262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2075 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2075  6-phosphogluconolactonase  100 
 
 
279 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.435878  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2482  6-phosphogluconolactonase  49.62 
 
 
303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2149  6-phosphogluconolactonase  46.64 
 
 
272 aa  215  8e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0308  6-phosphogluconolactonase  44.78 
 
 
265 aa  208  9e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000090157 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1905  6-phosphogluconolactonase  44.27 
 
 
277 aa  207  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2103  6-phosphogluconolactonase  39.69 
 
 
264 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.22743  normal  0.146892 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1793  6-phosphogluconolactonase  41.98 
 
 
261 aa  179  4e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0945  6-phosphogluconolactonase  38.85 
 
 
249 aa  161  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36519  normal  0.244402 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3178  6-phosphogluconolactonase  37.69 
 
 
245 aa  159  5e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0412  6-phosphogluconolactonase  39 
 
 
245 aa  158  7e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0529  6-phosphogluconolactonase  38.61 
 
 
262 aa  159  7e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.77766  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2814  6-phosphogluconolactonase  35.91 
 
 
252 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1131  6-phosphogluconolactonase  37.84 
 
 
248 aa  149  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2618  6-phosphogluconolactonase  39.5 
 
 
241 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0053  6-phosphogluconolactonase  39.92 
 
 
242 aa  142  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5038  6-phosphogluconolactonase  35.14 
 
 
239 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.25902 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0535  6-phosphogluconolactonase  37.35 
 
 
235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797573  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2507  6-phosphogluconolactonase  44.98 
 
 
243 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1324  6-phosphogluconolactonase  36.92 
 
 
271 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.307725  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1522  6-phosphogluconolactonase  36.02 
 
 
240 aa  137  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0189067  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1674  6-phosphogluconolactonase  35.97 
 
 
241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4215  6-phosphogluconolactonase  33.96 
 
 
240 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0227099  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1455  6-phosphogluconolactonase  35.94 
 
 
236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1481  6-phosphogluconolactonase  35.94 
 
 
236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.448023  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2420  6-phosphogluconolactonase  42.98 
 
 
243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245998  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2251  6-phosphogluconolactonase  35.55 
 
 
248 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000880456  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2709  6-phosphogluconolactonase  37.13 
 
 
238 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143593  hitchhiker  0.00000000228855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1482  6-phosphogluconolactonase  33.2 
 
 
241 aa  132  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000109648  normal  0.405401 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2488  6-phosphogluconolactonase  33.46 
 
 
265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5183  6-phosphogluconolactonase  32.35 
 
 
239 aa  129  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.908662  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3023  6-phosphogluconolactonase  34.68 
 
 
240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2698  6-phosphogluconolactonase  32.06 
 
 
241 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.448278  normal  0.149935 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1440  6-phosphogluconolactonase  43.35 
 
 
243 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.217732  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4801  6-phosphogluconolactonase  34.87 
 
 
238 aa  123  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.035982  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1794  6-phosphogluconolactonase  37.27 
 
 
240 aa  122  8e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1348  6-phosphogluconolactonase  32.32 
 
 
242 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1628  6-phosphogluconolactonase  31.71 
 
 
237 aa  120  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179566  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04030  6-phosphogluconolactonase, putative  31.87 
 
 
373 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1273  6-phosphogluconolactonase  33.71 
 
 
245 aa  118  9e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169583  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0919  6-phosphogluconolactonase  31.87 
 
 
235 aa  115  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1063  6-phosphogluconolactonase  31.87 
 
 
235 aa  115  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.301741  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2720  6-phosphogluconolactonase  38.76 
 
 
252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1134  6-phosphogluconolactonase  31.2 
 
 
232 aa  113  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.488707  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2354  6-phosphogluconolactonase  31.82 
 
 
245 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.578292  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0456  6-phosphogluconolactonase  32.16 
 
 
241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.52308  normal  0.121254 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2121  6-phosphogluconolactonase  32.91 
 
 
228 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2536  6-phosphogluconolactonase  28.14 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1278  6-phosphogluconolactonase  34.75 
 
 
246 aa  108  7.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.487981  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6709  6-phosphogluconolactonase  36.93 
 
 
239 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.171628  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2308  6-phosphogluconolactonase  36.32 
 
 
241 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0267675 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00285  6-phosphogluconolactonase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02980)  35.29 
 
