More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0779 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0779  iron compound ABC transporter, permease protein  100 
 
 
334 aa  650    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100059  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0671  iron compound ABC transporter, permease protein  43.37 
 
 
334 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1714100000000002e-34 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0582  iron compound ABC transporter permease  43.37 
 
 
340 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000513454  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0526  iron compound ABC transporter, permease  43.37 
 
 
340 aa  267  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.8853300000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0616  iron compound ABC transporter permease protein  43.37 
 
 
334 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222704  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0744  iron compound ABC transporter, permease protein  43.67 
 
 
334 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0526  iron compound ABC transporter, permease  43.07 
 
 
340 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247023  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0530  transport system permease protein  42.3 
 
 
334 aa  262  6e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00110825  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0653  iron compound ABC transporter, permease protein  41.99 
 
 
334 aa  259  4e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000463622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0684  iron compound ABC transporter, permease protein  42.17 
 
 
334 aa  257  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4684  iron compound ABC transporter, permease protein  41.99 
 
 
334 aa  257  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.055956  hitchhiker  3.06185e-21 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1986  transport system permease protein  42.62 
 
 
333 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2265  transport system permease protein  38.41 
 
 
333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3086  transport system permease protein  42.67 
 
 
322 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344068  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3035  transport system permease protein  42.67 
 
 
322 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0464  transport system permease protein  41.32 
 
 
336 aa  237  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1524  transport system permease protein  40.85 
 
 
329 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0331  transport system permease protein  39.14 
 
 
334 aa  218  7.999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2939  transport system permease protein  38.89 
 
 
329 aa  218  8.999999999999998e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5748  transport system permease protein  41.04 
 
 
337 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5336  transport system permease protein  38.24 
 
 
347 aa  213  4.9999999999999996e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  35.54 
 
 
343 aa  212  7.999999999999999e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  39.18 
 
 
347 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2435  transport system permease protein  38.14 
 
 
340 aa  205  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  unclonable  0.00000000058625 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5561  iron compound ABC transporter, permease protein  38.61 
 
 
351 aa  205  8e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2669  transport system permease protein  35.37 
 
 
340 aa  205  9e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5512  iron compound ABC transporter, permease protein  38.29 
 
 
351 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5063  ferrichrome ABC transporter, permease  38.29 
 
 
351 aa  204  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5080  ferrichrome transport system, permease  38.29 
 
 
351 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5475  iron compound ABC transporter, permease protein  38.29 
 
 
351 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5176  transport system permease protein  38.29 
 
 
351 aa  204  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5506  iron compound ABC transporter, permease protein  37.97 
 
 
351 aa  202  5e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5445  iron compound ABC transporter, permease protein  38.31 
 
 
351 aa  202  6e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3504  iron compound ABC transporter, permease protein  35.93 
 
 
344 aa  202  8e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02570  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  38.08 
 
 
351 aa  199  3.9999999999999996e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.103691  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3487  iron compound ABC transporter, permease protein  36.94 
 
 
344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000659381  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3904  transport system permease protein  37.97 
 
 
350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1774  iron compound ABC transporter, permease protein  35.93 
 
 
344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000671836  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3190  ferrichrome transport system permease  36.23 
 
 
344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000029437  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7986  ABC transporter, permease, Fe3+-siderophore transport system  34.97 
 
 
350 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121274  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2438  transport system permease protein  36.72 
 
 
363 aa  196  5.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0761977  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0101  transport system permease protein  37.74 
 
 
331 aa  196  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000423595  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0105  transport system permease protein  37.74 
 
 
331 aa  196  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1968  transport system permease protein  37.5 
 
 
349 aa  196  6e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000115433  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3277  iron compound ABC transporter permease  36.23 
 
 
344 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446459  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3247  ferrichrome transport system permease  36.23 
 
 
344 aa  195  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.1926e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3534  iron compound ABC transporter permease protein  36.23 
 
 
344 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.351837  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3494  iron(III) dicitrate transport system permease  39.23 
 
 
335 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3187  transport system permease protein  35.93 
 
