More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0389 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  100 
 
 		 323 aa  667    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  49.37 
 
 		 322 aa  311  9e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  45.48 
 
 		 355 aa  257  2e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  44.37 
 
 		 321 aa  253  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  38.87 
 
 		 323 aa  241  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  41.56 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  36.88 
 
 		 326 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  37.96 
 
 		 322 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  38.63 
 
 		 319 aa  209  4e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  38.56 
 
 		 313 aa  207  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  38.56 
 
 		 313 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  37.62 
 
 		 313 aa  202  7e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  37.62 
 
 		 313 aa  202  7e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  37.62 
 
 		 313 aa  202  7e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  36.19 
 
 		 319 aa  202  7e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  36.19 
 
 		 319 aa  202  7e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  36.48 
 
 		 337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  35.62 
 
 		 308 aa  196  5.000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  35.76 
 
 		 347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  33.54 
 
 		 323 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  36.45 
 
 		 317 aa  189  7e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4085  PfkB domain protein  35.8 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.212948  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  33.33 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  31.85 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  36.08 
 
 		 315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  35.76 
 
 		 315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  33.77 
 
 		 307 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  35.4 
 
 		 315 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1630  PfkB domain protein  38.21 
 
 		 341 aa  182  6e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  35.71 
 
 		 315 aa  182  7e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  34.75 
 
 		 306 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  34.1 
 
 		 307 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  33.44 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  37.8 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  36.19 
 
 		 320 aa  175  7e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4346  ribokinase-like domain-containing protein  36.76 
 
 		 323 aa  172  7.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.126881 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  32.01 
 
 		 320 aa  171  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  33.44 
 
 		 298 aa  169  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  32.46 
 
 		 311 aa  169  8e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  32.59 
 
 		 309 aa  168  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0291  carbohydrate kinase  37.07 
 
 		 337 aa  169  9e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01230  fructokinase  36.84 
 
 		 328 aa  168  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0230962  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  31.65 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2648  carbohydrate kinase  33.44 
 
 		 336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00340862  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  31.33 
 
 		 319 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0561  carbohydrate kinase  37.34 
 
 		 343 aa  166  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.335543 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  33.77 
 
 		 304 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  33.77 
 
 		 304 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  31.01 
 
 		 319 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  31.55 
 
 		 319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1777  PfkB domain protein  36.65 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3387  ribokinase-like domain-containing protein  35.92 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  35.44 
 
 		 315 aa  163  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  35.74 
 
 		 306 aa  163  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  30.38 
 
 		 319 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  33.33 
 
 		 314 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  33.86 
 
 		 310 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  32.92 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  33.23 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1272  fructokinase  33.13 
 
 		 338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1240  ribokinase-like domain-containing protein  32.82 
 
 		 338 aa  152  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.36269  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  34.3 
 
 		 316 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  33.33 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  33.33 
 
 		 322 aa  148  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  35.2 
 
 		 306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  34.93 
 
 		 321 aa  145  9e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  30.75 
 
 		 325 aa  143  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  29.5 
 
 		 323 aa  143  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2333  iolC protein  29.36 
 
 		 332 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2296  myo-inositol catabolism protein  29.36 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.192741  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  31.9 
 
 		 329 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2512  myo-inositol catabolism protein IolC  29.36 
 
 		 332 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2162  PfkB domain protein  34.53 
 
 		 326 aa  140  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0183703  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  28.96 
 
 		 332 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  33.75 
 
 		 316 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2734  PfkB  30.12 
 
 		 327 aa  139  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228263  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  28.75 
 
 		 332 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  30.62 
 
 		 317 aa  139  7.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0931  PfkB  31.06 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0595887  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  33.75 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  31.52 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  30.15 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  29.34 
 
 		 338 aa  136  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  28.44 
 
 		 314 aa  136  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0067  ribokinase-like domain-containing protein  28.88 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323678 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  28.88 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  33.44 
 
 		 316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  26.1 
 
 		 635 aa  132  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  32.68 
 
 		 314 aa  132  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4285  ribokinase-like domain-containing protein  29.63 
 
 		 319 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0069  ribokinase-like domain-containing protein  29.63 
 
 		 319 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518061  normal  0.0251177 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  28.19 
 
 		 642 aa  132  7.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0064  ribokinase-like domain-containing protein  29.01 
 
 		 319 aa  132  9e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00666  Sugar kinase, ribokinase family protein  32.39 
 
 		 322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  32.57 
 
 		 319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0069  ribokinase-like domain-containing protein  28.57 
 
 		 319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.615124  hitchhiker  0.0000000296005 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1204  putative carbohydrate kinase  30.4 
 
 		 338 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4660  ribokinase-like domain-containing protein  25.44 
 
 		 642 aa  129  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4711  PfkB domain protein  25.37 
 
 		 643 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00995478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>