 
265 aa  106  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.757461 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3272  6-phosphogluconolactonase  37.89 
 
 
235 aa  105  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3094  6-phosphogluconolactonase  32.68 
 
 
256 aa  105  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257113  normal  0.068745 
 
 
-
 
NC_002620  TC0458  6-phosphogluconolactonase  27.88 
 
 
256 aa  105  8e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2007  6-phosphogluconolactonase  30.27 
 
 
261 aa  103  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.750142  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4827  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 
243 aa  102  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179164 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0923  6-phosphogluconolactonase, glucosamine-6-phosphate isomerase/deaminase  31.75 
 
 
232 aa  102  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3477  6-phosphogluconolactonase  29.76 
 
 
246 aa  102  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND03390  6-phosphogluconolactonase, putative  31.3 
 
 
294 aa  101  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.379587  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5294  6-phosphogluconolactonase  33.61 
 
 
243 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0686  6-phosphogluconolactonase  31.93 
 
 
240 aa  101  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09911  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  32.54 
 
 
237 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0857733  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_13316  predicted protein  28.8 
 
 
248 aa  100  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0957724 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5372  6-phosphogluconolactonase  34.19 
 
 
243 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.364101 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2753  6-phosphogluconolactonase  29.96 
 
 
244 aa  99.4  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0340  6-phosphogluconolactonase  30.17 
 
 
238 aa  98.2  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000175267  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3696  6-phosphogluconolactonase  36.14 
 
 
243 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683981  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2644  6-phosphogluconolactonase  33.19 
 
 
251 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1586  6-phosphogluconolactonase  27.57 
 
 
254 aa  97.8  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6018  6-phosphogluconolactonase  34.63 
 
 
257 aa  96.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal  0.688301 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1645  6-phosphogluconolactonase  30.49 
 
 
265 aa  96.3  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0205292  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1652  6-phosphogluconolactonase  32.03 
 
 
214 aa  96.3  5e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02428  hypothetical protein  30.2 
 
 
238 aa  95.1  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08121  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  28.17 
 
 
244 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1938  6-phosphogluconolactonase  34.85 
 
 
494 aa  94  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.340922  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4692  6-phosphogluconolactonase  36.41 
 
 
233 aa  94  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1976  6-phosphogluconolactonase  32.49 
 
 
225 aa  94.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.731811 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15930  6-phosphogluconolactonase  33.5 
 
 
260 aa  94.7  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1122  6-phosphogluconolactonase  34.18 
 
 
254 aa  93.2  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00568285 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3477  6-phosphogluconolactonase  29.24 
 
 
248 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16881  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  35.37 
 
 
236 aa  92  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1257  6-phosphogluconolactonase  32.76 
 
 
237 aa  91.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2716  6-phosphogluconolactonase  37.41 
 
 
244 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003324  6-phosphogluconolactonase eukaryotic type  29.41 
 
 
238 aa  91.3  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3673  6-phosphogluconolactonase  34.6 
 
 
242 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2208  6-phosphogluconolactonase  38.56 
 
 
447 aa  90.9  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000925433  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60598  Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase  30.04 
 
 
317 aa  90.1  4e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.362445  normal  0.013578 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1833  6-phosphogluconolactonase  29.5 
 
 
272 aa  89.7  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135882 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2978  6-phosphogluconolactonase  28.78 
 
 
248 aa  89.4  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08091  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  29.13 
 
 
238 aa  89.7  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.212861  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5191  6-phosphogluconolactonase  27.67 
 
 
259 aa  89  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.646883  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2242  6-phosphogluconolactonase  32.97 
 
 
262 aa  89  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000337212 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2970  6-phosphogluconolactonase  29.11 
 
 
235 aa  88.2  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.504923  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1889  6-phosphogluconolactonase  36.02 
 
 
248 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140296  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2410  6-phosphogluconolactonase  32.68 
 
 
245 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2450  6-phosphogluconolactonase  32.68 
 
 
245 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2456  6-phosphogluconolactonase  32.68 
 
 
245 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213397  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82104  6-phosphogluconolactonase-like protein  29.8 
 
 
260 aa  87.8  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.650309  normal  0.457187 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1225  6-phosphogluconolactonase  33.04 
 
 
245 aa  87.8  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.277313  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11473  6-phosphogluconolactonase  32.81 
 
 
247 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.821995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>