 
344 aa  193  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.117806  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2408  transport system permease protein  38.81 
 
 
335 aa  193  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436362  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0414  transport system permease protein  40.39 
 
 
335 aa  193  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3786  iron compound ABC transporter, permease protein  39.23 
 
 
335 aa  192  6e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.223523  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2013  transport system permease protein  39.6 
 
 
343 aa  192  6e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0139655  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3770  iron compound ABC transporter, permease protein  38.59 
 
 
335 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3482  iron(III) dicitrate transport system, permease  38.59 
 
 
335 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155404  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3748  iron compound ABC transporter, permease protein  38.59 
 
 
335 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000332198 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3491  iron compound ABC transporter, permease protein  37.16 
 
 
298 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3582  iron compound ABC transporter permease  37.62 
 
 
335 aa  189  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3866  iron compound ABC transporter permease protein  37.62 
 
 
335 aa  189  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1042  transport system permease protein  39.09 
 
 
335 aa  189  5.999999999999999e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3474  iron compound ABC transporter, permease protein  35.93 
 
 
344 aa  188  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.712456  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4083  transport system permease protein  33.54 
 
 
335 aa  186  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00175195  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2245  transport system permease protein  36.17 
 
 
343 aa  186  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.148994  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2207  transport system permease protein  36.17 
 
 
343 aa  186  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.748712  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37320  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  33.43 
 
 
374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0808  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuB  36.27 
 
 
337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0671  cell wall anchor domain-containing protein  33.93 
 
 
334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0686  cell wall anchor domain-containing protein  33.93 
 
 
334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0795  iron compound ABC transporter, permease protein  35.95 
 
 
337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0863815  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3505  transport system permease protein  39.23 
 
 
335 aa  184  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1463  iron compound ABC transporter, permease protein  39.23 
 
 
335 aa  183  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000336086 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2492  transport system permease protein  39.36 
 
 
340 aa  183  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.3582 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4295  transport system permease protein  37.84 
 
 
347 aa  183  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1326  transport system permease protein  33.8 
 
 
358 aa  182  7e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0395439  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3836  iron compound ABC transporter, permease protein  38.46 
 
 
335 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1241  transport system permease protein  35.49 
 
 
353 aa  182  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00596239  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0214  iron chelate ABC transporter permease protein  35.45 
 
 
328 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3467  transport system permease protein  37.59 
 
 
341 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743348  hitchhiker  0.00246309 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7290  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  38.71 
 
 
342 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06008  hypothetical protein  37.05 
 
 
338 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  35.1 
 
 
326 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1283  transport system permease protein  36.7 
 
 
358 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.679975  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4231  ferric vibriobactin ABC transporter permease protein  35.92 
 
 
344 aa  179  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866695  normal  0.0198027 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2591  transport system permease protein  35.97 
 
 
329 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.35861  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2423  transport system permease protein  35.87 
 
 
347 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00075804  normal  0.0291277 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001070  ferrichrome ABC transporter (permease) PvuC  37.84 
 
 
307 aa  177  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  35.65 
 
 
353 aa  175  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0213  putative ferrichrome ABC transporter permease  37.54 
 
 
328 aa  175  8e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3424  iron-enterobactin transporter membrane protein  35.12 
 
 
357 aa  175  9e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.320644  normal  0.302372 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3637  transport system permease protein  38.26 
 
 
340 aa  175  9e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  normal  0.0127485 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0762  iron(III) dicitrate transport system, permease protein FecC  36.61 
 
 
324 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0666  iron-dicitrate transporter permease subunit  35.93 
 
 
324 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.978539 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2756  transport system permease protein  32.28 
 
 
325 aa  175  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.987202  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1497  transport system permease protein  34.06 
 
 
348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0836152  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0551  transport system permease protein  32.15 
 
 
332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1623  transport system permease protein  35.35 
 
 
354 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0644  transport system permease protein  32.25 
 
 
342 aa  172  5.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4040  transport system permease protein  36.65 
 
 
344 aa  172  7.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36340  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  35.35 
 
 
368 aa  171  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  34.17 
 
 
370 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>