20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3572 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3572  hypothetical protein  100 
 
 
368 aa  766    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0629416  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1504  hypothetical protein  30.16 
 
 
362 aa  133  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.232931  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2940  hypothetical protein  27.73 
 
 
368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224706  normal  0.459011 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2682  lipolytic protein G-D-S-L family  28.66 
 
 
593 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.825886 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3977  lipolytic protein G-D-S-L family  27.93 
 
 
593 aa  122  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410599  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1387  hypothetical protein  26.71 
 
 
358 aa  113  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.585721  normal  0.143708 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8161  lipolytic protein G-D-S-L family  28.1 
 
 
358 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6240  GDSL family lipase  29.38 
 
 
329 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0092  lipolytic protein G-D-S-L family  26.26 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6201  hypothetical protein  26.86 
 
 
384 aa  69.3  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196409  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2781  hypothetical protein  25.87 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1005  hypothetical protein  27.5 
 
 
338 aa  60.5  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0173  lipolytic protein G-D-S-L family  24.44 
 
 
340 aa  56.2  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1168  hypothetical protein  25.73 
 
 
342 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3064  hypothetical protein  22.27 
 
 
386 aa  50.8  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0823748  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0370  hypothetical protein  23.61 
 
 
393 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2261  hypothetical protein  24.04 
 
 
394 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.290872  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3898  hypothetical protein  23.56 
 
 
341 aa  46.6  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00564411  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0963  hypothetical protein  22.54 
 
 
382 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19400  hypothetical protein  23.31 
 
 
392 aa  44.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>