More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1725 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  68.22 
 
 
478 aa  661    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  68.22 
 
 
478 aa  664    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1725  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
472 aa  968    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3108  cysteinyl-tRNA synthetase  62.58 
 
 
466 aa  607  9.999999999999999e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00597205  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0055  cysteinyl-tRNA synthetase  53.3 
 
 
457 aa  508  1e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0061  cysteinyl-tRNA synthetase  53.21 
 
 
458 aa  506  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_61  cysteinyl-tRNA synthetase  52.78 
 
 
457 aa  505  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1829  cysteinyl-tRNA synthetase  52.34 
 
 
453 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 
466 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 
487 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 
476 aa  450  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 
468 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 
466 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 
466 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 
466 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 
477 aa  437  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 
493 aa  435  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 
474 aa  432  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 
465 aa  432  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 
468 aa  433  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 
486 aa  430  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 
500 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 
481 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3718  cysteinyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 
486 aa  426  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 
484 aa  427  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 
474 aa  422  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 
461 aa  422  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 
470 aa  424  1e-117  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
465 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
465 aa  420  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
465 aa  420  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1109  cysteinyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 
488 aa  421  1e-116  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.98105  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 
456 aa  419  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 
481 aa  421  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 
485 aa  421  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
465 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
465 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2442  cysteinyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 
517 aa  421  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  46.75 
 
 
487 aa  419  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 
493 aa  421  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 
465 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0679  cysteinyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 
470 aa  416  9.999999999999999e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 
485 aa  415  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 
455 aa  417  9.999999999999999e-116  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
465 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 
486 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0208  cysteinyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 
460 aa  412  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 
465 aa  415  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 
480 aa  412  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 
456 aa  413  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 
476 aa  412  1e-114  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 
466 aa  414  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0210  cysteinyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 
460 aa  412  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0471  cysteinyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
484 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361627  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0458  cysteinyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
484 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1662  cysteinyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 
478 aa  412  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.69895  normal  0.620733 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 
465 aa  412  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 
494 aa  413  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 
478 aa  413  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 
460 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 
480 aa  414  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 
465 aa  409  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 
476 aa  411  1e-113  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 
460 aa  410  1e-113  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 
479 aa  409  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 
476 aa  409  1e-113  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0170  cysteinyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 
466 aa  406  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.183538  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 
465 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 
458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 
459 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 
459 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 
466 aa  406  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 
466 aa  406  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 
459 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 
490 aa  405  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 
459 aa  402  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0064  cysteinyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 
469 aa  404  1e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00940017  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 
461 aa  402  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 
459 aa  403  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 
459 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 
459 aa  405  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 
461 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 
461 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 
494 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 
470 aa  404  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0710  cysteinyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 
486 aa  400  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 
469 aa  400  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1902  cysteinyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 
454 aa  401  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.478316  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 
459 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 
489 aa  401  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.993734 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 
461 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 
459 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 
460 aa  396  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 
465 aa  396  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 
460 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 
461 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 
455 aa  392  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2496  cysteinyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 
482 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.499432  decreased coverage  0.000437171 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1376  cysteinyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 
479 aa  394  1e-108  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.0031117  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0902  cysteinyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 
474 aa  395  1e-108  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>