70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1185 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1185  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  418  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  5.12351e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1372  hypothetical protein  99.53 
 
 
214 aa  416  1e-115  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  7.43481e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0753  hypothetical protein  31.34 
 
 
306 aa  95.5  5e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2378  protein of unknown function DUF161  31.22 
 
 
224 aa  86.3  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.793983  normal  0.5891 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00750  predicted membrane protein  30.05 
 
 
234 aa  82  7e-15  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0973  hypothetical protein  27.23 
 
 
216 aa  73.9  2e-12  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0948172  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2500  protein of unknown function DUF161  26.57 
 
 
218 aa  72  6e-12  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2950  permease  26.09 
 
 
221 aa  71.2  1e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2368  protein of unknown function DUF161  27.78 
 
 
287 aa  71.2  1e-11  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1136  hypothetical protein  25.71 
 
 
243 aa  70.9  1e-11  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.439117  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2249  protein of unknown function DUF161  28.64 
 
 
228 aa  70.9  1e-11  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  5.34674e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4143  protein of unknown function DUF161  30 
 
 
213 aa  70.5  2e-11  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.663095 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0727  hypothetical protein  25.84 
 
 
208 aa  70.5  2e-11  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.06569e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3262  hypothetical protein  26.09 
 
 
221 aa  70.5  2e-11  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3029  hypothetical protein  26.09 
 
 
221 aa  70.5  2e-11  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.491738  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3273  hypothetical protein  26.57 
 
 
221 aa  70.5  2e-11  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.134593  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3250  hypothetical protein  25.6 
 
 
222 aa  69.3  4e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3280  hypothetical protein  26.9 
 
 
221 aa  69.3  5e-11  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0926  hypothetical protein  27.23 
 
 
203 aa  68.6  6e-11  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.136693  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3925  protein of unknown function DUF161  24.62 
 
 
256 aa  68.6  6e-11  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5957  hypothetical protein  28.65 
 
 
206 aa  68.2  8e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150833  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2000  hypothetical protein  25.6 
 
 
221 aa  68.2  9e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6791  protein of unknown function DUF161  28.14 
 
 
209 aa  66.6  3e-10  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.894738  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0749  protein of unknown function DUF161  26.56 
 
 
234 aa  62.8  4e-09  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.48923 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4947  hypothetical protein  24.47 
 
 
225 aa  62.4  5e-09  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.89075  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4274  hypothetical protein  26.74 
 
 
295 aa  61.2  1e-08  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.734202  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3513  hypothetical protein  27.47 
 
 
214 aa  59.7  3e-08  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.137007  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0425  protein of unknown function DUF161  27.46 
 
 
249 aa  58.2  1e-07  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21650  predicted membrane protein  24.08 
 
 
238 aa  57.8  1e-07  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0140026  normal  0.0791748 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0798  protein of unknown function DUF161  23.91 
 
 
213 aa  57  2e-07  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.12912  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2092  protein of unknown function DUF161  25.75 
 
 
214 aa  57.4  2e-07  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236342  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1455  hypothetical protein  27.78 
 
 
212 aa  56.6  2e-07  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  2.1666e-07 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1407  protein of unknown function DUF161  27.89 
 
 
244 aa  57  2e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.593971 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2701  hypothetical protein  19.72 
 
 
227 aa  55.8  4e-07  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0546999 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3776  hypothetical protein  26.37 
 
 
214 aa  55.8  4e-07  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.307192  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3589  hypothetical protein  26.67 
 
 
212 aa  55.5  6e-07  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3489  permease  26.67 
 
 
212 aa  55.5  6e-07  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.487539  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3873  hypothetical protein  26.67 
 
 
212 aa  55.5  6e-07  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3343  protein of unknown function DUF161  24.23 
 
 
219 aa  55.5  6e-07  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.601494  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3755  hypothetical protein  26.67 
 
 
212 aa  55.5  7e-07  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.25243e-12 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1836  hypothetical protein  28.32 
 
 
226 aa  55.1  8e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1855  hypothetical protein  28.32 
 
 
226 aa  55.1  8e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1902  hypothetical protein  28.32 
 
 
226 aa  55.1  8e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.58543  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3501  hypothetical protein  26.67 
 
 
212 aa  54.7  9e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0621  hypothetical protein  26.94 
 
 
220 aa  54.7  1e-06  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3792  hypothetical protein  26.82 
 
 
212 aa  53.9  2e-06  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1346  hypothetical protein  25.25 
 
 
224 aa  52.8  4e-06  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5101  permease  25.49 
 
 
208 aa  52.4  5e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239708  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5196  hypothetical protein  25.49 
 
 
208 aa  52  6e-06  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0225091  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2024  protein of unknown function DUF161  22.86 
 
 
217 aa  51.2  1e-05  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.056298  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5425  hypothetical protein  25 
 
 
208 aa  50.8  1e-05  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0316019  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0290  hypothetical protein  27.27 
 
 
211 aa  51.2  1e-05  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.725518  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3825  protein of unknown function DUF161  20.57 
 
 
258 aa  50.4  2e-05  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5582  hypothetical protein  25 
 
 
208 aa  50.8  2e-05  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00443539  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5526  hypothetical protein  25 
 
 
208 aa  50.4  2e-05  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1382  protein of unknown function DUF161  22.87 
 
 
222 aa  50.1  3e-05  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.2123e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5084  permease  25.13 
 
 
208 aa  49.7  3e-05  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.78472e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3500  hypothetical protein  22.73 
 
 
225 aa  49.3  5e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.850537  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5532  hypothetical protein  25.25 
 
 
208 aa  48.9  6e-05  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277764  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3411  hypothetical protein  28.12 
 
 
218 aa  48.1  9e-05  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00640834 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0018  hypothetical protein  22 
 
 
225 aa  48.1  9e-05  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3185  hypothetical protein  28.12 
 
 
218 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.652164 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1048  hypothetical protein  22.97 
 
 
215 aa  47.8  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.864097 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1765  hypothetical protein  24.65 
 
 
214 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0161759 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02390  predicted membrane protein  35.82 
 
 
209 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.572815 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1768  hypothetical protein  22.28 
 
 
202 aa  45.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0547207  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5255  hypothetical protein  25 
 
 
208 aa  45.4  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5653  hypothetical protein  25 
 
 
208 aa  45.4  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5498  hypothetical protein  25 
 
 
208 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0394  hypothetical protein  25.49 
 
 
212 aa  45.4  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.625345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>