More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3016 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3016  Integrase catalytic region  100 
 
 		 353 aa  734    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3516  Integrase catalytic region  66.96 
 
 		 350 aa  507  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5962  Integrase catalytic region  66.67 
 
 		 350 aa  504  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.454691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1724  Integrase catalytic region  64.33 
 
 		 352 aa  484  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1678  Integrase catalytic region  64.33 
 
 		 352 aa  484  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0900  Integrase catalytic region  64.33 
 
 		 352 aa  484  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2426  Integrase catalytic region  64.33 
 
 		 352 aa  484  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.523516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2742  Integrase catalytic region  64.33 
 
 		 352 aa  484  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0453535  normal  0.190345 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1750  Integrase catalytic region  64.33 
 
 		 352 aa  484  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6430  Integrase catalytic region  65.01 
 
 		 345 aa  475  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0663611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5019  Integrase catalytic region  64.33 
 
 		 344 aa  475  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.679371  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3580  integrase catalytic subunit  62.68 
 
 		 346 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0884  hypothetical protein  63.29 
 
 		 364 aa  470  1.0000000000000001e-131  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0956  hypothetical protein  63.29 
 
 		 364 aa  470  1.0000000000000001e-131  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0934  hypothetical protein  63.29 
 
 		 364 aa  470  1.0000000000000001e-131  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0345872 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3543  ISSod13, transposase  62.54 
 
 		 346 aa  457  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3880  ISSod13, transposase  62.54 
 
 		 346 aa  457  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0119  ISSod13, transposase  62.54 
 
 		 346 aa  457  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0142  ISSod13, transposase  62.54 
 
 		 346 aa  457  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0151  ISSod13, transposase  62.54 
 
 		 346 aa  457  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0434  Integrase catalytic region  60.58 
 
 		 346 aa  457  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0915  Integrase catalytic region  60.29 
 
 		 346 aa  454  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.277682  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2695  Integrase catalytic region  60.58 
 
 		 346 aa  457  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0101379  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2463  Integrase catalytic region  60.58 
 
 		 346 aa  457  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1763  integrase catalytic subunit  60.29 
 
 		 346 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2033  hypothetical protein  61.13 
 
 		 344 aa  450  1e-125  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1248  integrase catalytic subunit  59.82 
 
 		 347 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113109  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1428  integrase catalytic subunit  59.82 
 
 		 347 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1434  integrase catalytic subunit  59.82 
 
 		 347 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2096  integrase catalytic subunit  59.82 
 
 		 347 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.898918  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2098  integrase catalytic subunit  59.82 
 
 		 347 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2208  integrase catalytic subunit  59.82 
 
 		 347 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3940  integrase catalytic subunit  60.29 
 
 		 346 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2972  Integrase catalytic region  57.56 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0804741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0586  Integrase catalytic region  57.56 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0674484  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1821  Integrase catalytic region  57.56 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.304505  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1850  Integrase catalytic region  57.56 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1220  Integrase catalytic region  57.56 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0919  Integrase catalytic region  57.56 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.608605  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1479  Integrase catalytic region  57.56 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1400  Integrase catalytic region  57.56 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000187237  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1838  Integrase catalytic region  57.56 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2961  Integrase catalytic region  57.56 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2553  Integrase catalytic region  57.56 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000502236  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2676  Integrase catalytic region  57.56 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2889  Integrase catalytic region  57.56 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0567202  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2551  Integrase catalytic region  57.56 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000856867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2977  Integrase catalytic region  57.56 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1832  Integrase catalytic region  57.56 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.394112  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2690  Integrase catalytic region  57.56 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2693  Integrase catalytic region  57.56 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2149  Integrase catalytic region  57.27 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.142732  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0589  Integrase catalytic region  57.56 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.02075  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0823  Integrase catalytic region  57.56 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0338  Integrase catalytic region  57.56 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.465639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0220  Integrase catalytic region  57.56 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0409  Integrase catalytic region  57.56 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2708  Integrase catalytic region  57.56 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2685  Integrase catalytic region  57.56 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4777  integrase catalytic region  66.83 
 
 		 210 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0852  integrase catalytic subunit  41.02 
 
 		 349 aa  263  4e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.336174  normal  0.0241758 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0877  integrase catalytic subunit  41.02 
 
 		 349 aa  263  4e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1005  Integrase catalytic region  39.94 
 
 		 349 aa  256  5e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0362  integrase, catalytic region  37.88 
 
 		 337 aa  249  4e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.540687  hitchhiker  0.0000859615 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4480  integrase, catalytic region  38.28 
 
 		 357 aa  249  7e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000214093 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3878  integrase catalytic subunit  37.17 
 
 		 344 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1864  integrase catalytic subunit  36.78 
 
 		 348 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2262  integrase catalytic subunit  36.78 
 
 		 348 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.512462  normal  0.657223 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3186  integrase catalytic subunit  36.78 
 
 		 348 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3191  integrase catalytic subunit  36.78 
 
 		 348 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.826636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3733  integrase catalytic subunit  36.78 
 
 		 348 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1966  ISSod13, transposase  36.56 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00452  predicted DNA-binding transcriptional regulator  52.07 
 
 		 123 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3110  conserved hypothetical protein  52.07 
 
 		 123 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00457  hypothetical protein  52.07 
 
 		 123 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4665  integrase, catalytic region  42.96 
 
 		 155 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.599726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0552  hypothetical protein  66.18 
 
 		 86 aa  96.3  6e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000200918 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0553  putative transposase  54.55 
 
 		 107 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0575438  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17960  integrase family protein  36 
 
 		 422 aa  89.7  6e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal  0.82846 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01931  probable transposase protein, Y4bF  39.83 
 
 		 494 aa  85.1  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3007  hypothetical protein  33.15 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0627  integrase, catalytic region  55.56 
 
 		 95 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000721298  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2051  ChnZ  55.56 
 
 		 95 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3736  transposase  32.14 
 
 		 481 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1433  Integrase catalytic region  29.62 
 
 		 412 aa  79.3  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.331457  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1933  Integrase catalytic region  29.3 
 
 		 386 aa  79  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0182276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1958  Integrase catalytic region  29.3 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1954  Integrase catalytic region  29.3 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0194  Integrase catalytic region  29.3 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0249438  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4847  Integrase catalytic region  31.33 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1805  Integrase catalytic region  29.3 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1186  Integrase catalytic region  29.3 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0482  Integrase catalytic region  29.3 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.060676  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1456  Integrase catalytic region  29.39 
 
 		 394 aa  77.8  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0459  Integrase catalytic region  28.66 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0147669  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1025  Integrase catalytic region  29.3 
 
 		 426 aa  77.4  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0128  Integrase catalytic region  28.98 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000825928  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0398  Integrase catalytic region  29.3 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00305387  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24520  integrase family protein  30.87 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1238  Integrase catalytic region  28.98 
 
 		 382 aa  76.3  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00285925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>