15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2620 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2620  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  816    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.583379  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2001  hypothetical protein  70.5 
 
 		 394 aa  520  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19400  hypothetical protein  61.98 
 
 		 392 aa  462  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0963  hypothetical protein  60.26 
 
 		 382 aa  452  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3064  hypothetical protein  57.11 
 
 		 386 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0823748  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6201  hypothetical protein  50.91 
 
 		 384 aa  333  3e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2261  hypothetical protein  48.01 
 
 		 394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.290872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0370  hypothetical protein  46.61 
 
 		 393 aa  269  7e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0173  lipolytic protein G-D-S-L family  30.26 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8161  lipolytic protein G-D-S-L family  27.61 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6240  GDSL family lipase  30.23 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0092  lipolytic protein G-D-S-L family  26.77 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1005  hypothetical protein  28.32 
 
 		 338 aa  52.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1387  hypothetical protein  19.07 
 
 		 358 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.585721  normal  0.143708 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2781  hypothetical protein  26.92 
 
 		 341 aa  43.5  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>