23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1504 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1504  hypothetical protein  100 
 
 
362 aa  746    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.232931  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1387  hypothetical protein  37.95 
 
 
358 aa  236  6e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.585721  normal  0.143708 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3977  lipolytic protein G-D-S-L family  33.78 
 
 
593 aa  170  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410599  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2682  lipolytic protein G-D-S-L family  30.93 
 
 
593 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.825886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2940  hypothetical protein  30.41 
 
 
368 aa  152  8e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224706  normal  0.459011 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3572  hypothetical protein  30.16 
 
 
368 aa  133  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0629416  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6240  GDSL family lipase  28.8 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0173  lipolytic protein G-D-S-L family  26.98 
 
 
340 aa  64.7  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2781  hypothetical protein  25.89 
 
 
341 aa  63.2  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1168  hypothetical protein  25.63 
 
 
342 aa  57  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8161  lipolytic protein G-D-S-L family  25.12 
 
 
358 aa  56.6  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3064  hypothetical protein  28.08 
 
 
386 aa  55.8  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0823748  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0092  lipolytic protein G-D-S-L family  26.29 
 
 
338 aa  55.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3898  hypothetical protein  25.13 
 
 
341 aa  54.7  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00564411  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19400  hypothetical protein  27.66 
 
 
392 aa  52.8  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1005  hypothetical protein  25.96 
 
 
338 aa  52.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0370  hypothetical protein  32.08 
 
 
393 aa  50.8  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2989  GDSL family lipase  26.15 
 
 
203 aa  48.9  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.816827  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0963  hypothetical protein  30.39 
 
 
382 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2001  hypothetical protein  28.93 
 
 
394 aa  47  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0450  lipolytic protein G-D-S-L family  38.64 
 
 
362 aa  45.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6201  hypothetical protein  24.1 
 
 
384 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196409  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5710  lipolytic protein G-D-S-L family  23.83 
 
 
249 aa  42.7  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80532  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>