More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_8 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_8  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  418  1e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0008  membrane protein  89 
 
 		 200 aa  360  1e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0008  membrane protein  92.79 
 
 		 208 aa  343  8e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0965  membrane protein  36.55 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000215591  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1700  protein of unknown function DUF205  36.36 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.202165  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_838  hypothetical protein  35.03 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000326909  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0856  membrane protein  34.52 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000027794  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1757  protein of unknown function DUF205  35.64 
 
 		 198 aa  106  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1406  protein of unknown function DUF205  39.19 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10540  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  34.59 
 
 		 208 aa  101  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0898  membrane protein  39.34 
 
 		 198 aa  99.8  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17541  membrane protein  39.34 
 
 		 198 aa  99  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6513  protein of unknown function DUF205  35.92 
 
 		 217 aa  99  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00773794  normal  0.103654 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1982  membrane protein  39.84 
 
 		 198 aa  97.8  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1592  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  43.14 
 
 		 197 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.827594  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1199  protein of unknown function DUF205  30.91 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_002936  DET1445  hypothetical protein  40.88 
 
 		 185 aa  95.5  6e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000632214  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05631  membrane protein  41.4 
 
 		 205 aa  95.1  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1321  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  42.5 
 
 		 194 aa  94.7  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1217  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.71 
 
 		 195 aa  94  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1160  protein of unknown function DUF205  32.8 
 
 		 201 aa  94  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1111  hypothetical protein  40.71 
 
 		 212 aa  93.2  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0813  membrane protein  30.48 
 
 		 200 aa  93.6  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.979835  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0575  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.85 
 
 		 200 aa  93.2  3e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1611  membrane protein  36.08 
 
 		 233 aa  92  5e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1788  membrane protein  44.54 
 
 		 198 aa  92  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0684  protein of unknown function DUF205  31.87 
 
 		 186 aa  92  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1493  hypothetical protein  34.92 
 
 		 232 aa  92  6e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1324  hypothetical protein  39.6 
 
 		 195 aa  91.7  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1629  protein of unknown function DUF205  30.54 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.507494  hitchhiker  0.001161 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0572  membrane protein  38.69 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1357  membrane protein  36.18 
 
 		 232 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3399  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.82 
 
 		 198 aa  89.7  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000706679  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3361  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.82 
 
 		 198 aa  89.7  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000818594  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3665  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.82 
 
 		 198 aa  89.7  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000835645  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2175  membrane protein  35.09 
 
 		 235 aa  89.7  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2443  membrane protein  34.29 
 
 		 235 aa  89  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3624  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.82 
 
 		 198 aa  89  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000200164  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1603  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.82 
 
 		 198 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000195206 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3712  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.82 
 
 		 198 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00759588  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0247  protein of unknown function DUF205  33.33 
 
 		 222 aa  89.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.491401 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3630  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.82 
 
 		 198 aa  89  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000615777  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0924  membrane protein  30.05 
 
 		 205 aa  89.4  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3615  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.82 
 
 		 198 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000137108 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3311  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.82 
 
 		 198 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000228191  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5952  protein of unknown function DUF205  33.18 
 
 		 216 aa  88.6  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2579  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.6 
 
 		 197 aa  88.6  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0425  protein of unknown function DUF205  42.11 
 
 		 195 aa  87.4  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493377  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1425  membrane protein  31.16 
 
 		 197 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.412084  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2581  membrane protein  34.29 
 
 		 235 aa  87.8  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0781  membrane protein  38.46 
 
 		 209 aa  87.8  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000234105  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2253  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.41 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2109  protein of unknown function DUF205  41.74 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.119956  normal  0.406872 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1161  hypothetical protein  39.1 
 
 		 200 aa  87  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1171  hypothetical protein  31.98 
 
 		 198 aa  87  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2245  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  34.48 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507918  normal  0.25691 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3274  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.5 
 
 		 216 aa  86.7  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3050  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.63 
 
 		 228 aa  86.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.0650966 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2009  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.86 
 
 		 196 aa  86.7  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.401567 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1509  hypothetical protein  45.05 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1269  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.05 
 
 		 231 aa  85.9  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.747048  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1223  protein of unknown function DUF205  34.21 
 
 		 192 aa  85.9  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.165062  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2058  membrane protein  33.71 
 
 		 235 aa  85.5  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1001  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  34.45 
 
 		 203 aa  85.5  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0144207  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3128  hypothetical protein  35.95 
 
 		 190 aa  85.1  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154949  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3374  hypothetical protein  35.95 
 
 		 190 aa  85.1  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5082  protein of unknown function DUF205  38.1 
 
 		 219 aa  85.1  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3291  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.6 
 
 		 198 aa  85.1  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511628  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14881  membrane protein  30.65 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1178  hypothetical protein  38.58 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1004  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.73 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134889  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1226  hypothetical protein  43.27 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784525  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2664  hypothetical protein  31.73 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0188674  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1396  membrane protein  38.58 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1205  membrane protein  38.28 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2284  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.97 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.278877  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15271  membrane protein  30.15 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15131  membrane protein  30.65 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4343  membrane protein  41.46 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.213593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0998  hypothetical protein  25.82 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3272  protein of unknown function DUF205  37.22 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2827  protein of unknown function DUF205  37.22 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1423  protein of unknown function DUF205  30.38 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2099  membrane protein  41.84 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.960995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3380  membrane protein  31.19 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000102812  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1347  membrane protein  38.18 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0882289  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0507  membrane protein  33.16 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1643  protein of unknown function DUF205  40.17 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2138  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.52 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2057  membrane protein  39.84 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2417  membrane protein  31.43 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2816  membrane protein  31.43 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2829  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.12 
 
 		 204 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000278679  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3030  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.33 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal  0.296162 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0641  protein of unknown function DUF205  45.37 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210247  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3352  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.37 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.187945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0651  membrane protein  31.41 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.623909  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02879  hypothetical protein  45.37 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00143193  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4371  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.37 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3522  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.37 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.143249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>