More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2581 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  100 
 
 
393 aa  800    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  55.75 
 
 
394 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  55.93 
 
 
394 aa  436  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0095  dihydropteroate synthase  53.49 
 
 
396 aa  421  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0110  dihydropteroate synthase  52.71 
 
 
402 aa  412  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0154  dihydropteroate synthase  52.21 
 
 
399 aa  411  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.465574  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  70.79 
 
 
270 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0151  dihydropteroate synthase  48.85 
 
 
407 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.355211  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  46.23 
 
 
400 aa  352  8.999999999999999e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0097  dihydropteroate synthase  45.05 
 
 
412 aa  349  6e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  59.02 
 
 
277 aa  332  8e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  59.02 
 
 
280 aa  331  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  59.02 
 
 
280 aa  331  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  59.02 
 
 
280 aa  331  1e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  59.02 
 
 
280 aa  331  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  58.27 
 
 
277 aa  331  1e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  59.02 
 
 
277 aa  331  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  58.65 
 
 
280 aa  330  2e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  58.65 
 
 
277 aa  328  9e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  57.89 
 
 
286 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  58.27 
 
 
277 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  44.75 
 
 
397 aa  326  5e-88  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  58.27 
 
 
285 aa  324  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  55.56 
 
 
283 aa  319  5e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2523  dihydropteroate synthase  46.19 
 
 
413 aa  317  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.974941  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1485  dihydropteroate synthase  54.18 
 
 
284 aa  309  5.9999999999999995e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0106007  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  56.72 
 
 
269 aa  308  9e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  57.09 
 
 
269 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1603  dihydropteroate synthase  54.18 
 
 
282 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0216733  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1882  dihydropteroate synthase  56.93 
 
 
274 aa  300  3e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.747516  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1349  dihydropteroate synthase  54.24 
 
 
282 aa  298  8e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1330  dihydropteroate synthase  55.31 
 
 
274 aa  297  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.144104  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  42.01 
 
 
400 aa  288  1e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1889  dihydropteroate synthase  53.62 
 
 
290 aa  281  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000220218  hitchhiker  0.00000000634632 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1814  dihydropteroate synthase  52.87 
 
 
289 aa  271  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.690503 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0513  dihydropteroate synthase  52.49 
 
 
278 aa  266  7e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.884922 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2150  dihydropteroate synthase  52.87 
 
 
289 aa  264  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3166  dihydropteroate synthase  40.05 
 
 
418 aa  263  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00152005  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  49.43 
 
 
287 aa  263  4e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0147  dihydropteroate synthase  49.2 
 
 
257 aa  262  8.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  37.69 
 
 
397 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0602  dihydropteroate synthase  44.94 
 
 
813 aa  256  3e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5758  dihydropteroate synthase  50.19 
 
 
295 aa  256  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  47.1 
 
 
279 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  47.1 
 
 
279 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2638  dihydropteroate synthase  49.64 
 
 
278 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.578756  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1596  dihydropteroate synthase  49.64 
 
 
278 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1766  dihydropteroate synthase  52.11 
 
 
289 aa  251  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.202084  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5983  dihydropteroate synthase  51.91 
 
 
279 aa  252  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0523591  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3147  FolC bifunctional protein  40.74 
 
 
817 aa  249  4e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0120997  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  47.92 
 
 
286 aa  249  5e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0675  dihydropteroate synthase  42.51 
 
 
347 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2633  dihydropteroate synthase  50.79 
 
 
294 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160124  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1381  dihydropteroate synthase  47.58 
 
 
281 aa  246  6.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  48.12 
 
 
282 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1808  dihydropteroate synthase  52.06 
 
 
303 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.70358  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4496  dihydropteroate synthase  47.27 
 
 
283 aa  244  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3045  dihydropteroate synthase  47.69 
 
 
291 aa  243  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  47.04 
 
 
280 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  46.55 
 
 
283 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1765  dihydropteroate synthase  49.6 
 
 
285 aa  242  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.270074 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4713  dihydropteroate synthase  45.94 
 
 
810 aa  241  1e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.464706  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  44.49 
 
 
286 aa  239  5.999999999999999e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  47.58 
 
 
279 aa  238  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2044  dihydropteroate synthase  49.21 
 
 
285 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  43.84 
 
 
279 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  47.31 
 
 
280 aa  236  6e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0998  dihydropteroate synthase  48.67 
 
 
306 aa  236  7e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62850  dihydropteroate synthase  48.36 
 
 
283 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2733  dihydropteroate synthase  51.26 
 
 
284 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148953  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2233  dihydropteroate synthase  48.41 
 
 
292 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2554  dihydropteroate synthase  42.35 
 
 
840 aa  233  4.0000000000000004e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.324611  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3080  dihydropteroate synthase  46.04 
 
 
290 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.642553  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  47.31 
 
 
266 aa  231  1e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1932  dihydropteroate synthase  47.43 
 
 
392 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.36752  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  45.42 
 
 
286 aa  231  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1029  dihydropteroate synthase  48.39 
 
 
279 aa  231  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 
277 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  48.09 
 
 
278 aa  231  2e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 
277 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  49.19 
 
 
280 aa  231  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3026  dihydropteroate synthase  49.8 
 
 
285 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  45.59 
 
 
277 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  45.76 
 
 
277 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  45.79 
 
 
277 aa  231  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0995  dihydropteroate synthase  48.39 
 
 
279 aa  230  3e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5470  dihydropteroate synthase  47.27 
 
 
283 aa  230  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592135  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 
277 aa  229  5e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1075  dihydropteroate synthase  46.42 
 
 
282 aa  229  7e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  46.95 
 
 
376 aa  229  8e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1527  7,8-dihydropteroate synthase protein  43.07 
 
 
291 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  45.76 
 
 
277 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  47.58 
 
 
274 aa  228  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  46.95 
 
 
278 aa  227  2e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0773  dihydropteroate synthase  47.06 
 
 
283 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00166691  normal  0.0199876 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  45 
 
 
283 aa  228  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1412  dihydropteroate synthase  49.24 
 
 
278 aa  226  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0205  dihydropteroate synthase  47.64 
 
 
262 aa  226  4e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151744  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2076  dihydropteroate synthase  45.28 
 
 
285 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.495698  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  45.56 
 
 
282 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>