More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1493 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1493  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  458  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1611  membrane protein  89.13 
 
 		 233 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1357  membrane protein  83.98 
 
 		 232 aa  393  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1982  membrane protein  44.26 
 
 		 198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0572  membrane protein  46.85 
 
 		 200 aa  103  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2099  membrane protein  48.54 
 
 		 203 aa  102  6e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.960995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1111  hypothetical protein  45.45 
 
 		 212 aa  101  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1171  hypothetical protein  45.86 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1629  protein of unknown function DUF205  47.06 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.507494  hitchhiker  0.001161 
 
 
-
 
NC_002936  DET1396  membrane protein  41.67 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1161  hypothetical protein  42.98 
 
 		 200 aa  99  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5082  protein of unknown function DUF205  42.97 
 
 		 219 aa  98.2  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1205  membrane protein  40.91 
 
 		 216 aa  97.8  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4024  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  43.33 
 
 		 192 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1178  hypothetical protein  40.91 
 
 		 216 aa  97.8  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0898  membrane protein  45 
 
 		 198 aa  96.3  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1757  protein of unknown function DUF205  42.62 
 
 		 198 aa  96.7  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1700  protein of unknown function DUF205  41.8 
 
 		 204 aa  96.7  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.202165  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0651  membrane protein  39.49 
 
 		 196 aa  95.5  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.623909  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_838  hypothetical protein  42.97 
 
 		 210 aa  95.5  6e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000326909  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17541  membrane protein  44.17 
 
 		 198 aa  95.1  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0575  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.74 
 
 		 200 aa  95.1  9e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3662  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  46.92 
 
 		 203 aa  94.4  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1406  protein of unknown function DUF205  45.76 
 
 		 200 aa  94  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4194  membrane protein  35.98 
 
 		 201 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4343  membrane protein  42.28 
 
 		 203 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.213593  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0965  membrane protein  41.41 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000215591  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1999  protein of unknown function DUF205  40.65 
 
 		 207 aa  92.8  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000645882  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2138  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.16 
 
 		 215 aa  92.8  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5145  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.84 
 
 		 189 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2827  protein of unknown function DUF205  40.43 
 
 		 217 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3272  protein of unknown function DUF205  40.43 
 
 		 217 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1347  membrane protein  38.05 
 
 		 196 aa  92.4  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0882289  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0829  protein of unknown function DUF205  42.86 
 
 		 220 aa  92.4  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13811  membrane protein  39.23 
 
 		 206 aa  92  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3922  membrane protein  41.46 
 
 		 195 aa  91.7  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0926824  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2642  membrane protein  42.5 
 
 		 198 aa  91.7  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0856  membrane protein  41.41 
 
 		 210 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000027794  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1321  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  44.44 
 
 		 194 aa  90.1  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1788  membrane protein  42.5 
 
 		 198 aa  90.9  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4349  membrane protein  35.64 
 
 		 201 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15271  membrane protein  30.86 
 
 		 197 aa  89.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15131  membrane protein  37.4 
 
 		 197 aa  90.1  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0507  membrane protein  45.08 
 
 		 194 aa  89.4  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0813  membrane protein  38.98 
 
 		 200 aa  89.4  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.979835  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2253  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.87 
 
 		 198 aa  89.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3361  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.96 
 
 		 198 aa  89.4  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000818594  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1425  membrane protein  31.48 
 
 		 197 aa  89.4  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.412084  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1603  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.96 
 
 		 198 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000195206 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3712  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.96 
 
 		 198 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00759588  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2952  membrane protein  45.38 
 
 		 194 aa  89  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.71102  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0541  hypothetical protein  40.17 
 
 		 192 aa  89  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3399  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.96 
 
 		 198 aa  89  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000706679  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0724  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.35 
 
 		 189 aa  89  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3020  membrane protein  43.97 
 
 		 194 aa  89  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000130394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3665  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.96 
 
 		 198 aa  89  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000835645  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07580  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.35 
 
 		 189 aa  89  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0346741 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3615  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.96 
 
 		 198 aa  89  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000137108 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2109  protein of unknown function DUF205  41.67 
 
 		 200 aa  88.6  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.119956  normal  0.406872 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0425  protein of unknown function DUF205  39.23 
 
 		 195 aa  88.6  8e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493377  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1339  membrane protein  37.27 
 
 		 196 aa  88.6  8e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1616  hypothetical protein  30.26 
 
 		 202 aa  88.2  9e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10540  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.89 
 
 		 208 aa  88.2  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3311  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.96 
 
 		 198 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000228191  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4326  membrane protein  32.14 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0587  membrane protein  40.68 
 
 		 193 aa  87  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00102729 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0666  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.5 
 
 		 204 aa  87.4  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2057  membrane protein  39.53 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0574  membrane protein  41.53 
 
 		 193 aa  87  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000985335  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1445  hypothetical protein  45.45 
 
 		 185 aa  86.7  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000632214  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05631  membrane protein  44.35 
 
 		 205 aa  86.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3624  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.07 
 
 		 198 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000200164  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3630  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.07 
 
 		 198 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000615777  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4637  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.58 
 
 		 192 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.481632 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_8  hypothetical protein  34.92 
 
 		 212 aa  85.5  7e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0684  protein of unknown function DUF205  34.62 
 
 		 186 aa  85.1  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3291  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.74 
 
 		 198 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511628  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0237  protein of unknown function DUF205  37.01 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1423  protein of unknown function DUF205  35.88 
 
 		 220 aa  84.7  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0924  hypothetical protein  38.1 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190869  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1226  hypothetical protein  42.99 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784525  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0247  protein of unknown function DUF205  43.97 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.491401 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1223  protein of unknown function DUF205  37.93 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.165062  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5952  protein of unknown function DUF205  33.16 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3192  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  42.06 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4413  hypothetical protein  41.03 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1217  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.81 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1592  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.84 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.827594  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3380  membrane protein  40.83 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000102812  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0841  hypothetical protein  33.11 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.058622  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0924  membrane protein  37.3 
 
 		 205 aa  81.6  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00854  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.38 
 
 		 203 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1199  protein of unknown function DUF205  39.47 
 
 		 215 aa  81.6  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1324  hypothetical protein  38.79 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0934  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.6 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  normal  0.582468 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1269  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.68 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.747048  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1025  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.26 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.942008  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0752  protein of unknown function DUF205  40.16 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2815  protein of unknown function DUF205  44.64 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1504  hypothetical protein  35.66 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>