein  36.97 
 
 		 200 aa  90.9  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1217  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.46 
 
 		 195 aa  90.9  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1321  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.13 
 
 		 194 aa  90.5  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1111  hypothetical protein  27.94 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1171  hypothetical protein  39.19 
 
 		 198 aa  89.4  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1982  membrane protein  37.82 
 
 		 198 aa  89.4  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3361  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.86 
 
 		 198 aa  88.6  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000818594  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0247  protein of unknown function DUF205  33.33 
 
 		 222 aa  88.6  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.491401 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1269  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.41 
 
 		 231 aa  88.6  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.747048  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3712  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.86 
 
 		 198 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00759588  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3399  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.86 
 
 		 198 aa  88.2  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000706679  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3615  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.86 
 
 		 198 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000137108 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3665  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.86 
 
 		 198 aa  88.2  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000835645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1603  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.86 
 
 		 198 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000195206 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0507  membrane protein  37.5 
 
 		 194 aa  88.2  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1226  hypothetical protein  46.15 
 
 		 188 aa  88.2  8e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784525  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3624  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.86 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000200164  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3630  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.86 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000615777  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3311  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.86 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000228191  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2245  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  34.86 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507918  normal  0.25691 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2109  protein of unknown function DUF205  43.24 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.119956  normal  0.406872 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2579  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.91 
 
 		 197 aa  87.8  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2253  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.44 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2581  membrane protein  34.36 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1324  hypothetical protein  38.93 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0425  protein of unknown function DUF205  43.12 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493377  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2175  membrane protein  34.36 
 
 		 235 aa  86.3  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1001  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  34.63 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0144207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0781  membrane protein  29.05 
 
 		 209 aa  85.9  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000234105  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2058  membrane protein  33.74 
 
 		 235 aa  85.9  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1357  membrane protein  40.35 
 
 		 232 aa  85.9  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3274  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.61 
 
 		 216 aa  85.9  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1493  hypothetical protein  32.78 
 
 		 232 aa  85.5  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1425  membrane protein  31.28 
 
 		 197 aa  85.5  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.412084  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1509  hypothetical protein  45.05 
 
 		 215 aa  85.5  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_002936  DET1611  membrane protein  34.21 
 
 		 233 aa  85.1  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2827  protein of unknown function DUF205  34.34 
 
 		 217 aa  85.1  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5082  protein of unknown function DUF205  39.84 
 
 		 219 aa  85.1  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3272  protein of unknown function DUF205  34.34 
 
 		 217 aa  85.1  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2009  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.51 
 
 		 196 aa  84.7  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.401567 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1347  membrane protein  30 
 
 		 196 aa  84.7  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0882289  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3291  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.19 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511628  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1161  hypothetical protein  37.01 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0998  hypothetical protein  27 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5952  protein of unknown function DUF205  30.7 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0684  protein of unknown function DUF205  30.22 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1178  hypothetical protein  39.2 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14881  membrane protein  32.11 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2099  membrane protein  39.86 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.960995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2443  membrane protein  33.13 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1205  membrane protein  39.2 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1339  membrane protein  30.5 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0841  hypothetical protein  30.85 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.058622  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1223  protein of unknown function DUF205  34.59 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.165062  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1158  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.71 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000140033  normal  0.0384563 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02929  hypothetical protein  46.3 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00133572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0641  protein of unknown function DUF205  46.3 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210247  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1396  membrane protein  38.4 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0640  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.3 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000218346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2664  hypothetical protein  31.22 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0188674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3490  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.3 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.7848  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3237  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.3 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.400213  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1004  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.22 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134889  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02879  hypothetical protein  46.3 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00143193  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3352  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.3 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.187945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3522  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.3 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.143249  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4371  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.3 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15131  membrane protein  32.64 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3668  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.91 
 
 		 201 aa  81.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.148826  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2057  membrane protein  39.02 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3922  membrane protein  31.02 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0926824  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3050  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.33 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.0650966 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3128  hypothetical protein  33.55 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154949  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15271  membrane protein  32.64 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3374  hypothetical protein  33.55 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0574  membrane protein  32.14 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000985335  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4343  membrane protein  40.71 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.213593  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>