More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_08750 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_08750  acyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
386 aa  802    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.456879  normal  0.674074 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1849  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.23 
 
 
382 aa  413  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09270  acyl-CoA dehydrogenase  47.52 
 
 
388 aa  347  2e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1840  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.22 
 
 
384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0618853  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0310  putative acyl-CoA dehydrogenase  37.53 
 
 
383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.268157  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09220  acyl-CoA dehydrogenase  32.82 
 
 
385 aa  208  1e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605884  normal  0.299074 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08800  acyl-CoA dehydrogenase  32.82 
 
 
384 aa  203  4e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.320154 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1861  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.25 
 
 
394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.128157  normal  0.323931 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2878  putative acyl-CoA dehydrogenase  31.16 
 
 
391 aa  192  7e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.623288  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1468  putative acyl-CoA dehydrogenase  32.4 
 
 
383 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.283366  normal  0.0792636 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1452  putative acyl-CoA dehydrogenase  32.4 
 
 
383 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.215854  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1987  putative acyl-CoA dehydrogenase  32.4 
 
 
383 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143395  hitchhiker  0.00158428 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1816  putative acyl-CoA dehydrogenase  32.4 
 
 
383 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.297013  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1487  putative acyl-CoA dehydrogenase  32.4 
 
 
383 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00971669 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01664  predicted acyl-CoA dehydrogenase  31.54 
 
 
383 aa  186  5e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01653  hypothetical protein  31.54 
 
 
383 aa  186  5e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4600  putative acyl-CoA dehydrogenase  31.22 
 
 
380 aa  186  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1898  putative acyl-CoA dehydrogenase  31.63 
 
 
383 aa  186  6e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1947  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.63 
 
 
383 aa  186  8e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0267578  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2411  putative acyl-CoA dehydrogenase  31.63 
 
 
383 aa  186  8e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1777  putative acyl-CoA dehydrogenase  31.63 
 
 
383 aa  186  8e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1936  putative acyl-CoA dehydrogenase  31.63 
 
 
383 aa  186  8e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0137614 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1501  putative acyl-CoA dehydrogenase  31.63 
 
 
384 aa  186  8e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0210737 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1911  putative acyl-CoA dehydrogenase  31.63 
 
 
383 aa  186  8e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1388  putative acyl-CoA dehydrogenase  31.38 
 
 
383 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.977333  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1403  putative acyl-CoA dehydrogenase  31.89 
 
 
381 aa  179  9e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186623  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1021  putative acyl-CoA dehydrogenase  33.33 
 
 
383 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00043  crotonobetaine reductase subunit II, FAD-binding  34.3 
 
 
380 aa  168  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3560  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.3 
 
 
380 aa  168  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0041  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  34.3 
 
 
380 aa  168  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3616  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  34.3 
 
 
380 aa  168  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0669979 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00042  hypothetical protein  34.3 
 
 
380 aa  168  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0043  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  34.3 
 
 
380 aa  168  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0040  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  34.3 
 
 
380 aa  168  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0043  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  34.3 
 
 
380 aa  168  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0570  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  28.68 
 
 
377 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.741044  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0077  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  33.21 
 
 
380 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.214032  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0081  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  33.21 
 
 
380 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124381  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0080  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  33.21 
 
 
380 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0079  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  33.21 
 
 
380 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0999313  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0077  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  33.21 
 
 
380 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3228  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  29.24 
 
 
378 aa  159  7e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4037  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  29.24 
 
 
378 aa  153  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2675  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  29.5 
 
 
378 aa  152  7e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1318  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.36 
 
 
384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0793911 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0234  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.82 
 
 
386 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3108  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.75 
 
 
383 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  30.41 
 
 
381 aa  139  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  30.41 
 
 
381 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2136  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.19 
 
 
380 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.281355 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1103  acyl-CoA dehydrogenase-like  28.02 
 
 
381 aa  139  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  30.41 
 
 
381 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.25 
 
 
381 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  30.09 
 
 
381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  30.09 
 
 
381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  30.09 
 
 
381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0292  acyl-CoA dehydrogenase  28.8 
 
 
390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  30.09 
 
 
381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  30.09 
 
 
381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1375  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.46 
 
 
387 aa  137  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.178062  normal  0.0980928 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  30.09 
 
 
381 aa  136  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3108  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.74 
 
 
380 aa  136  5e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3307  Acyl-CoA dehydrogenase-like  30.97 
 
 
380 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1175  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.53 
 
 
381 aa  136  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2068  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.12 
 
 
385 aa  135  8e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2771  acyl-CoA dehydrogenase  28.8 
 
 
390 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1147  acyl-CoA dehydrogenase  28.8 
 
 
390 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799274  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3098  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.27 
 
 
385 aa  135  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.509328  hitchhiker  0.00141201 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2926  acyl-CoA dehydrogenase  28.8 
 
 
390 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.532316  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.01 
 
 
381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1834  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  26.7 
 
 
383 aa  135  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2192  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.87 
 
 
380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.516178  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01905  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  30.2 
 
 
397 aa  134  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0919  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.62 
 
 
383 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1665  butyryl-CoA dehydrogenase  30.87 
 
 
380 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3291  acyl-CoA dehydrogenase-like  29.44 
 
 
388 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54630  acyl-CoA dehydrogenase  31.79 
 
 
387 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169112 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4774  acyl-CoA dehydrogenase  31.79 
 
 
387 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1647  acyl-CoA dehydrogenase  30.53 
 
 
385 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.658516  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2281  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.61 
 
 
380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1750  acyl-CoA dehydrogenase  30.23 
 
 
381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.317107 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.19 
 
 
380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1804  butyryl-CoA dehydrogenase  29.79 
 
 
386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2602  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.36 
 
 
388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000586554  normal  0.488782 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2056  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.39 
 
 
377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.232194  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.19 
 
 
380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1232  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.54 
 
 
381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2599  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  28.98 
 
 
382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.279843 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4475  acyl-CoA dehydrogenase-like  28.79 
 
 
381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3931  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.55 
 
 
400 aa  130  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.543045 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2701  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.03 
 
 
386 aa  130  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.47386  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2353  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  29.55 
 
 
378 aa  129  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.663187  normal  0.71414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4530  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.83 
 
 
389 aa  129  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.335652  normal  0.412983 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4372  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.76 
 
 
374 aa  130  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.367452  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2710  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.69 
 
 
395 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3576  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.8 
 
 
380 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2082  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.11 
 
 
376 aa  129  8.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1029  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.39 
 
 
387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239684  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2780  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.59 
 
 
371 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0227253  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0714  Acyl-CoA dehydrogenase  30.81 
 
 
377 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>