29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6240 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6240  GDSL family lipase  100 
 
 		 329 aa  645    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8161  lipolytic protein G-D-S-L family  49.69 
 
 		 358 aa  295  6e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0173  lipolytic protein G-D-S-L family  31.77 
 
 		 340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0370  hypothetical protein  30.18 
 
 		 393 aa  96.3  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2261  hypothetical protein  29.67 
 
 		 394 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.290872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3064  hypothetical protein  28.14 
 
 		 386 aa  80.9  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0823748  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19400  hypothetical protein  28.63 
 
 		 392 aa  80.5  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3977  lipolytic protein G-D-S-L family  25.39 
 
 		 593 aa  77  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6201  hypothetical protein  26.8 
 
 		 384 aa  76.3  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3572  hypothetical protein  29.38 
 
 		 368 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0629416  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2940  hypothetical protein  24.27 
 
 		 368 aa  74.7  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224706  normal  0.459011 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2001  hypothetical protein  28.97 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0963  hypothetical protein  30.54 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0450  lipolytic protein G-D-S-L family  26.67 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1504  hypothetical protein  28.8 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.232931  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0092  lipolytic protein G-D-S-L family  31.13 
 
 		 338 aa  70.9  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2620  hypothetical protein  35.04 
 
 		 413 aa  69.3  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.583379  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2366  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  26.98 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00890776  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1005  hypothetical protein  32.64 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2781  hypothetical protein  29.25 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1387  hypothetical protein  23.53 
 
 		 358 aa  60.5  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.585721  normal  0.143708 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1168  hypothetical protein  27.89 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2682  lipolytic protein G-D-S-L family  24.89 
 
 		 593 aa  57.4  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.825886 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3898  hypothetical protein  28.06 
 
 		 341 aa  49.3  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00564411  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1651  GDSL family lipase  27 
 
 		 253 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3296  lipolytic protein G-D-S-L family  26.05 
 
 		 227 aa  47  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0413937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0366  phage minor structural protein  24.02 
 
 		 628 aa  43.5  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0357  phage minor structural protein  24.02 
 
 		 628 aa  43.5  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2989  GDSL family lipase  29.44 
 
 		 203 aa  42.7  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.816827  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>