17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2001 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2001  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  781    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2620  hypothetical protein  70.5 
 
 		 413 aa  509  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.583379  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19400  hypothetical protein  66.05 
 
 		 392 aa  500  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0963  hypothetical protein  65.54 
 
 		 382 aa  481  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3064  hypothetical protein  58.42 
 
 		 386 aa  414  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0823748  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6201  hypothetical protein  53.17 
 
 		 384 aa  340  2e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2261  hypothetical protein  49.05 
 
 		 394 aa  317  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.290872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0370  hypothetical protein  44.22 
 
 		 393 aa  264  3e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0173  lipolytic protein G-D-S-L family  31.54 
 
 		 340 aa  127  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8161  lipolytic protein G-D-S-L family  29.67 
 
 		 358 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6240  GDSL family lipase  28.97 
 
 		 329 aa  73.9  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1005  hypothetical protein  28.26 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0092  lipolytic protein G-D-S-L family  29.19 
 
 		 338 aa  62  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2781  hypothetical protein  28.57 
 
 		 341 aa  53.5  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1387  hypothetical protein  21.28 
 
 		 358 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.585721  normal  0.143708 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2366  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  28.67 
 
 		 376 aa  49.7  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00890776  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1504  hypothetical protein  28.93 
 
 		 362 aa  47  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.232931  normal  0.12901 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>