212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1954 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0482  Integrase catalytic region  98.43 
 
 
383 aa  782    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.060676  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1433  Integrase catalytic region  96.44 
 
 
412 aa  785    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.331457  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0949  Integrase catalytic region  97.68 
 
 
346 aa  707    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000104793  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0459  Integrase catalytic region  98.42 
 
 
387 aa  781    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0147669  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1456  Integrase catalytic region  97.91 
 
 
394 aa  780    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1025  Integrase catalytic region  99.48 
 
 
426 aa  789    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1805  Integrase catalytic region  100 
 
 
433 aa  791    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0398  Integrase catalytic region  98.95 
 
 
400 aa  784    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00305387  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0194  Integrase catalytic region  99.47 
 
 
384 aa  787    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0249438  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1954  Integrase catalytic region  100 
 
 
394 aa  815    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1238  Integrase catalytic region  99.48 
 
 
382 aa  790    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00285925  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1186  Integrase catalytic region  99.48 
 
 
410 aa  790    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1933  Integrase catalytic region  100 
 
 
386 aa  789    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0182276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1958  Integrase catalytic region  100 
 
 
405 aa  792    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0128  Integrase catalytic region  99.21 
 
 
389 aa  783    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000825928  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0728  hypothetical protein  37.67 
 
 
365 aa  191  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1984  hypothetical protein  37.67 
 
 
365 aa  191  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000807908  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2075  hypothetical protein  37.67 
 
 
365 aa  191  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1974  hypothetical protein  37.67 
 
 
366 aa  191  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0479  hypothetical protein  37.67 
 
 
368 aa  191  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.475512  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1626  hypothetical protein  37.04 
 
 
202 aa  114  4.0000000000000004e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1887  hypothetical protein  34.27 
 
 
235 aa  92.8  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0428  hypothetical protein  97.5 
 
 
54 aa  82.8  0.000000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000068891  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0520  putative transposase  29.26 
 
 
327 aa  79  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.693676  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0341  putative transposase  29.26 
 
 
327 aa  79  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1950  Integrase catalytic region  31.66 
 
 
325 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3016  Integrase catalytic region  29.3 
 
 
353 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0529  Integrase catalytic region  31.76 
 
 
325 aa  77.8  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.247566  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0538  Integrase catalytic region  31.76 
 
 
325 aa  77.4  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.189416 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3516  Integrase catalytic region  26.33 
 
 
350 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359482  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5962  Integrase catalytic region  27.1 
 
 
350 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.454691  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0852  integrase catalytic subunit  27.19 
 
 
349 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.336174  normal  0.0241758 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0877  integrase catalytic subunit  27.19 
 
 
349 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120135  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5019  Integrase catalytic region  27.24 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.679371  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2972  Integrase catalytic region  26.48 
 
 
348 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0804741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2961  Integrase catalytic region  26.48 
 
 
348 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2977  Integrase catalytic region  26.48 
 
 
348 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2889  Integrase catalytic region  26.48 
 
 
348 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0567202  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0220  Integrase catalytic region  26.48 
 
 
348 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0338  Integrase catalytic region  26.48 
 
 
348 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.465639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0409  Integrase catalytic region  26.48 
 
 
348 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0586  Integrase catalytic region  26.48 
 
 
348 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0674484  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0589  Integrase catalytic region  26.48 
 
 
348 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.02075  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0823  Integrase catalytic region  26.48 
 
 
348 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0919  Integrase catalytic region  26.48 
 
 
348 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.608605  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1220  Integrase catalytic region  26.48 
 
 
348 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1400  Integrase catalytic region  26.48 
 
 
348 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000187237  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1479  Integrase catalytic region  26.48 
 
 
348 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1821  Integrase catalytic region  26.48 
 
 
348 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.304505  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1832  Integrase catalytic region  26.48 
 
 
348 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.394112  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1838  Integrase catalytic region  26.48 
 
