51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3524 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3524  hypothetical protein  100 
 
 		 633 aa  1274    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.284733  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4122  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  53.23 
 
 		 608 aa  545  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1413  hypothetical protein  29.14 
 
 		 466 aa  112  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.451407  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2576  hypothetical protein  29.14 
 
 		 466 aa  112  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1636  hypothetical protein  29.14 
 
 		 466 aa  112  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117479  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2664  hypothetical protein  29.14 
 
 		 466 aa  112  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3175  hypothetical protein  29.14 
 
 		 466 aa  112  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.333375  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2523  hypothetical protein  29.14 
 
 		 466 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  31.12 
 
 		 474 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1184  hypothetical protein  29.67 
 
 		 465 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1955  hypothetical protein  28.18 
 
 		 470 aa  108  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0763  beta-lactamase domain-containing protein  26.2 
 
 		 455 aa  104  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2138  hypothetical protein  33.46 
 
 		 1751 aa  95.9  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3948  hypothetical protein  32.52 
 
 		 473 aa  94.7  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3468  hypothetical protein  27.52 
 
 		 467 aa  90.5  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.343102  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3249  hypothetical protein  25.93 
 
 		 467 aa  90.5  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3286  hypothetical protein  27.1 
 
 		 466 aa  85.9  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.162486 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16190  hypothetical protein  26.34 
 
 		 470 aa  84.7  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  26.42 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3307  hypothetical protein  26.37 
 
 		 471 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  24.85 
 
 		 442 aa  77.4  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  26.68 
 
 		 473 aa  77  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03231  hypothetical protein  28.33 
 
 		 464 aa  73.6  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  24.29 
 
 		 443 aa  73.6  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0771  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.96 
 
 		 481 aa  72.8  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1687  FAD dependent oxidoreductase  31.66 
 
 		 445 aa  64.3  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  0.201156 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2427  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.59 
 
 		 455 aa  63.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232176  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6633  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  28.03 
 
 		 468 aa  60.5  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1700  StAR  24.72 
 
 		 479 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.91604  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3118  hypothetical protein  25.91 
 
 		 469 aa  59.7  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412381  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4721  FAD dependent oxidoreductase  22.5 
 
 		 523 aa  58.2  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.450266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6060  hypothetical protein  25.56 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3848  hypothetical protein  25.68 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4518  FAD dependent oxidoreductase  27.57 
 
 		 485 aa  57.4  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.42013 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2371  hydroxyacylglutathione hydrolase  26 
 
 		 475 aa  56.6  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.447406  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2156  FAD dependent oxidoreductase  22.87 
 
 		 480 aa  57  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3604  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  28.09 
 
 		 460 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0606198  normal  0.410787 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3720  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  26.91 
 
 		 460 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481201  normal  0.0318368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3411  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  26.91 
 
 		 460 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574536 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2050  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  29.01 
 
 		 482 aa  52.8  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0759  hypothetical protein  28.62 
 
 		 455 aa  51.2  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0311  putative FAD-dependent oxidoreductase protein  27.12 
 
 		 478 aa  51.6  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3458  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.04 
 
 		 453 aa  51.2  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.436975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5118  hypothetical protein  25 
 
 		 444 aa  49.3  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.917814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5466  hypothetical protein  28.41 
 
 		 499 aa  49.7  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1051  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  27.17 
 
 		 474 aa  48.5  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  22.81 
 
 		 506 aa  47.8  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.77 
 
 		 883 aa  47.4  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2506  hypothetical protein  25.97 
 
 		 462 aa  45.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2487  hypothetical protein  37.5 
 
 		 477 aa  45.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00182169 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0280  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 478 aa  45.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>