41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_00460 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_00460  hypothetical protein  100 
 
 		 517 aa  1066    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0510  putative PAS/PAC sensor protein  42.86 
 
 		 532 aa  402  1e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0555672 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1509  hypothetical protein  41.87 
 
 		 411 aa  353  5e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2669  protein of unknown function DUF438  43.38 
 
 		 410 aa  347  2e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000266849  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1931  hypothetical protein  41.22 
 
 		 407 aa  327  3e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000706509  hitchhiker  0.00330228 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0141  hypothetical protein  36.41 
 
 		 398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.546361 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1718  hypothetical protein  36.32 
 
 		 485 aa  285  2.0000000000000002e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3191  hypothetical protein  39.42 
 
 		 421 aa  280  5e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3310  protein of unknown function DUF438  38.94 
 
 		 415 aa  273  6e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3352  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  41.59 
 
 		 342 aa  271  1e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2660  putative PAS/PAC sensor protein  36.12 
 
 		 395 aa  266  8.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1580  putative PAS/PAC sensor protein  35.49 
 
 		 406 aa  259  6e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1059  putative PAS/PAC sensor protein  31.41 
 
 		 536 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0658  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.64 
 
 		 521 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1669  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.78 
 
 		 540 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.80491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1165  protein of unknown function DUF438  30.75 
 
 		 491 aa  246  8e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310279  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0755  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.52 
 
 		 398 aa  238  2e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1777  putative PAS/PAC sensor protein  31.48 
 
 		 432 aa  223  8e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00046622  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1746  putative PAS/PAC sensor protein  31.48 
 
 		 433 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000524256  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1800  putative PAS/PAC sensor protein  31.48 
 
 		 433 aa  211  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0115  protein of unknown function DUF438  31.26 
 
 		 438 aa  208  2e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1545  putative PAS/PAC sensor protein  32.41 
 
 		 391 aa  186  8e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0010  hypothetical protein  26.89 
 
 		 434 aa  182  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2103  sensory box protein  29.73 
 
 		 321 aa  171  4e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0661  putative PAS/PAC sensor protein  29.1 
 
 		 322 aa  154  5e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0686  hypothetical protein  25.81 
 
 		 517 aa  153  7e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119299 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3145  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.21 
 
 		 316 aa  136  9e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0091  NADPH-dependent FMN reductase  34.85 
 
 		 416 aa  93.2  9e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0401  hypothetical protein  33.61 
 
 		 140 aa  83.2  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000776425  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0776  hypothetical protein  24.91 
 
 		 270 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000379179  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0752  hypothetical protein  23.48 
 
 		 270 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1365  Domain of unknown function DUF1858  23.66 
 
 		 295 aa  79.3  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0166  hypothetical protein  27.56 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000989028  hitchhiker  8.66499e-20 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1604  hypothetical protein  37.5 
 
 		 75 aa  58.2  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.334273  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2668  Domain of unknown function DUF1858  37.5 
 
 		 74 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.04302e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0359  sensory box protein/sigma-54 dependent transcriptional regulator  28.21 
 
 		 458 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0379318  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1719  hypothetical protein  37.14 
 
 		 80 aa  47.8  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.188427  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2551  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.57 
 
 		 202 aa  47  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2455  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.57 
 
 		 202 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.704463  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1054  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  23.28 
 
 		 463 aa  45.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91979  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0966  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.79 
 
 		 615 aa  43.5  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.595194  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>