More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4106 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4106  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
536 aa  1099    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15738  normal  0.0839405 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4354  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  59 
 
 
516 aa  607  9.999999999999999e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2127  monooxygenase FAD-binding protein  55.66 
 
 
524 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00953551  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2129  FAD dependent oxidoreductase  57.58 
 
 
517 aa  557  1e-157  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.788233  normal  0.83266 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4033  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  55.02 
 
 
527 aa  542  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909721  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4268  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.68 
 
 
527 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9081  Foxred2; FAD-dependent oxidoreductase domain containing 2  42.4 
 
 
532 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.646835  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1839  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.56 
 
 
528 aa  359  6e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.918547  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0546  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26 
 
 
348 aa  74.3  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1781  cyclohexanone monooxygenase  30.14 
 
 
544 aa  70.9  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.177006 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1860  FAD dependent oxidoreductase  29.77 
 
 
554 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135048  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0813  cyclohexanone monooxygenase  27.35 
 
 
543 aa  67  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0322706  normal  0.777116 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.92 
 
 
362 aa  67  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319709  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2822  putative flavin-binding monooxygenase involved in arsenic resistance  30.47 
 
 
364 aa  65.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300735  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3867  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 
380 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0238024 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0923  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.54 
 
 
399 aa  65.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1220  flavin-containing monooxygenase FMO  29.22 
 
 
552 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.366472  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2142  flavin-containing monooxygenase  28.64 
 
 
442 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23479  normal  0.438077 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0607  cyclohexanone monooxygenase  27.65 
 
 
550 aa  65.1  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195368 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7142  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 
555 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.47055  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0128  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.19 
 
 
364 aa  64.7  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000127351  hitchhiker  0.0000782873 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5461  flavin-containing monooxygenase FMO  27.44 
 
 
530 aa  64.3  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2176  cyclohexanone monooxygenase  29.86 
 
 
559 aa  63.5  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.665097  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1490  putative monooxygenase  27.83 
 
 
542 aa  63.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.211285  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1852  flavin-containing monooxygenase FMO  30.66 
 
 
378 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25 
 
 
377 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0500  cyclohexanone monooxygenase  26.51 
 
 
548 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0511  cyclohexanone monooxygenase  26.51 
 
 
548 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.016866  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0522  cyclohexanone monooxygenase  26.51 
 
 
548 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.430737  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2048  hypothetical protein  27.78 
 
 
419 aa  60.8  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02550  potassium transporter (Trk family)  22.76 
 
 
343 aa  60.8  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2147  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.08 
 
 
331 aa  60.8  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00308891  normal  0.0129855 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2590  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.16 
 
 
378 aa  60.8  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000048825 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3253  hypothetical protein  24.5 
 
 
347 aa  60.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0911616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3508  hypothetical protein  24.5 
 
 
347 aa  60.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3226  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  24.5 
 
 
347 aa  60.5  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00126129  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0579  cyclohexanone monooxygenase  26.63 
 
 
559 aa  60.5  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000280037 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3468  hypothetical protein  24.5 
 
 
347 aa  60.5  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0898  steroid monooxygenase  27.32 
 
 
539 aa  60.1  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0124072  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1063  FAD dependent oxidoreductase  30.11 
 
 
419 aa  60.1  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3163  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class II  23.65 
 
 
347 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1553  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.1 
 
 
438 aa  58.9  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.371983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0320  FAD dependent oxidoreductase  28.04 
 
 
543 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0643133  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0491  putative secreted protein  24.79 
 
 
442 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.557895  hitchhiker  0.0044003 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0330  FAD dependent oxidoreductase  28.04 
 
 
540 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.282473 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1422  Flavin-containing monooxygenase  25.58 
 
 
434 aa  58.5  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00027  steroid monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00440)  23.47 
 
 
544 aa  57.8  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0766369  normal  0.112462 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3479  hypothetical protein  24.51 
 
 
347 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0600523  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2758  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.4 
 
 
745 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202283  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3388  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  25 
 
 
352 aa  58.2  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18210  Predicted flavoprotein involved in K+ transport  32.08 
 
 
401 aa  57.8  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3374  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.26 
 
 
335 aa  57.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3000  glutathione-disulfide reductase  24.93 
 
 
451 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.637847  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2852  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.6 
 
 
748 aa  57.4  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0132054  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3452  hypothetical protein  23.81 
 
 
347 aa  57.4  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.749706  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2894  cyclohexanone monooxygenase  29.19 
 
 
536 aa  57  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293401  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5297  FAD dependent oxidoreductase  28.43 
 
 
552 aa  57  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1840  FAD dependent oxidoreductase  26.51 
 
 
573 aa  57  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.445434  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1925  monooxygenase, putative  29.11 
 
 
360 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000362928 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3588  cyclohexanone monooxygenase  26.79 
 
 
540 aa  56.6  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558327  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2934  FAD dependent oxidoreductase  27.19 
 
 
382 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0453  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.13 
 
 
445 aa  56.6  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.613143 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3872  flavin-containing monooxygenase FMO  29.27 
 
 
461 aa  56.6  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2978  FAD dependent oxidoreductase  27.19 
 
 
382 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2809  hypothetical protein  25.68 
 
 
486 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133615  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.81 
 
 
427 aa  55.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.720925  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2494  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.53 
 
 
335 aa  55.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1558  flavin-containing monooxygenase FMO  25.7 
 
 
567 aa  56.2  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228791  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1997  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.79 
 
 
367 aa  56.2  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0299073 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1351  steroid monooxygenase  26.52 
 
 
541 aa  55.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.881234  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2960  PNDR family (class II) oxidoreductase  25.93 
 
 
439 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184613  normal  0.426235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2072  putative fusion protein  27.75 
 
 
884 aa  56.2  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.987766  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4167  flavin-containing monooxygenase  26.64 
 
 
480 aa  55.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2949  FAD dependent oxidoreductase  26.5 
 
 
382 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.831286  normal  0.472558 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0647  flavin-containing monooxygenase FMO  28.23 
 
 
460 aa  55.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0541  hypothetical protein  24.89 
 
 
558 aa  55.1  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.9586 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3025  glutathione-disulfide reductase  23.86 
 
 
451 aa  55.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2915  cyclohexanone monooxygenase  25.38 
 
 
546 aa  55.5  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.245138  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2368  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 
449 aa  54.7  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.620514  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3741  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  21.17 
 
 
361 aa  54.7  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4546  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
524 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1887  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  24.73 
 
 
377 aa  54.7  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1796  CzcD accessory protein  24.88 
 
 
347 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2883  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.61 
 
 
372 aa  54.7  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3222  potassium transport flavoprotein  27.19 
 
 
416 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2013  cyclohexanone monooxygenase  27.06 
 
 
542 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157904  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2392  glutathione reductase  23.86 
 
 
451 aa  53.9  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3006  glutathione-disulfide reductase  23.86 
 
 
451 aa  53.9  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3550  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.85 
 
 
345 aa  53.9  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2537  hypothetical protein  25 
 
 
486 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0439912  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5399  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.78 
 
 
422 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0727587  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2201  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  25.46 
 
 
439 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524602  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3573  monooxygenase, putative  25.46 
 
 
439 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2327  acetoin dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  23.55 
 
 
450 aa  53.5  0.000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0311  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 
540 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1771  hypothetical protein  26.63 
 
 
539 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  24.41 
 
 
456 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1790  hypothetical protein  26.63 
 
 
539 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.784099  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2348  FAD dependent oxidoreductase  25.46 
 
 
439 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6402  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.56 
 
 
399 aa  53.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.605553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>