More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1372 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1372  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 161 aa  322  1e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0335  transcription elongation factor GreA  75.78 
 
 		 161 aa  255  2e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1684  transcription elongation factor GreA  75.16 
 
 		 161 aa  253  8e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2329  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0313  transcription elongation factor GreA  75.16 
 
 		 161 aa  252  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1310  transcription elongation factor GreA  62.73 
 
 		 162 aa  226  7e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.324095  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0327  transcription elongation factor GreA  63.29 
 
 		 161 aa  222  2e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1653  transcription elongation factor GreA  60.38 
 
 		 162 aa  214  5e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0186205  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1577  transcription elongation factor GreA  62.66 
 
 		 161 aa  214  5e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0201  transcription elongation factor GreA  53.46 
 
 		 167 aa  188  2.9999999999999997e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000273731  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1534  transcription elongation factor GreA  54.32 
 
 		 165 aa  180  8.000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  53.5 
 
 		 171 aa  174  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  51.92 
 
 		 157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  52.56 
 
 		 156 aa  169  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  53.85 
 
 		 166 aa  167  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  53.85 
 
 		 166 aa  167  7e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  53.85 
 
 		 166 aa  167  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2474  transcription elongation factor GreA  51.92 
 
 		 156 aa  166  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  51.59 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  51.28 
 
 		 156 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  51.28 
 
 		 156 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  50.99 
 
 		 152 aa  164  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  50.64 
 
 		 157 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0498  transcription elongation factor GreA  52.56 
 
 		 156 aa  163  8e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1774  transcription elongation factor GreA  50.96 
 
 		 158 aa  160  5.0000000000000005e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  52.23 
 
 		 158 aa  160  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  52.23 
 
 		 158 aa  160  7e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0584  transcription elongation factor GreA  52.23 
 
 		 158 aa  160  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125264  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1478  transcription elongation factor GreA  52.23 
 
 		 158 aa  160  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496142  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1611  transcription elongation factor GreA  52.23 
 
 		 158 aa  160  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0567  transcription elongation factor GreA  52.23 
 
 		 158 aa  160  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1284  transcription elongation factor GreA  52.23 
 
 		 158 aa  160  7e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  50.63 
 
 		 158 aa  160  9e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  51.59 
 
 		 158 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  52.23 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  53.5 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  52.23 
 
 		 158 aa  159  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  52.63 
 
 		 168 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0832  transcription elongation factor GreA  49.37 
 
 		 158 aa  159  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2118  transcription elongation factor GreA  49.36 
 
 		 157 aa  159  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  52.87 
 
 		 158 aa  158  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  52.87 
 
 		 158 aa  158  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  52.23 
 
 		 176 aa  158  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3748  transcription elongation factor GreA  49.36 
 
 		 156 aa  158  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  52.87 
 
 		 158 aa  158  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1504  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 		 157 aa  157  5e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893814  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2139  transcription elongation factor GreA  49.36 
 
 		 157 aa  157  5e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.194554 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  48.72 
 
 		 157 aa  157  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 		 203 aa  157  7e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  46.45 
 
 		 158 aa  157  7e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0700  transcription elongation factor GreA  51.59 
 
 		 159 aa  157  8e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0169393  normal  0.415235 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2751  transcription elongation factor GreA  46.15 
 
 		 168 aa  157  8e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  52.23 
 
 		 158 aa  156  9e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1725  transcription elongation factor GreA  52.87 
 
 		 158 aa  156  9e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  52.23 
 
 		 158 aa  156  9e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0813  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 		 158 aa  156  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000426484  normal  0.0245884 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  51.59 
 
 		 158 aa  156  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 		 157 aa  155  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2174  transcription elongation factor GreA  51.59 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4435  transcription elongation factor GreA  52.23 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1456  transcription elongation factor GreA  47.13 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  48.41 
 
 		 158 aa  155  3e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  46.45 
 
 		 158 aa  155  3e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 158 aa  154  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0828  transcription elongation factor GreA  47.13 
 
 		 158 aa  154  4e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0209829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  47.77 
 
 		 158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 		 158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3836  transcription elongation factor GreA  47.77 
 
 		 158 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.722398 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2033  transcription elongation factor GreA  51.59 
 
 		 158 aa  154  7e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2192  transcription elongation factor GreA  50.96 
 
 		 173 aa  154  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127913  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  46.45 
 
 		 158 aa  154  7e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1515  transcription elongation factor GreA  47.13 
 
 		 174 aa  153  8e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03046  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  153  9e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000255742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0526  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  153  9e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000858072  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3373  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  153  9e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.81015e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4503  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  153  9e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0519  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  153  9e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000161642  hitchhiker  0.00372154 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3589  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  153  9e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000874781  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3666  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  153  9e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000219579  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3477  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  153  9e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000110708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02997  hypothetical protein  49.04 
 
 		 158 aa  153  9e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000216901  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0480  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 		 158 aa  153  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000270875  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  49.02 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  49.37 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  49.68 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1369  transcription elongation factor  50.98 
 
 		 173 aa  151  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0830842  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6800  transcription elongation factor GreA  46.5 
 
 		 158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  46.2 
 
 		 159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1429  transcription elongation factor GreA  50.98 
 
 		 159 aa  152  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0984  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 		 157 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.406423  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3615  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000143014  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1629  transcription elongation factor GreA  46.15 
 
 		 162 aa  151  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.95572  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  48.68 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2876  transcription elongation factor GreA  45.86 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1522  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 158 aa  150  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  47.77 
 
 		 158 aa  150  5e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1146  transcription elongation factor GreA  47.47 
 
 		 158 aa  150  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  50.32 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4930  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  150  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41417 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  50.32 
 
 		 172 aa  150  8.999999999999999e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>