More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1720 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1720  aminotransferase, class V  100 
 
 		 428 aa  863    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116446  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1448  aminotransferase, class V  96.5 
 
 		 428 aa  838    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2844  cysteine desulfurase  44.76 
 
 		 460 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0811  Cysteine desulfurase  42.4 
 
 		 452 aa  362  5.0000000000000005e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20010  Cysteine desulfurase  42.08 
 
 		 442 aa  358  9.999999999999999e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000584034  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2429  cysteine desulfurase  41.96 
 
 		 470 aa  328  1.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2656  Cysteine desulfurase  34.24 
 
 		 501 aa  263  3e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.596375  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0783  Cysteine desulfurase  31.48 
 
 		 484 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9167  Cysteine desulfurase  34.05 
 
 		 433 aa  230  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2389  Cysteine desulfurase  33.09 
 
 		 472 aa  230  5e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000376862 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0201  aminotransferase, class V  33.25 
 
 		 485 aa  227  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35010  selenocysteine lyase  32.23 
 
 		 482 aa  223  4e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5990  Cysteine desulfurase  31.67 
 
 		 467 aa  223  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.122747 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.93 
 
 		 412 aa  223  7e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2656  cysteine desulfurase  32.22 
 
 		 470 aa  222  8e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0546  Cysteine desulfurase  33.17 
 
 		 429 aa  220  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3439  cysteine desulfurase  31.97 
 
 		 457 aa  220  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2942  Cysteine desulfurase  29.23 
 
 		 480 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  33.58 
 
 		 885 aa  216  7e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3438  cysteine desulfurase  33.09 
 
 		 445 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4922  cysteine desulfurase  27.78 
 
 		 518 aa  213  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.25 
 
 		 415 aa  212  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.33 
 
 		 406 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5748  aminotransferase class V  31.07 
 
 		 452 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.380552  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1896  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33.33 
 
 		 406 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554851  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.33 
 
 		 406 aa  211  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33.33 
 
 		 406 aa  211  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33.33 
 
 		 406 aa  209  7e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0847  aminotransferase class V  30.68 
 
 		 449 aa  209  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.17 
 
 		 418 aa  208  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.17 
 
 		 418 aa  208  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2391  Cysteine desulfurase  31.64 
 
 		 478 aa  206  7e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.855835 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  33.08 
 
 		 406 aa  206  9e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33.08 
 
 		 406 aa  206  9e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  33.08 
 
 		 406 aa  206  9e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0275  aminotransferase, class V  33.51 
 
 		 414 aa  206  9e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0252691 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.62 
 
 		 409 aa  205  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0508  Cysteine desulfurase  30.39 
 
 		 487 aa  205  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  33.95 
 
 		 406 aa  205  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0273  aminotransferase class V  31.25 
 
 		 439 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  31.34 
 
 		 408 aa  205  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.42 
 
 		 426 aa  204  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.2 
 
 		 414 aa  203  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  32.84 
 
 		 406 aa  203  5e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.53 
 
 		 413 aa  203  6e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.53 
 
 		 413 aa  203  6e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.4 
 
 		 413 aa  202  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  31.02 
 
 		 393 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.08 
 
 		 444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0318  cysteine desulfurase  32.75 
 
 		 414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159519  hitchhiker  0.000213792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.75 
 
 		 415 aa  201  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.29 
 
 		 414 aa  201  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  32.32 
 
 		 880 aa  199  7e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  32.42 
 
 		 406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  31.16 
 
 		 421 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  32.2 
 
 		 417 aa  198  1.0000000000000001e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  32.42 
 
 		 406 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  32.42 
 
 		 406 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.92 
 
 		 413 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.79 
 
 		 408 aa  197  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0935  aminotransferase class V  29.2 
 
 		 448 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239367  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.89 
 
 		 435 aa  197  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  32.42 
 
 		 406 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.9 
 
 		 417 aa  197  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  30.8 
 
 		 406 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  30.8 
 
 		 406 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  32.41 
 
 		 420 aa  196  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  32.41 
 
 		 406 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  31.16 
 
 		 414 aa  196  5.000000000000001e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.54 
 
 		 412 aa  196  6e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.77 
 
 		 414 aa  196  6e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0268  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.76 
 
 		 399 aa  196  6e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.88 
 
 		 418 aa  196  6e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  32.11 
 
 		 406 aa  196  6e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  30.8 
 
 		 406 aa  196  6e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  32.75 
 
 		 879 aa  196  6e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.25 
 
 		 406 aa  195  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.75 
 
 		 415 aa  195  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.43 
 
 		 429 aa  195  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  31.49 
 
 		 404 aa  194  2e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  31.03 
 
 		 406 aa  195  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  31.03 
 
 		 406 aa  195  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  31.03 
 
 		 406 aa  195  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1293  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.4 
 
 		 441 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000571182 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.8 
 
 		 406 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  30.57 
 
 		 406 aa  194  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.22 
 
 		 412 aa  194  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  30.57 
 
 		 406 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.14 
 
 		 428 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.42 
 
 		 678 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.14 
 
 		 415 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.8 
 
 		 406 aa  193  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.03 
 
 		 406 aa  193  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3118  Cysteine desulfurase  29.79 
 
 		 476 aa  193  5e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  31.03 
 
 		 406 aa  193  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  31.74 
 
 		 394 aa  192  7e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.61 
 
 		 420 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  29.93 
 
 		 410 aa  192  7e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0726  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.28 
 
 		 416 aa  192  9e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  30.17 
 
 		 415 aa  192  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>