17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2261 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2261  hypothetical protein  100 
 
 
394 aa  788    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.290872  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19400  hypothetical protein  47.62 
 
 
392 aa  324  1e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0963  hypothetical protein  48.11 
 
 
382 aa  319  5e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2001  hypothetical protein  49.05 
 
 
394 aa  317  2e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2620  hypothetical protein  48.01 
 
 
413 aa  316  5e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.583379  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3064  hypothetical protein  45.6 
 
 
386 aa  280  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0823748  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6201  hypothetical protein  43.13 
 
 
384 aa  252  8.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196409  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0370  hypothetical protein  41.93 
 
 
393 aa  238  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0173  lipolytic protein G-D-S-L family  36.07 
 
 
340 aa  120  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6240  GDSL family lipase  29.67 
 
 
329 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8161  lipolytic protein G-D-S-L family  28.57 
 
 
358 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0092  lipolytic protein G-D-S-L family  28.24 
 
 
338 aa  55.5  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1005  hypothetical protein  32.08 
 
 
338 aa  49.3  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3572  hypothetical protein  24.04 
 
 
368 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0629416  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2366  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  21.62 
 
 
376 aa  48.5  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00890776  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1387  hypothetical protein  23.49 
 
 
358 aa  44.3  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.585721  normal  0.143708 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3977  lipolytic protein G-D-S-L family  24.64 
 
 
593 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410599  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>