24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0173 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0173  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
340 aa  671    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0370  hypothetical protein  40.68 
 
 
393 aa  162  7e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6201  hypothetical protein  40.08 
 
 
384 aa  159  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196409  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0963  hypothetical protein  34.83 
 
 
382 aa  152  8e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3064  hypothetical protein  39.51 
 
 
386 aa  144  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0823748  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2001  hypothetical protein  32.53 
 
 
394 aa  132  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19400  hypothetical protein  29.86 
 
 
392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2261  hypothetical protein  36.07 
 
 
394 aa  129  8.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.290872  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2620  hypothetical protein  30.53 
 
 
413 aa  123  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.583379  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6240  GDSL family lipase  32.78 
 
 
329 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8161  lipolytic protein G-D-S-L family  37.57 
 
 
358 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1168  hypothetical protein  31.67 
 
 
342 aa  79.3  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0092  lipolytic protein G-D-S-L family  33.16 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1504  hypothetical protein  25.96 
 
 
362 aa  67  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.232931  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3898  hypothetical protein  29.3 
 
 
341 aa  67  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00564411  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3572  hypothetical protein  23.65 
 
 
368 aa  59.3  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0629416  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2781  hypothetical protein  29.95 
 
 
341 aa  58.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2162  lipolytic protein G-D-S-L family  22.68 
 
 
436 aa  53.5  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0450  lipolytic protein G-D-S-L family  23.6 
 
 
362 aa  52.8  0.000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1387  hypothetical protein  21.33 
 
 
358 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.585721  normal  0.143708 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2366  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  23.66 
 
 
376 aa  51.6  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00890776  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1544  lipolytic protein G-D-S-L family  23.27 
 
 
260 aa  48.5  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158238  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3977  lipolytic protein G-D-S-L family  24.28 
 
 
593 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410599  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1069  lipolytic protein G-D-S-L family  25.85 
 
 
244 aa  45.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>