More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1042 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1042  transport system permease protein  100 
 
 
335 aa  644    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1524  transport system permease protein  54.26 
 
 
329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2939  transport system permease protein  54.75 
 
 
329 aa  310  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0464  transport system permease protein  48.06 
 
 
336 aa  288  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1986  transport system permease protein  46.97 
 
 
333 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2669  transport system permease protein  53 
 
 
340 aa  281  9e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2265  transport system permease protein  50.16 
 
 
333 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0744  iron compound ABC transporter, permease protein  45.02 
 
 
334 aa  278  7e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0616  iron compound ABC transporter permease protein  45.02 
 
 
334 aa  278  9e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222704  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0582  iron compound ABC transporter permease  45.02 
 
 
340 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000513454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0526  iron compound ABC transporter, permease  45.02 
 
 
340 aa  277  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0671  iron compound ABC transporter, permease protein  45.02 
 
 
334 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1714100000000002e-34 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0526  iron compound ABC transporter, permease  44.71 
 
 
340 aa  276  5e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.8853300000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0530  transport system permease protein  45.92 
 
 
334 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00110825  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0684  iron compound ABC transporter, permease protein  45.32 
 
 
334 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0653  iron compound ABC transporter, permease protein  45.32 
 
 
334 aa  267  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000463622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4684  iron compound ABC transporter, permease protein  45.9 
 
 
334 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.055956  hitchhiker  3.06185e-21 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  46.25 
 
 
347 aa  261  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2591  transport system permease protein  47.63 
 
 
329 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.35861  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3086  transport system permease protein  48.38 
 
 
322 aa  258  7e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344068  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3035  transport system permease protein  48.38 
 
 
322 aa  258  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0331  transport system permease protein  43.71 
 
 
334 aa  230  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0779  iron compound ABC transporter, permease protein  39.09 
 
 
334 aa  226  4e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100059  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2013  transport system permease protein  48.22 
 
 
343 aa  225  7e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0139655  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02570  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  41.37 
 
 
351 aa  225  9e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.103691  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2435  transport system permease protein  43.73 
 
 
340 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  unclonable  0.00000000058625 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5748  transport system permease protein  44.66 
 
 
337 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0414  transport system permease protein  47.74 
 
 
335 aa  218  8.999999999999998e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1968  transport system permease protein  40.49 
 
 
349 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000115433  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7986  ABC transporter, permease, Fe3+-siderophore transport system  39.69 
 
 
350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121274  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0105  transport system permease protein  39.35 
 
 
331 aa  213  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0101  transport system permease protein  39.35 
 
 
331 aa  213  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000423595  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06008  hypothetical protein  43.27 
 
 
338 aa  212  7.999999999999999e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7290  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  44.12 
 
 
342 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3904  transport system permease protein  37.46 
 
 
350 aa  210  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5445  iron compound ABC transporter, permease protein  37.15 
 
 
351 aa  209  6e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5176  transport system permease protein  36.84 
 
 
351 aa  209  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5506  iron compound ABC transporter, permease protein  36.84 
 
 
351 aa  209  7e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5512  iron compound ABC transporter, permease protein  36.84 
 
 
351 aa  207  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2826  transport system permease protein  43.32 
 
 
347 aa  208  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5063  ferrichrome ABC transporter, permease  36.84 
 
 
351 aa  208  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5080  ferrichrome transport system, permease  36.84 
 
 
351 aa  208  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5475  iron compound ABC transporter, permease protein  36.84 
 
 
351 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3637  transport system permease protein  41.21 
 
 
340 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  normal  0.0127485 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5561  iron compound ABC transporter, permease protein  36.53 
 
 
351 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3467  transport system permease protein  39.8 
 
 
341 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743348  hitchhiker  0.00246309 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0686  cell wall anchor domain-containing protein  37.46 
 
 
334 aa  205  9e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0671  cell wall anchor domain-containing protein  37.46 
 
 
334 aa  205  9e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0551  transport system permease protein  41.72 
 
 
332 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0338  ABC-type Fe3+-siderophore transport system inner membrane subunit  41.25 
 
 
366 aa  203  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552236  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36340  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  40.78 
 
 
368 aa  203  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0692  transport system permease protein  41.53 
 
 
333 aa  203  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0425  transport system permease protein  38.14 
 
 
335 aa  202  5e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.639871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5336  transport system permease protein  40.58 
 
 
347 aa  202  8e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4231  ferric vibriobactin ABC transporter permease protein  41.24 
 
 
344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866695  normal  0.0198027 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4295  transport system permease protein  41.37 
 
 
347 aa  200  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2492  transport system permease protein  40.2 
 
 
340 aa  199  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.3582 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1623  transport system permease protein  40.96 
 
 
354 aa  199  6e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2415  transport system permease protein  41.85 
 
 
333 aa  199  7.999999999999999e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001070  ferrichrome ABC transporter (permease) PvuC  43.3 
 
 
307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3190  ferrichrome transport system permease  38.24 
 
 
344 aa  196  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000029437  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1774  iron compound ABC transporter, permease protein  37.97 
 
 
344 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000671836  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3487  iron compound ABC transporter, permease protein  37.97 
 
 
344 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000659381  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3277  iron compound ABC transporter permease  38.24 
 
 
344 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446459  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3247  ferrichrome transport system permease  38.24 
 
 
344 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.1926e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3534  iron compound ABC transporter permease protein  38.24 
 
 
344 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.351837  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19090  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  42.81 
 
 
355 aa  196  5.000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0971068 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  37.36 
 
 
338 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  37.36 
 
 
338 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  37.36 
 
 
338 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  37.36 
 
 
338 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  37.36 
 
 
338 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3504  iron compound ABC transporter, permease protein  37.66 
 
 
344 aa  195  9e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2357  iron compound ABC transporter, permease protein  35.87 
 
 
327 aa  194  1e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3491  iron compound ABC transporter, permease protein  38.98 
 
 
298 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3187  transport system permease protein  38.24 
 
 
344 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.117806  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1241  transport system permease protein  38.61 
 
 
353 aa  193  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00596239  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37320  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  38.28 
 
 
374 aa  193  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  37.07 
 
 
338 aa  192  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2423  transport system permease protein  40.94 
 
 
347 aa  192  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00075804  normal  0.0291277 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  36.78 
 
 
338 aa  192  8e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1326  transport system permease protein  39.21 
 
 
358 aa  192  8e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0395439  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  36.51 
 
 
326 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  36.78 
 
 
338 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3770  iron compound ABC transporter, permease protein  35.85 
 
 
335 aa  190  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3482  iron(III) dicitrate transport system, permease  36.16 
 
 
335 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155404  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3494  iron(III) dicitrate transport system permease  35.53 
 
 
335 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  36.78 
 
 
338 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3748  iron compound ABC transporter, permease protein  36.16 
 
 
335 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000332198 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  36.17 
 
 
337 aa  190  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4083  transport system permease protein  38.11 
 
 
335 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00175195  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0356  transport system permease protein  41.56 
 
 
353 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3474  iron compound ABC transporter, permease protein  37.66 
 
 
344 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.712456  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3582  iron compound ABC transporter permease  36.16 
 
 
335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3866  iron compound ABC transporter permease protein  36.16 
 
 
335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2756  transport system permease protein  40 
 
 
325 aa  189  4e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.987202  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  35.87 
 
 
337 aa  189  5e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3786  iron compound ABC transporter, permease protein  35.22 
 
 
335 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.223523  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  32.02 
 
 
343 aa  189  7e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4040  transport system permease protein  38.13 
 
 
344 aa  189  8e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>