 
348 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1850  Integrase catalytic region  26.48 
 
 
348 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2149  Integrase catalytic region  26.18 
 
 
348 aa  65.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.142732  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2551  Integrase catalytic region  26.48 
 
 
348 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000856867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2553  Integrase catalytic region  26.48 
 
 
348 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000502236  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2676  Integrase catalytic region  26.48 
 
 
348 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2685  Integrase catalytic region  26.48 
 
 
348 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2690  Integrase catalytic region  26.48 
 
 
348 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2693  Integrase catalytic region  26.48 
 
 
348 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2708  Integrase catalytic region  26.48 
 
 
348 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1005  Integrase catalytic region  27.44 
 
 
349 aa  65.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0541  putative transposase integrase  26.02 
 
 
379 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3643  putative transposase  26.02 
 
 
379 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4261  putative transposase  26.02 
 
 
379 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.234878 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4349  putative transposase  26.02 
 
 
379 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.732851  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4350  putative transposase  26.02 
 
 
379 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2520  integrase catalytic region  26.37 
 
 
320 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1248  integrase catalytic subunit  25.96 
 
 
347 aa  62.8  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113109  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1428  integrase catalytic subunit  25.96 
 
 
347 aa  62.8  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1434  integrase catalytic subunit  25.96 
 
 
347 aa  62.8  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2096  integrase catalytic subunit  25.96 
 
 
347 aa  62.8  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.898918  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2098  integrase catalytic subunit  25.96 
 
 
347 aa  62.8  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2208  integrase catalytic subunit  25.96 
 
 
347 aa  62.8  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3364  integrase catalytic region  26.01 
 
 
320 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5595  integrase catalytic region  26.01 
 
 
320 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0900  Integrase catalytic region  25.31 
 
 
352 aa  61.2  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1678  Integrase catalytic region  25.31 
 
 
352 aa  61.2  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1724  Integrase catalytic region  25.31 
 
 
352 aa  61.2  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1750  Integrase catalytic region  25.31 
 
 
352 aa  61.2  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719941  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2426  Integrase catalytic region  25.31 
 
 
352 aa  61.2  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.523516  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2742  Integrase catalytic region  25.31 
 
 
352 aa  61.2  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0453535  normal  0.190345 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4857  integrase catalytic subunit  31.29 
 
 
338 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5102  integrase catalytic subunit  31.29 
 
 
339 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3309  integrase catalytic subunit  31.29 
 
 
338 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5758  integrase catalytic subunit  31.29 
 
 
338 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0647167 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3733  Integrase catalytic region  25.83 
 
 
330 aa  57.4  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0167687  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6430  Integrase catalytic region  26.37 
 
 
345 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0663611 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5264  Integrase catalytic region  26.1 
 
 
330 aa  57.4  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3083  Integrase catalytic region  26.1 
 
 
330 aa  57  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428734  hitchhiker  0.0000289484 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0788  Integrase catalytic region  26.1 
 
 
347 aa  57  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4853  Integrase catalytic region  25.83 
 
 
330 aa  57  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0044  Integrase catalytic region  35.57 
 
 
375 aa  56.2  0.0000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000337574  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1393  Integrase catalytic region  35.57 
 
 
374 aa  56.2  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000348935  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4480  integrase, catalytic region  24.7 
 
 
357 aa  55.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000214093 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00368  Transposase  34.81 
 
 
165 aa  55.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0434  Integrase catalytic region  25.38 
 
 
346 aa  54.7  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2695  Integrase catalytic region  25.38 
 
 
346 aa  54.7  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0101379  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2463  Integrase catalytic region  25.38 
 
 
346 aa  54.7  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0362  integrase, catalytic region  24.32 
 
 
337 aa  53.9  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.540687  hitchhiker  0.0000859615 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0690  Integrase catalytic region  27.31 
 
 
321 aa  53.9  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000168341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>