87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2692 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2692  zinc carboxypeptidase family protein  100 
 
 
429 aa  897  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0016795  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3253  peptidase M14 carboxypeptidase A  52.49 
 
 
393 aa  421  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310529  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1519  peptidase M14, carboxypeptidase A  43.89 
 
 
398 aa  333  4e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1582  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.74 
 
 
405 aa  94.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00197244  normal  0.432396 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2149  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.67 
 
 
374 aa  74.7  3e-12  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.385121  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2257  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.75 
 
 
375 aa  72  2e-11  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  3.28738e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2315  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.18 
 
 
375 aa  68.9  2e-10  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  5.68724e-06  hitchhiker  0.00110139 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1905  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.38 
 
 
376 aa  68.9  2e-10  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11613  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3575  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.46 
 
 
383 aa  68.9  2e-10  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.577581  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1719  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  30.07 
 
 
375 aa  67.8  3e-10  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127578  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2295  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.15 
 
 
375 aa  67.4  5e-10  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00080179  normal  0.434754 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1641  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.84 
 
 
375 aa  65.5  2e-09  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3113  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.37 
 
 
380 aa  64.7  3e-09  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2073  peptidase M14 carboxypeptidase A  35.05 
 
 
384 aa  64.3  4e-09  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.378615  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3278  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.52 
 
 
376 aa  63.9  5e-09  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.546138  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1964  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.05 
 
 
382 aa  63.9  5e-09  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0593717 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1804  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.37 
 
 
382 aa  62.8  1e-08  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0544452  normal  0.0731495 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2424  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  24.35 
 
 
375 aa  62.8  1e-08  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0741  hypothetical protein  23.02 
 
 
463 aa  63.2  1e-08  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.849095  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.19 
 
 
606 aa  62  2e-08  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2160  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.28 
 
 
379 aa  62  2e-08  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.746604  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2073  peptidase M14, carboxypeptidase A  37.89 
 
 
375 aa  62  2e-08  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0474309  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1905  peptidase M14, carboxypeptidase A  37.89 
 
 
375 aa  62  2e-08  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00901911  hitchhiker  1.23678e-05 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01259  predicted carboxypeptidase, Zn dependent  23.93 
 
 
379 aa  61.6  2e-08  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59847  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.19 
 
 
606 aa  62.4  2e-08  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1960  peptidase M14, carboxypeptidase A  37.89 
 
 
375 aa  62  2e-08  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.240759  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2832  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.23 
 
 
369 aa  61.6  2e-08  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2163  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.62 
 
 
381 aa  62  2e-08  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.304741  normal  0.191747 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2300  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.34 
 
 
375 aa  61.2  3e-08  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000207192  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1839  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.11 
 
 
381 aa  61.2  3e-08  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.419157  normal  0.0171769 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1465  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.21 
 
 
376 aa  60.8  4e-08  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000868597  normal  0.0173526 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3024  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.58 
 
 
378 aa  61.2  4e-08  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0863993  normal  0.0499845 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2051  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.34 
 
 
375 aa  60.8  4e-08  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.888658  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0268  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.65 
 
 
375 aa  61.2  4e-08  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2415  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.34 
 
 
375 aa  61.2  4e-08  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.258482  hitchhiker  0.000158665 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1937  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.35 
 
 
375 aa  60.5  5e-08  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.568911  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2047  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.34 
 
 
375 aa  60.5  5e-08  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  hitchhiker  7.23635e-11 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2558  zinc carboxypeptidase family protein  22.98 
 
 
380 aa  60.5  5e-08  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.1 
 
 
506 aa  60.8  5e-08  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1231  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.17 
 
 
378 aa  60.1  8e-08  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.601484 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27470  putative zinc carboxypeptidase  23.61 
 
 
375 aa  59.7  9e-08  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152383  normal  0.163866 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2324  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  26.67 
 
 
375 aa  59.3  1e-07  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2364  hypothetical protein  23.28 
 
 
382 aa  58.9  2e-07  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0816102  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3331  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.73 
 
 
382 aa  58.9  2e-07  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1942  peptidase M14, carboxypeptidase A  35.79 
 
 
375 aa  58.9  2e-07  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  36.36 
 
 
618 aa  57.8  3e-07  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2008  hypothetical protein  23.38 
 
 
381 aa  57.8  3e-07  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0949497 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04891  zinc-carboxypeptidase  21.99 
 
 
400 aa  57.8  4e-07  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2804  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.46 
 
 
384 aa  57.4  5e-07  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3662  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.41 
 
 
383 aa  57  6e-07  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  1.73445e-07  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000756  zinc carboxypeptidase domain protein  32.98 
 
 
374 aa  56.6  9e-07  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  3.14112e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1240  peptidase M14, carboxypeptidase A  32 
 
 
379 aa  54.3  4e-06  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.398831  normal  0.291375 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1331  zinc carboxypeptidase family protein  23.65 
 
 
384 aa  53.5  7e-06  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1468  peptidase  23.65 
 
 
384 aa  53.5  7e-06  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000305268  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1322  zinc carboxypeptidase family protein  23.24 
 
 
384 aa  53.1  9e-06  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111007  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1162  zinc carboxypeptidase family protein  23.24 
 
 
384 aa  53.1  9e-06  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000370841  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0707  zinc carboxypeptidase family protein  23.24 
 
 
384 aa  53.1  9e-06  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0445  zinc carboxypeptidase family protein  23.24 
 
 
384 aa  53.1  9e-06  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.884358  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1798  hypothetical protein  23.24 
 
 
384 aa  53.1  9e-06  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117776  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5550  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.39 
 
 
384 aa  52.8  1e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400192  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2139  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.41 
 
 
384 aa  52.8  1e-05  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  normal  0.791166 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2246  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.13 
 
 
384 aa  52.8  1e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.222943  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0979  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.81 
 
 
380 aa  52.4  1e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268801  normal  0.0514044 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1610  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.39 
 
 
384 aa  52.8  1e-05  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2260  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.41 
 
 
384 aa  52.8  1e-05  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2222  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.39 
 
 
384 aa  52.8  1e-05  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1055  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.39 
 
 
384 aa  51.6  2e-05  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0387993  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1906  hypothetical protein  33.02 
 
 
351 aa  52.4  2e-05  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0666  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.03 
 
 
361 aa  51.6  3e-05  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0079  zinc carboxypeptidase  34.57 
 
 
374 aa  51.6  3e-05  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1091  zinc carboxypeptidase family protein  31.37 
 
 
384 aa  51.2  3e-05  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175299  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1978  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.82 
 
 
388 aa  51.2  3e-05  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.228376  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1376  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.36 
 
 
384 aa  49.7  9e-05  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1015  peptidase M14, carboxypeptidase A  20.81 
 
 
380 aa  49.7  9e-05  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3179  zinc carboxypeptidase  27.36 
 
 
384 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129073  normal  0.290427 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.41 
 
 
615 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  35.78 
 
 
500 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3043  hypothetical protein  27.66 
 
 
490 aa  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0217728 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  32.03 
 
 
821 aa  47.8  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1338  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.88 
 
 
375 aa  45.8  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.412426  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  38.54 
 
 
453 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2589  hypothetical protein  32.97 
 
 
392 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0393538  normal  0.0858047 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.12 
 
 
262 aa  45.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.43 
 
 
599 aa  44.3  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3295  putative carboxypeptidase  28.7 
 
 
365 aa  43.9  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.265399 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3879  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.49 
 
 
422 aa  43.5  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49091  predicted protein  29.7 
 
 
459 aa  43.1  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>