More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1911 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  100 
 
 
742 aa  1514    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  48.66 
 
 
738 aa  654    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  47.87 
 
 
779 aa  646    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0142  UvrD/REP helicase  62.3 
 
 
751 aa  905    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.750575  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4600  UvrD/REP helicase  53.17 
 
 
758 aa  756    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000134986  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.57 
 
 
732 aa  655    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  48.38 
 
 
738 aa  661    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  47.55 
 
 
738 aa  655    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0389  UvrD/REP helicase  60.61 
 
 
759 aa  876    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.69 
 
 
715 aa  624  1e-177  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.78 
 
 
741 aa  616  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.42 
 
 
747 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  48.99 
 
 
785 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.14 
 
 
753 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.99 
 
 
751 aa  609  1e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.99 
 
 
747 aa  609  1e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.01 
 
 
753 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  43.27 
 
 
753 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  42.99 
 
 
751 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.99 
 
 
751 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.99 
 
 
751 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.31 
 
 
747 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.11 
 
 
725 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  47.55 
 
 
768 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.48 
 
 
742 aa  597  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.61 
 
 
741 aa  594  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.4 
 
 
730 aa  591  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.4 
 
 
730 aa  591  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.05 
 
 
729 aa  585  1e-166  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  47.2 
 
 
739 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.38 
 
 
737 aa  585  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  44.77 
 
 
744 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.92 
 
 
757 aa  578  1.0000000000000001e-163  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.97 
 
 
786 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.6 
 
 
773 aa  577  1.0000000000000001e-163  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.82 
 
 
755 aa  575  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.8 
 
 
694 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.34 
 
 
711 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  47.04 
 
 
707 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.79 
 
 
729 aa  572  1e-161  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  44.06 
 
 
762 aa  568  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.88 
 
 
766 aa  566  1e-160  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.51 
 
 
759 aa  565  1.0000000000000001e-159  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.09 
 
 
754 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.79 
 
 
751 aa  564  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.24 
 
 
768 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  42.22 
 
 
757 aa  565  1.0000000000000001e-159  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.51 
 
 
730 aa  561  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.84 
 
 
751 aa  561  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.74 
 
 
718 aa  558  1e-157  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5235  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.93 
 
 
781 aa  556  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141788 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.51 
 
 
763 aa  557  1e-157  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  47.84 
 
 
838 aa  553  1e-156  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.13 
 
 
851 aa  555  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.67 
 
 
829 aa  552  1e-156  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  41.11 
 
 
770 aa  555  1e-156  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.2 
 
 
756 aa  550  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.16 
 
 
781 aa  549  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.97 
 
 
831 aa  551  1e-155  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  43.69 
 
 
746 aa  542  1e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.8 
 
 
802 aa  543  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  48.2 
 
 
858 aa  544  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  45.84 
 
 
900 aa  540  9.999999999999999e-153  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.52 
 
 
758 aa  540  9.999999999999999e-153  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  47.29 
 
 
795 aa  540  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  44.4 
 
 
736 aa  537  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  47.07 
 
 
794 aa  536  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.87 
 
 
830 aa  536  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  44.56 
 
 
737 aa  532  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000978375  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0038  UvrD/REP helicase  39.29 
 
 
757 aa  533  1e-150  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.05 
 
 
837 aa  533  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.03 
 
 
765 aa  533  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0059  UvrD/REP helicase  43.89 
 
 
731 aa  532  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5097000000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1525  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.69 
 
 
772 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0076  UvrD/REP helicase  43.58 
 
 
732 aa  530  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111848  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28230  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.12 
 
 
857 aa  526  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.81 
 
 
748 aa  528  1e-148  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  44.54 
 
 
771 aa  523  1e-147  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.84 
 
 
858 aa  525  1e-147  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  41.62 
 
 
772 aa  523  1e-147  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.56 
 
 
806 aa  521  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.45 
 
 
1023 aa  520  1e-146  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.09 
 
 
762 aa  521  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0453  DNA helicase II  41.4 
 
 
735 aa  520  1e-146  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.723252  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  39.74 
 
 
749 aa  520  1e-146  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3593  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.43 
 
 
797 aa  519  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.420917  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  44.74 
 
 
807 aa  518  1.0000000000000001e-145  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  39.36 
 
 
731 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4710  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.11 
 
 
784 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0382  UvrD/REP helicase  39.78 
 
 
812 aa  514  1e-144  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.264262  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.32 
 
 
833 aa  513  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  40.67 
 
 
741 aa  513  1e-144  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0674  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.44 
 
 
734 aa  513  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  41.11 
 
 
743 aa  513  1e-144  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  45.33 
 
 
678 aa  511  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4330  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.2 
 
 
785 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.82343  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1258  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.32 
 
 
864 aa  509  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.887597  normal  0.553101 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2537  UvrD/REP helicase  44.7 
 
 
672 aa  509  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.423083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4416  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.2 
 
 
785 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.464468  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4873  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.37 
 
 
775 aa  511  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222415  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>