More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1783 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1783  modification methylase, HemK family  100 
 
 		 281 aa  573  1.0000000000000001e-162  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09408  putative protoporphyrinogen oxidase  50.36 
 
 		 282 aa  288  6e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.506099  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5054  HemK family modification methylase  53.55 
 
 		 284 aa  287  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244317  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2176  modification methylase, HemK family  44.76 
 
 		 288 aa  236  3e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697869  normal  0.919129 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2938  modification methylase, HemK family  41.13 
 
 		 282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.557385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4319  modification methylase, HemK family  42.38 
 
 		 286 aa  212  5.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0020  HemK family modification methylase  44.27 
 
 		 285 aa  208  9e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2220  modification methylase, HemK family  38.16 
 
 		 286 aa  203  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.018393 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0202  protoporphyrinogen oxidase  41.51 
 
 		 287 aa  203  3e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0156  HemK family modification methylase  38.33 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0614  methylase of polypeptide chain release factor  46.98 
 
 		 271 aa  185  7e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0794  protoporphyrinogen oxidase  48.85 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1076  HemK family modification methylase  38.57 
 
 		 276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.260993  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1783  methylase of polypeptide chain release factor  42.08 
 
 		 330 aa  162  5.0000000000000005e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.74 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  39.35 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  39.15 
 
 		 289 aa  158  9e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0453  HemK family modification methylase  38.58 
 
 		 288 aa  156  4e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  39.83 
 
 		 301 aa  155  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.57 
 
 		 299 aa  154  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1694  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.72 
 
 		 296 aa  152  4e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.886603  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.64 
 
 		 297 aa  152  8e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  41.59 
 
 		 285 aa  149  7e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  36.04 
 
 		 280 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.64 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  35.07 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  32.26 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  37.72 
 
 		 297 aa  146  5e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  36.89 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  37.66 
 
 		 359 aa  143  3e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  36.33 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1070  modification methylase, HemK family  33.57 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.31401  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  39.72 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2985  HemK family modification methylase  33.08 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  36.36 
 
 		 282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  40 
 
 		 285 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5451  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.41 
 
 		 283 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00030744  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  36.68 
 
 		 288 aa  139  7e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  32.95 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3434  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.82 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.56 
 
 		 286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.89 
 
 		 285 aa  135  9e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5420  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.27 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.97899e-62 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  34.02 
 
 		 284 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  35.53 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5455  HemK family modification methylase  35.27 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00426366  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  35.84 
 
 		 587 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4207  modification methylase, HemK family  36.08 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5126  HemK family modification methylase  35.66 
 
 		 283 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0481456  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5177  HemK family modification methylase  35.27 
 
 		 283 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.825959  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5028  HemK family modification methylase  35.91 
 
 		 283 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5571  HemK family modification methylase  35.27 
 
 		 283 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0023749  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1772  HemK family modification methylase  37.3 
 
 		 314 aa  133  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  35.84 
 
 		 587 aa  133  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  35.17 
 
 		 278 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5506  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.27 
 
 		 283 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000117496  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2790  modification methylase, HemK family  37.27 
 
 		 280 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  34.93 
 
 		 302 aa  132  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3665  HemK family modification methylase  34.47 
 
 		 311 aa  132  9e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5501  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.98 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174977  unclonable  6.52131e-26 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  32.68 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1581  methylase of polypeptide chain release factor  37.73 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  35.57 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  34.65 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2779  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.91 
 
 		 313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.159929  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2062  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  34.65 
 
 		 277 aa  130  3e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.419255  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  29.86 
 
 		 280 aa  130  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1548  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.02 
 
 		 277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.299317 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1970  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.41 
 
 		 277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.017955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  34.68 
 
 		 274 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1912  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.02 
 
 		 277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1906  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.02 
 
 		 277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  0.396695 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  35.85 
 
 		 361 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5012  HemK family modification methylase  34.5 
 
 		 283 aa  129  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000084912  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1364  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.02 
 
 		 277 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000140112  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2336  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.83 
 
 		 276 aa  128  8.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0774  HemK family modification methylase  33.71 
 
 		 283 aa  128  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0850729 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  35.09 
 
 		 284 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2722  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.46 
 
 		 283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.87 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.59 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.531289  normal  0.236776 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  30.15 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5477  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.69 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  34.35 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  34.14 
 
 		 270 aa  127  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  36.74 
 
 		 287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1234  HemK family modification methylase  37.61 
 
 		 305 aa  126  5e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  37.93 
 
 		 285 aa  125  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1724  HemK family modification methylase  34.78 
 
 		 278 aa  125  9e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0688898  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3849  HemK family modification methylase  32.56 
 
 		 283 aa  125  9e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000350241  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2258  hypothetical protein  36.36 
 
 		 287 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0166  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.17 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  36.65 
 
 		 289 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  33.45 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  28.79 
 
 		 288 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3551  HemK family modification methylase  36.48 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2285  hypothetical protein  35.97 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1157  HemK family modification methylase  37.45 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.198451  normal  0.0970281 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  34.58 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0849  HemK family modification methylase  32.95 
 
 		 287 aa  123  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  0.576692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>