154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0039 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0039  30S ribosomal protein S21  100 
 
 
70 aa  141  4e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0122  30S ribosomal protein S21  94.29 
 
 
70 aa  135  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1544  30S ribosomal protein S21  91.43 
 
 
70 aa  132  1e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.27547  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0419  30S ribosomal protein S21  92.86 
 
 
70 aa  133  1e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.723054  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0393  30S ribosomal protein S21  92.86 
 
 
70 aa  133  1e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1587  30S ribosomal protein S21  92.86 
 
 
70 aa  133  1e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1556  30S ribosomal protein S21  91.43 
 
 
74 aa  131  3e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0087  ribosomal protein S21  81.43 
 
 
70 aa  116  9e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00102133  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0022  30S ribosomal protein S21  68.57 
 
 
70 aa  97.1  9e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1237  30S ribosomal protein S21  45 
 
 
71 aa  52.4  2e-06  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.916672  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0313  ribosomal protein S21  45 
 
 
71 aa  51.6  3e-06  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00659412  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1016  30S ribosomal protein S21  42.37 
 
 
65 aa  52  3e-06  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.403205  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3017  30S ribosomal protein S21  45 
 
 
71 aa  52  3e-06  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161962  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3053  30S ribosomal protein S21  44.07 
 
 
65 aa  51.2  4e-06  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0062932  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3093  30S ribosomal protein S21  42.37 
 
 
65 aa  50.8  6e-06  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0550  30S ribosomal protein S21  48.33 
 
 
71 aa  49.7  1e-05  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  2.76369e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1098  30S ribosomal protein S21  40 
 
 
71 aa  50.1  1e-05  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3487  30S ribosomal protein S21  48.33 
 
 
71 aa  49.7  1e-05  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3469  30S ribosomal protein S21  48.33 
 
 
71 aa  49.7  1e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  7.63372e-06  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02885  hypothetical protein  48.33 
 
 
71 aa  49.7  1e-05  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  3.39059e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4377  30S ribosomal protein S21  48.33 
 
 
71 aa  49.7  1e-05  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  2.54067e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3565  30S ribosomal protein S21  48.33 
 
 
71 aa  49.7  1e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  4.76189e-06  normal  0.236523 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3395  30S ribosomal protein S21  48.33 
 
 
71 aa  49.7  1e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.00201e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3368  30S ribosomal protein S21  48.33 
 
 
71 aa  49.7  1e-05  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  2.85201e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3399  30S ribosomal protein S21  48.33 
 
 
71 aa  49.7  1e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  1.23882e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3463  30S ribosomal protein S21  48.33 
 
 
71 aa  49.7  1e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  2.48235e-05  normal  0.0117511 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3499  30S ribosomal protein S21  48.33 
 
 
71 aa  49.7  1e-05  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.79306e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0635  ribosomal protein S21  48.33 
 
 
71 aa  49.7  1e-05  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.12914e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0636  30S ribosomal protein S21  48.33 
 
 
71 aa  49.7  1e-05  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  1.59667e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0634  30S ribosomal protein S21  48.33 
 
 
71 aa  49.7  1e-05  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  6.14997e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0301  30S ribosomal protein S21  48.33 
 
 
71 aa  49.7  1e-05  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  9.15609e-13  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001621  SSU ribosomal protein S21p  41.67 
 
 
71 aa  49.7  1e-05  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.57507e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3358  30S ribosomal protein S21  48.33 
 
 
71 aa  49.7  1e-05  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  7.49532e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4298  30S ribosomal protein S21  48.33 
 
 
71 aa  49.7  1e-05  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0121061  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0785  30S ribosomal protein S21  48.33 
 
 
71 aa  49.7  1e-05  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  8.40421e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00851  30S ribosomal protein S21  41.67 
 
 
71 aa  49.7  1e-05  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3529  30S ribosomal protein S21  48.33 
 
 
71 aa  49.7  1e-05  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.6344e-12  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02935  30S ribosomal protein S21  48.33 
 
 
71 aa  49.7  1e-05  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  3.77875e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1809  ribosomal protein S21  45 
 
 
71 aa  49.7  1e-05  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  1.75133e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3471  30S ribosomal protein S21  48.33 
 
 
71 aa  49.7  1e-05  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  5.24554e-09  normal  0.190946 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0047  30S ribosomal protein S21  41.67 
 
 
71 aa  49.7  1e-05  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  4.27193e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0555  30S ribosomal protein S21  48.33 
 
 
71 aa  49.7  1e-05  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.0089e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3245  30S ribosomal protein S21  48.33 
 
 
71 aa  49.7  1e-05  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3627e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4639  30S ribosomal protein S21  41.67 
 
