73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_09420 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_09420  YGGT family protein  100 
 
 
86 aa  167  4e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0374287  normal  0.111305 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2082  protein of unknown function YGGT  47.56 
 
 
86 aa  90.1  9e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0261764  hitchhiker  0.000000000000996106 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08930  YGGT family protein  47.56 
 
 
84 aa  85.9  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.384516  hitchhiker  0.0000000251444 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2547  protein of unknown function YGGT  46.38 
 
 
87 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167983  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3950  ylmG protein  39.24 
 
 
87 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361919  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3749  ylmG protein  39.24 
 
 
87 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0442014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3640  hypothetical protein  39.24 
 
 
87 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138235  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3657  hypothetical protein  39.24 
 
 
87 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.516535  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3912  ylmG protein  39.24 
 
 
87 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000638636 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4037  hypothetical protein  39.24 
 
 
87 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000926366  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3725  protein of unknown function YGGT  41.77 
 
 
87 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00556578  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0493  protein of unknown function YGGT  47.3 
 
 
92 aa  66.2  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.197871  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3943  ylmG protein  37.08 
 
 
87 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00794391  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3999  ylmG protein  40.51 
 
 
87 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  40.58 
 
 
87 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1036  protein of unknown function YGGT  42.03 
 
 
89 aa  63.5  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000119033  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1906  protein of unknown function YGGT  42.42 
 
 
90 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1199  cell division membrane protein  47.3 
 
 
98 aa  61.2  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3329  protein of unknown function YGGT  38.1 
 
 
98 aa  60.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0994  hypothetical protein  43.06 
 
 
92 aa  60.5  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0252519  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1433  hypothetical protein  39.76 
 
 
98 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.116879 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15401  hypothetical protein  40.74 
 
 
99 aa  57  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  44 
 
 
85 aa  56.2  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3109  hypothetical protein  42.86 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264306  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0755  ylmG protein  39.76 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.298424  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1490  cell division membrane protein  37.8 
 
 
87 aa  55.5  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08491  integral membrane protein  43.06 
 
 
102 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.321113  hitchhiker  0.00153658 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  38.81 
 
 
84 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0595  protein of unknown function YGGT  36.84 
 
 
86 aa  54.7  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102021  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0477  hypothetical protein  37.68 
 
 
99 aa  54.3  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09511  hypothetical protein  39.08 
 
 
92 aa  53.9  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.545335  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0890  hypothetical protein  39.08 
 
 
92 aa  53.9  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1237  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 
89 aa  53.9  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.371486  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09931  hypothetical protein  37.93 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  32.43 
 
 
84 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09491  hypothetical protein  38.75 
 
 
92 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.291422  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_10630  predicted protein  40 
 
 
76 aa  51.2  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  35.21 
 
 
87 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150484  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3585  protein of unknown function YGGT  46.67 
 
 
91 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0833218  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2521  protein of unknown function YGGT  46.67 
 
 
91 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4335  protein of unknown function YGGT  39.73 
 
 
97 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.680603  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2785  hypothetical protein  36.62 
 
 
193 aa  49.7  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.555098  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41246  predicted protein  47.5 
 
 
91 aa  49.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0509332  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1412  protein of unknown function YGGT  38.57 
 
 
186 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2189  protein of unknown function YGGT  36.11 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.111036 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09691  hypothetical protein  38.89 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0755134  normal  0.205345 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0297  hypothetical protein  38.89 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.475908  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1066  hypothetical protein  39.34 
 
 
98 aa  47  0.00009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1274  hypothetical protein  36.67 
 
 
96 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000722021  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1249  hypothetical protein  36.67 
 
 
96 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000234986  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  32 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2059  hypothetical protein  35.9 
 
 
91 aa  44.3  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4761  protein of unknown function YGGT  35.71 
 
 
106 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  32.79 
 
 
189 aa  43.9  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00691  hypothetical protein  39.71 
 
 
102 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.82447 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  31.34 
 
 
196 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  31.34 
 
 
196 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  29.85 
 
 
197 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1141  cell division membrane protein  36.67 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  32.84 
 
 
196 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  29.85 
 
 
197 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0014  hypothetical protein  32.81 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  26.87 
 
 
197 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  28.36 
 
 
197 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0295  protein of unknown function YGGT  32.5 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315255  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36034  predicted protein  33.33 
 
 
237 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.119025  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4199  protein of unknown function YGGT  27.16 
 
 
186 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7106  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  28.57 
 
 
101 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4087  protein of unknown function YGGT  27.16 
 
 
186 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1212  protein of unknown function YGGT  28.99 
 
 
182 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0177861 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1230  protein of unknown function YGGT  25.64 
 
 
182 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000825612  normal  0.409234 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  27.91 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1971  protein of unknown function YGGT  33.96 
 
 
84 aa  40.4  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.188366 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>