18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6201 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6201  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  769    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2001  hypothetical protein  53.17 
 
 		 394 aa  340  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2620  hypothetical protein  50.91 
 
 		 413 aa  325  7e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.583379  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19400  hypothetical protein  46.37 
 
 		 392 aa  301  2e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0963  hypothetical protein  46.6 
 
 		 382 aa  296  3e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3064  hypothetical protein  43.57 
 
 		 386 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0823748  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0370  hypothetical protein  44.96 
 
 		 393 aa  260  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2261  hypothetical protein  43.13 
 
 		 394 aa  252  8.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.290872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0173  lipolytic protein G-D-S-L family  39.42 
 
 		 340 aa  153  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8161  lipolytic protein G-D-S-L family  29.85 
 
 		 358 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6240  GDSL family lipase  26.8 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1005  hypothetical protein  29.5 
 
 		 338 aa  68.9  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3572  hypothetical protein  26.86 
 
 		 368 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0629416  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0092  lipolytic protein G-D-S-L family  28.87 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1168  hypothetical protein  25.79 
 
 		 342 aa  50.8  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1387  hypothetical protein  23.84 
 
 		 358 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.585721  normal  0.143708 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2781  hypothetical protein  26.17 
 
 		 341 aa  47.8  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1504  hypothetical protein  24.1 
 
 		 362 aa  43.5  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.232931  normal  0.12901 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>