84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0114 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0114  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 		 122 aa  245  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0228441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3650  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  52.34 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27405 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1340  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49 
 
 		 116 aa  104  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000041033 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3574  Rieske (2Fe-2S) region  44.23 
 
 		 117 aa  83.6  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.556915  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0114  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.69 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225812  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.52 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3905  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  38.68 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391138  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5912  hypothetical protein  41.12 
 
 		 155 aa  72  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2495  Rieske (2Fe-2S) domain protein  47.83 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.746892 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0838  Rieske [2Fe-2S] region  42.86 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000649112 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2849  Rieske (2Fe-2S) protein  36.96 
 
 		 118 aa  67  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1174  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.64 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0992  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.66 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  hitchhiker  0.00000000116756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4253  hypothetical protein  31.78 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.825501  normal  0.678624 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5626  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.84 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.164476 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0036  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.71 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4801  Rieske (2Fe-2S) region  39.78 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0146102  hitchhiker  0.00629459 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3370  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.62 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0252226 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5218  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.38 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3380  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.38 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0858  Rieske (2Fe-2S) region  36.19 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2735  Rieske (2Fe-2S) protein  36.96 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0390389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0676  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.71 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4083  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.36 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62360  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  40.4 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3434  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2167  hypothetical protein  43.94 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42610  hypothetical protein  36.78 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.217045  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0972  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  40.38 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000277135  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01838  rieske  30.63 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.318103  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3198  ferredoxin, 2Fe-2S  39.78 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0027175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4829  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.27 
 
 		 119 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.642068 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6068  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.26 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0959217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0589  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.51 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.03606 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5427  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  40 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0130  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.92 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4554  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.45 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000741211 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4690  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.45 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000178918 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0908  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.79 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.313285  normal  0.0276254 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1935  hypothetical protein  35.58 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5489  ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  31.3 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.121832  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0744  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.36 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.347579  hitchhiker  0.000000000639734 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.242192  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1043  hypothetical protein  31.15 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0922873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4688  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.15 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0626972  hitchhiker  0.0000000488951 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1238  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.47 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2272  Rieske (2Fe-2S) region  28.57 
 
 		 134 aa  52  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0973  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.72 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2437  Rieske (2Fe-2S) region  29.52 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.55603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0659  hypothetical protein  30.09 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.04 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00744341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0821  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.73 
 
 		 130 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1663  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.72 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4226  Rieske (2Fe-2S) protein  33.03 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0350  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.85 
 
 		 217 aa  47.4  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0994  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.63 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0990  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.63 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3141  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.85 
 
 		 120 aa  47.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1072  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.63 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  0.136055 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1710  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.51 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0741905  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1065  hypothetical protein  31.51 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0634  Rieske (2Fe-2S) region  29.63 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2190  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.14 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0622882 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1114  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.63 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2392  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.89 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.348824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2487  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.51 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00132222  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2795  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.51 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00324792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2799  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.51 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0503713  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0523  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.51 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472442  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2860  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.51 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0573473  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1810  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.51 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2008  Rieske (2Fe-2S) region  27.36 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4812  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.67 
 
 		 304 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1561  hypothetical protein  27.78 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.150485  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5661  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.71 
 
 		 512 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1176  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.99 
 
 		 125 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1987  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.16 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6409  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.71 
 
 		 512 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0971185  normal  0.172531 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5421  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.27 
 
 		 508 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1488  PfkB  30.26 
 
 		 401 aa  41.6  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1381  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3870  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  31.94 
 
 		 270 aa  40.4  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0029  Ketohexokinase  30.63 
 
 		 420 aa  40.4  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.892362  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0232  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.95 
 
 		 303 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>