18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0963 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0963  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  751    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2001  hypothetical protein  65.54 
 
 		 394 aa  481  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2620  hypothetical protein  60.26 
 
 		 413 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.583379  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19400  hypothetical protein  55.53 
 
 		 392 aa  415  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3064  hypothetical protein  56.05 
 
 		 386 aa  392  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0823748  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2261  hypothetical protein  48.11 
 
 		 394 aa  319  5e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.290872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6201  hypothetical protein  46.6 
 
 		 384 aa  296  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0370  hypothetical protein  45.6 
 
 		 393 aa  252  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0173  lipolytic protein G-D-S-L family  35.11 
 
 		 340 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8161  lipolytic protein G-D-S-L family  26.99 
 
 		 358 aa  92.8  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6240  GDSL family lipase  30.54 
 
 		 329 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1387  hypothetical protein  24.15 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.585721  normal  0.143708 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0092  lipolytic protein G-D-S-L family  28.46 
 
 		 338 aa  58.9  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1005  hypothetical protein  34.29 
 
 		 338 aa  52.8  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1504  hypothetical protein  30.39 
 
 		 362 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.232931  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2781  hypothetical protein  28.16 
 
 		 341 aa  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2366  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  28.8 
 
 		 376 aa  46.6  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00890776  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3572  hypothetical protein  22.54 
 
 		 368 aa  45.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0629416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>