27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8161 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8161  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
358 aa  724    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6240  GDSL family lipase  49.69 
 
 
329 aa  295  7e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0173  lipolytic protein G-D-S-L family  37.29 
 
 
340 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0370  hypothetical protein  30.22 
 
 
393 aa  102  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3064  hypothetical protein  30.45 
 
 
386 aa  97.1  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0823748  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19400  hypothetical protein  29.18 
 
 
392 aa  95.5  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0963  hypothetical protein  26.99 
 
 
382 aa  92.8  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6201  hypothetical protein  29.85 
 
 
384 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196409  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2001  hypothetical protein  29.67 
 
 
394 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2261  hypothetical protein  28.57 
 
 
394 aa  81.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.290872  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2620  hypothetical protein  27.44 
 
 
413 aa  79.7  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.583379  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3572  hypothetical protein  28.1 
 
 
368 aa  79  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0629416  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2366  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  25.13 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00890776  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0092  lipolytic protein G-D-S-L family  32.64 
 
 
338 aa  67  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1387  hypothetical protein  25.14 
 
 
358 aa  62.8  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.585721  normal  0.143708 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2682  lipolytic protein G-D-S-L family  21.53 
 
 
593 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.825886 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1005  hypothetical protein  32.18 
 
 
338 aa  59.7  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0450  lipolytic protein G-D-S-L family  23.64 
 
 
362 aa  56.6  0.0000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1504  hypothetical protein  25.12 
 
 
362 aa  56.2  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.232931  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3977  lipolytic protein G-D-S-L family  23.08 
 
 
593 aa  52.8  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410599  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2940  hypothetical protein  20.73 
 
 
368 aa  50.1  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224706  normal  0.459011 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2781  hypothetical protein  27.75 
 
 
341 aa  48.9  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1168  hypothetical protein  25.97 
 
 
342 aa  46.6  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2577  lipolytic protein G-D-S-L family  24.22 
 
 
681 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0772  GDSL family lipase  25.4 
 
 
201 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3393  lipolytic protein G-D-S-L family  32.52 
 
 
209 aa  43.9  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0644196  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2162  lipolytic protein G-D-S-L family  22.17 
 
 
436 aa  43.1  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>