 
71 aa  48.9  2e-05  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.459831 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3944  30S ribosomal protein S21  45 
 
 
70 aa  49.3  2e-05  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1191  30S ribosomal protein S21  45 
 
 
70 aa  49.3  2e-05  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0231  30S ribosomal protein S21  41.67 
 
 
71 aa  48.9  2e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  6.08143e-06  normal  0.965473 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0539  ribosomal protein S21  41.67 
 
 
71 aa  48.9  2e-05  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0211  30S ribosomal protein S21  41.67 
 
 
71 aa  48.9  2e-05  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  1.74469e-06  hitchhiker  0.00173439 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5147  30S ribosomal protein S21  41.67 
 
 
71 aa  48.9  2e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2991  ribosomal protein S21  43.33 
 
 
77 aa  48.9  3e-05  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0529  30S ribosomal protein S21  42.86 
 
 
70 aa  48.5  3e-05  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2385  30S ribosomal protein S21  45 
 
 
70 aa  48.1  4e-05  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.66325 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1898  30S ribosomal protein S21  32.81 
 
 
66 aa  48.1  4e-05  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0497287 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0719  30S ribosomal protein S21  40 
 
 
71 aa  48.1  4e-05  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00024481  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3780  30S ribosomal protein S21  45 
 
 
70 aa  47.8  5e-05  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0792875  normal  0.0326962 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3254  30S ribosomal protein S21  45 
 
 
70 aa  47.8  5e-05  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0163212 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6777  30S ribosomal protein S21  45 
 
 
70 aa  47.8  6e-05  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.634891  hitchhiker  0.00809578 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0618  30S ribosomal protein S21  45 
 
 
71 aa  47.4  8e-05  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.141682  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2529  30S ribosomal protein S21  43.33 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0836  30S ribosomal protein S21  43.33 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2387  30S ribosomal protein S21  43.33 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.989571  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2207  30S ribosomal protein S21  43.33 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0618  30S ribosomal protein S21  43.33 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4482  30S ribosomal protein S21  43.33 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.590266  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4816  30S ribosomal protein S21  43.33 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.56281  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3883  30S ribosomal protein S21  43.33 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0369  30S ribosomal protein S21  43.33 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0336  30S ribosomal protein S21  43.33 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2823  30S ribosomal protein S21  43.33 
 
 
70 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3644  30S ribosomal protein S21  43.33 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1517  30S ribosomal protein S21  43.33 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.975916  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0360  30S ribosomal protein S21  41.67 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  1.20281e-12  hitchhiker  0.000381464 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2519  30S ribosomal protein S21  40 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.58825 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04101  30S ribosomal protein S21  40.68 
 
 
71 aa  45.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.713135  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1931  ribosomal protein S21  38.33 
 
 
71 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1786  30S ribosomal protein S21  43.33 
 
 
70 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77604e-08 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0326  30S ribosomal protein S21  40.68 
 
 
71 aa  45.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.433894 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2093  ribosomal protein S21  42.37 
 
 
65 aa  44.7  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.320771  normal  0.211953 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2060  30S ribosomal protein S21  43.33 
 
 
70 aa  44.3  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0269  ribosomal protein S21  40.68 
 
 
71 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.34279 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2858  30S ribosomal protein S21  41.67 
 
 
70 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2347  30S ribosomal protein S21  41.67 
 
 
70 aa  44.3  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0666033  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2092  30S ribosomal protein S21  41.67 
 
 
70 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.224762  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1191  SSU ribosomal protein S21P  41.51 
 
 
57 aa  44.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.172941  normal  0.0994572 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3540  30S ribosomal protein S21  41.67 
 
 
70 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0453734  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1237  30S ribosomal protein S21  40 
 
 
70 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855036  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3284  30S ribosomal protein S21  41.67 
 
 
70 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2996  30S ribosomal protein S21  41.67 
 
 
70 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.178505  normal  0.531262 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1388  30S ribosomal protein S21  41.67 
 
 
70 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000560613  normal  0.0166741 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2280  30S ribosomal protein S21  43.1 
 
 
58 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1995  30S ribosomal protein S21  43.1 
 
 
58 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2885  30S ribosomal protein S21  41.67 
 
 
70 aa  43.9  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1804  30S ribosomal protein S21  37.29 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4813  30S ribosomal protein S21  47.62 
 
 
71 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.32458  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46980  30S ribosomal protein S21  47.62 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1736  30S ribosomal protein S21  37.29 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.688471  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1989  ribosomal protein S21  41.82 
 
 
60 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0732671  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0170  30S ribosomal protein S21  36.67 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1162  ribosomal protein S21  41.38 
 
 
60 aa  42.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>